146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2133 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2133  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  790    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.764598  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2408  cupin 4 family protein  54.59 
 
 		 380 aa  437  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0501658  hitchhiker  0.000275258 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2004  Cupin 4 family protein  55.17 
 
 		 385 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.367195  hitchhiker  0.0000511749 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2354  cupin 4 family protein  54.91 
 
 		 385 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2343  cupin 4 family protein  54.91 
 
 		 385 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2459  cupin 4 family protein  54.91 
 
 		 385 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.378112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2199  cupin 4 family protein  51.97 
 
 		 381 aa  427  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00219592  hitchhiker  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2000  cupin 4 family protein  51.32 
 
 		 381 aa  424  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1908  cupin 4 family protein  53.97 
 
 		 386 aa  420  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0502  cupin 4 family protein  46.19 
 
 		 373 aa  355  1e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2068  Cupin 4 family protein  45.14 
 
 		 373 aa  350  2e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1937  Cupin 4 family protein  45.14 
 
 		 373 aa  349  4e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2011  cupin 4 family protein  43.04 
 
 		 373 aa  349  4e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0220075 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2988  cupin family protein  44.09 
 
 		 373 aa  347  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3067  cupin 4 family protein  44.09 
 
 		 373 aa  346  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1346  cupin family protein  42.48 
 
 		 373 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.986526 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0473  Cupin 4 family protein  44.88 
 
 		 373 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1308  cupin family protein  42.22 
 
 		 373 aa  342  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.579202  normal  0.591966 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1285  Cupin 4 family protein  43.8 
 
 		 373 aa  342  5.999999999999999e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1864  Cupin 4 family protein  43.31 
 
 		 373 aa  342  7e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1955  cupin family protein  42.22 
 
 		 373 aa  342  7e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.280047  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1330  cupin family protein  42.22 
 
 		 373 aa  342  7e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.233449  normal  0.341936 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1408  Cupin 4 family protein  45.14 
 
 		 374 aa  342  7e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2137  cupin family protein  42.22 
 
 		 373 aa  342  9e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0624468 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0392  Cupin 4 family protein  44.62 
 
 		 373 aa  342  9e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2519  Cupin 4 family protein  42.48 
 
 		 373 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0666495  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1569  cupin family protein  42.48 
 
 		 373 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486119  hitchhiker  0.00000357486 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01126  hypothetical protein  42.48 
 
 		 373 aa  339  4e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1306  cupin family protein  42.48 
 
 		 373 aa  339  4e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01134  hypothetical protein  42.48 
 
 		 373 aa  339  4e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1248  cupin family protein  42.48 
 
 		 373 aa  339  4e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1291  cupin family protein  42.48 
 
 		 373 aa  339  4e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2475  cupin 4 family protein  42.48 
 
 		 373 aa  339  4e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1997  cupin family protein  42.48 
 
 		 373 aa  339  4e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.446284 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0960  cupin 4 family protein  46.6 
 
 		 375 aa  338  8e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.786571  normal  0.101373 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2149  Cupin 4 family protein  43.04 
 
 		 373 aa  338  9e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1641  cupin 4 family protein  42.74 
 
 		 373 aa  337  1.9999999999999998e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2857  hypothetical protein  42.48 
 
 		 373 aa  333  2e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0491  cupin 4 family protein  43.57 
 
 		 373 aa  333  4e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1713  cupin 4 family protein  42.22 
 
 		 373 aa  333  4e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1606  cupin family protein  42.66 
 
 		 373 aa  332  6e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2263  cupin 4 family protein  43.72 
 
 		 380 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1825  cupin 4  45.03 
 
 		 376 aa  316  5e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1952  hypothetical protein  40.1 
 
 		 390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2541  cupin 4 family protein  40.47 
 
 		 376 aa  295  1e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2708  cupin 4 family protein  40.42 
 
 		 374 aa  294  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.112259 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1870  Cupin 4 family protein  40.89 
 
 		 379 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000786372  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2236  cupin 4 family protein  40.62 
 
 		 379 aa  293  3e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.817609  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2474  cupin 4 family protein  40.62 
 
 		 379 aa  292  5e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030086  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2594  cupin 4 family protein  40.62 
 
 		 379 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46128  normal  0.0566469 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2481  cupin 4 family protein  40.62 
 
 		 379 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1675  cupin 4 family protein  40.1 
 
 		 379 aa  285  7e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1744  cupin 4 family protein  40.1 
 
 		 379 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1600  cupin 4 family protein  40.67 
 
 		 379 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2636  hypothetical protein  38.62 
 
 		 380 aa  276  4e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1557  cupin 4 family protein  40.98 
 
 		 386 aa  276  6e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.215237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2065  cupin 4  38.82 
 
 		 372 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.439804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2447  cupin 4  37.89 
 
 		 397 aa  249  4e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02373  putative enzyme with RmlC-like domain  37.37 
 
 		 388 aa  248  2e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.965281  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1765  cupin 4 family protein  36.32 
 
 		 383 aa  246  4.9999999999999997e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0255627  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3622  cupin 4 family protein  35.19 
 
 		 388 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4017  cupin 4 family protein  35.54 
 
 		 390 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593926  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1816  cupin 4 family protein  34.92 
 
 		 388 aa  235  8e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal  0.222085 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28390  clavaminate synthase-like superfamily protein  35.56 
 
 		 388 aa  233  5e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2383  cupin 4  35.6 
 
 		 389 aa  232  9e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3599  transcription factor jumonji, jmjC  36.25 
 
 		 391 aa  232  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.404465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3421  cupin 4 family protein  34.22 
 
 		 388 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30100  hypothetical protein  36.27 
 
 		 389 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3193  transcription factor jumonji, jmjC  33.96 
 
 		 388 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.021443 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2577  hypothetical protein  35.23 
 
 		 389 aa  225  8e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0294442  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3361  hypothetical protein  33.69 
 
 		 388 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.036154  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3269  cupin 4 family protein  36.9 
 
 		 400 aa  223  4.9999999999999996e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540912 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0038  Cupin 4 family protein  32.03 
 
 		 392 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2403  cupin 4 family protein  34.49 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.969826  normal  0.0823577 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1132  transcription factor jumonji, jmjC  32.11 
 
 		 401 aa  207  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1404  Cupin 4 family protein  32.29 
 
 		 397 aa  207  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1865  hypothetical protein  34.9 
 
 		 395 aa  206  8e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1874  hypothetical protein  33.52 
 
 		 395 aa  203  4e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1274  Cupin 4 family protein  31.13 
 
 		 385 aa  200  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1143  cupin region  30.09 
 
 		 415 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000830013  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1850  Cupin 4 family protein  33.52 
 
 		 397 aa  199  7.999999999999999e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.469672  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1674  hypothetical protein  33.33 
 
 		 383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2628  Cupin 4 family protein  32.19 
 
 		 471 aa  189  5.999999999999999e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.229429  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0838  cupin 4  35.27 
 
 		 392 aa  188  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000238733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0982  cupin 4  35.27 
 
 		 392 aa  188  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000496862  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01200  transcription factor jumonji, JmjC  31.9 
 
 		 498 aa  184  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1247  hypothetical protein  31.12 
 
 		 390 aa  183  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000169648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1332  cupin 4 family protein  31.87 
 
 		 378 aa  182  7e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1144  cupin 4  31.22 
 
 		 390 aa  181  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.929566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0891  hypothetical protein  34.04 
 
 		 422 aa  179  4.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.637321  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0804  cupin 4 family protein  34.04 
 
 		 422 aa  179  5.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0585  hypothetical protein  31.56 
 
 		 377 aa  179  9e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.269935  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1108  cupin region  29.84 
 
 		 402 aa  176  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1910  hypothetical protein  32.66 
 
 		 422 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507646  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1614  hypothetical protein  30.09 
 
 		 382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000816657  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2562  cupin domain-containing protein  41.33 
 
 		 395 aa  172  9e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245241  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2694  cupin superfamily protein family  34.04 
 
 		 422 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183857  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2177  hypothetical protein  34.04 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0429596  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3141  hypothetical protein  34.04 
 
 		 407 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1450  hypothetical protein  34.04 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.90536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>