149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B1955 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01126  hypothetical protein  93.83 
 
 		 373 aa  728    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2519  Cupin 4 family protein  94.1 
 
 		 373 aa  729    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0666495  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01134  hypothetical protein  93.83 
 
 		 373 aa  728    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1306  cupin family protein  93.83 
 
 		 373 aa  728    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2137  cupin family protein  99.73 
 
 		 373 aa  760    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0624468 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1346  cupin family protein  99.46 
 
 		 373 aa  759    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.986526 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1569  cupin family protein  93.57 
 
 		 373 aa  728    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486119  hitchhiker  0.00000357486 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1330  cupin family protein  100 
 
 		 373 aa  763    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.233449  normal  0.341936 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1955  cupin family protein  100 
 
 		 373 aa  763    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.280047  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1641  cupin 4 family protein  86.56 
 
 		 373 aa  684    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1308  cupin family protein  99.73 
 
 		 373 aa  761    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.579202  normal  0.591966 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1248  cupin family protein  93.83 
 
 		 373 aa  728    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1291  cupin family protein  93.83 
 
 		 373 aa  728    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2475  cupin 4 family protein  93.83 
 
 		 373 aa  728    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1997  cupin family protein  93.83 
 
 		 373 aa  728    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.446284 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1606  cupin family protein  78.44 
 
 		 373 aa  624  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2857  hypothetical protein  78.71 
 
 		 373 aa  624  1e-178  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1713  cupin 4 family protein  78.44 
 
 		 373 aa  623  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1864  Cupin 4 family protein  75.74 
 
 		 373 aa  614  1e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2011  cupin 4 family protein  75.81 
 
 		 373 aa  613  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0220075 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2149  Cupin 4 family protein  74.39 
 
 		 373 aa  606  9.999999999999999e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1937  Cupin 4 family protein  75.74 
 
 		 373 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2068  Cupin 4 family protein  73.05 
 
 		 373 aa  580  1e-164  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1285  Cupin 4 family protein  65.5 
 
 		 373 aa  531  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0473  Cupin 4 family protein  65.86 
 
 		 373 aa  530  1e-149  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3067  cupin 4 family protein  64.96 
 
 		 373 aa  528  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0392  Cupin 4 family protein  65.32 
 
 		 373 aa  527  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2988  cupin family protein  64.69 
 
 		 373 aa  525  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1408  Cupin 4 family protein  63.98 
 
 		 374 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0491  cupin 4 family protein  62.9 
 
 		 373 aa  511  1e-144  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0502  cupin 4 family protein  63.44 
 
 		 373 aa  513  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1952  hypothetical protein  45.65 
 
 		 390 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0960  cupin 4 family protein  45.7 
 
 		 375 aa  349  5e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.786571  normal  0.101373 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2133  hypothetical protein  42.22 
 
 		 383 aa  342  7e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.764598  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2263  cupin 4 family protein  44 
 
 		 380 aa  332  8e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2636  hypothetical protein  45.33 
 
 		 380 aa  331  1e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1744  cupin 4 family protein  44.53 
 
 		 379 aa  327  3e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1675  cupin 4 family protein  44.53 
 
 		 379 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2000  cupin 4 family protein  42.39 
 
 		 381 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1600  cupin 4 family protein  44.53 
 
 		 379 aa  326  5e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2708  cupin 4 family protein  43.2 
 
 		 374 aa  325  1e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.112259 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2236  cupin 4 family protein  44.15 
 
 		 379 aa  323  2e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.817609  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1870  Cupin 4 family protein  44.15 
 
 		 379 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000786372  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2474  cupin 4 family protein  43.88 
 
 		 379 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030086  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2541  cupin 4 family protein  43.24 
 
 		 376 aa  320  3e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2594  cupin 4 family protein  43.88 
 
 		 379 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46128  normal  0.0566469 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2481  cupin 4 family protein  43.88 
 
 		 379 aa  318  7e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2408  cupin 4 family protein  41.85 
 
 		 380 aa  318  1e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0501658  hitchhiker  0.000275258 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1825  cupin 4  43.2 
 
 		 376 aa  315  6e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2199  cupin 4 family protein  41.85 
 
 		 381 aa  315  8e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00219592  hitchhiker  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1557  cupin 4 family protein  46.15 
 
 		 386 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.215237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2004  Cupin 4 family protein  42.82 
 
 		 385 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.367195  hitchhiker  0.0000511749 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2354  cupin 4 family protein  42.82 
 
 		 385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2343  cupin 4 family protein  42.82 
 
 		 385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2459  cupin 4 family protein  42.82 
 
 		 385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.378112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1908  cupin 4 family protein  41.89 
 
 		 386 aa  298  1e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2383  cupin 4  42.25 
 
 		 389 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2065  cupin 4  40.8 
 
 		 372 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.439804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02373  putative enzyme with RmlC-like domain  37.2 
 
 		 388 aa  257  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.965281  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2447  cupin 4  39.84 
 
 		 397 aa  256  3e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30100  hypothetical protein  37.73 
 
 		 389 aa  246  6e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2403  cupin 4 family protein  37.2 
 
 		 388 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.969826  normal  0.0823577 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3622  cupin 4 family protein  37.2 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2577  hypothetical protein  37.73 
 
 		 389 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0294442  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1816  cupin 4 family protein  36.93 
 
 		 388 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal  0.222085 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3421  cupin 4 family protein  36.66 
 
 		 388 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4017  cupin 4 family protein  36.66 
 
 		 390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593926  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28390  clavaminate synthase-like superfamily protein  37.33 
 
 		 388 aa  239  5.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3361  hypothetical protein  36.22 
 
 		 388 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.036154  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3193  transcription factor jumonji, jmjC  36.22 
 
 		 388 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.021443 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3269  cupin 4 family protein  38.2 
 
 		 400 aa  235  8e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540912 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1765  cupin 4 family protein  35.08 
 
 		 383 aa  231  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0255627  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0038  Cupin 4 family protein  36.02 
 
 		 392 aa  230  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3599  transcription factor jumonji, jmjC  35.48 
 
 		 391 aa  226  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.404465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0838  cupin 4  37.53 
 
 		 392 aa  218  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000238733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0982  cupin 4  37.53 
 
 		 392 aa  218  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000496862  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1143  cupin region  35.69 
 
 		 415 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000830013  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1404  Cupin 4 family protein  36.21 
 
 		 397 aa  211  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2628  Cupin 4 family protein  37.06 
 
 		 471 aa  208  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.229429  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1674  hypothetical protein  37.82 
 
 		 383 aa  203  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0891  hypothetical protein  37.58 
 
 		 422 aa  203  4e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.637321  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1614  hypothetical protein  33.97 
 
 		 382 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000816657  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0804  cupin 4 family protein  37.58 
 
 		 422 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01200  transcription factor jumonji, JmjC  36.72 
 
 		 498 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5986  cupin 4  33.97 
 
 		 406 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.143009  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2091  cupin 4 family protein  33.97 
 
 		 406 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0444344  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2001  cupin 4 family protein  34.24 
 
 		 406 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.484534  hitchhiker  0.000000254865 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2110  cupin 4 family protein  33.88 
 
 		 406 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.191653  hitchhiker  0.00823788 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1850  Cupin 4 family protein  35.11 
 
 		 397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.469672  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1183  cupin 4 family protein  33.51 
 
 		 408 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0687664  hitchhiker  0.0000384717 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1332  cupin 4 family protein  34.14 
 
 		 378 aa  197  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1402  cupin 4 family protein  34.86 
 
 		 370 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  hitchhiker  0.000000587517 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2127  cupin 4 family protein  33.88 
 
 		 407 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14925  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2523  Cupin 4 family protein  33.88 
 
 		 368 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000942208  decreased coverage  0.00000000060733 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1874  hypothetical protein  34.33 
 
 		 395 aa  195  1e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2644  cupin 4  34 
 
 		 384 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1910  hypothetical protein  33.15 
 
 		 422 aa  193  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507646  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2615  cupin domain-containing protein  34.68 
 
 		 395 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5397  cupin domain-containing protein  33.7 
 
 		 406 aa  193  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705727  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2562  cupin domain-containing protein  35.12 
 
 		 395 aa  192  9e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>