155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0960 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0960  cupin 4 family protein  100 
 
 		 375 aa  774    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.786571  normal  0.101373 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0502  cupin 4 family protein  48.92 
 
 		 373 aa  376  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2011  cupin 4 family protein  48.92 
 
 		 373 aa  376  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0220075 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0473  Cupin 4 family protein  48.66 
 
 		 373 aa  373  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2988  cupin family protein  48.39 
 
 		 373 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3067  cupin 4 family protein  48.39 
 
 		 373 aa  371  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1285  Cupin 4 family protein  47.58 
 
 		 373 aa  370  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2149  Cupin 4 family protein  47.62 
 
 		 373 aa  365  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0392  Cupin 4 family protein  48.12 
 
 		 373 aa  366  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2857  hypothetical protein  48.39 
 
 		 373 aa  365  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1864  Cupin 4 family protein  47.88 
 
 		 373 aa  364  1e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1606  cupin family protein  48.12 
 
 		 373 aa  364  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1713  cupin 4 family protein  48.12 
 
 		 373 aa  364  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0491  cupin 4 family protein  49.06 
 
 		 373 aa  363  3e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1937  Cupin 4 family protein  47.58 
 
 		 373 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1408  Cupin 4 family protein  46.11 
 
 		 374 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1641  cupin 4 family protein  46.13 
 
 		 373 aa  355  5e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1346  cupin family protein  45.97 
 
 		 373 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.986526 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1569  cupin family protein  46.24 
 
 		 373 aa  350  3e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486119  hitchhiker  0.00000357486 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01126  hypothetical protein  46.24 
 
 		 373 aa  349  4e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2519  Cupin 4 family protein  46.24 
 
 		 373 aa  349  4e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0666495  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1997  cupin family protein  46.24 
 
 		 373 aa  349  4e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.446284 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1306  cupin family protein  46.24 
 
 		 373 aa  349  4e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01134  hypothetical protein  46.24 
 
 		 373 aa  349  4e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2475  cupin 4 family protein  46.24 
 
 		 373 aa  349  4e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1248  cupin family protein  46.24 
 
 		 373 aa  349  4e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1291  cupin family protein  46.24 
 
 		 373 aa  349  4e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1330  cupin family protein  45.7 
 
 		 373 aa  349  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.233449  normal  0.341936 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1955  cupin family protein  45.7 
 
 		 373 aa  349  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.280047  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1308  cupin family protein  45.7 
 
 		 373 aa  348  6e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.579202  normal  0.591966 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2137  cupin family protein  45.7 
 
 		 373 aa  348  7e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0624468 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2068  Cupin 4 family protein  44.83 
 
 		 373 aa  344  1e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2133  hypothetical protein  46.6 
 
 		 383 aa  338  8e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.764598  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2000  cupin 4 family protein  44.71 
 
 		 381 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2263  cupin 4 family protein  44.03 
 
 		 380 aa  323  3e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2199  cupin 4 family protein  43.99 
 
 		 381 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00219592  hitchhiker  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2354  cupin 4 family protein  43.39 
 
 		 385 aa  316  3e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1908  cupin 4 family protein  43.57 
 
 		 386 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2343  cupin 4 family protein  43.39 
 
 		 385 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2459  cupin 4 family protein  43.39 
 
 		 385 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.378112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2004  Cupin 4 family protein  43.12 
 
 		 385 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.367195  hitchhiker  0.0000511749 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2408  cupin 4 family protein  43.6 
 
 		 380 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0501658  hitchhiker  0.000275258 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2541  cupin 4 family protein  42.4 
 
 		 376 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1825  cupin 4  42.4 
 
 		 376 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2708  cupin 4 family protein  41.27 
 
 		 374 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.112259 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1952  hypothetical protein  40.16 
 
 		 390 aa  304  2.0000000000000002e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2636  hypothetical protein  41.91 
 
 		 380 aa  296  5e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1600  cupin 4 family protein  41.11 
 
 		 379 aa  293  5e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1675  cupin 4 family protein  41.38 
 
 		 379 aa  293  5e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1744  cupin 4 family protein  41.38 
 
 		 379 aa  292  6e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1557  cupin 4 family protein  43.56 
 
 		 386 aa  291  9e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.215237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2236  cupin 4 family protein  39.26 
 
 		 379 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.817609  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2474  cupin 4 family protein  39.58 
 
 		 379 aa  289  6e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030086  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1870  Cupin 4 family protein  39.58 
 
 		 379 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000786372  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2065  cupin 4  43.28 
 
 		 372 aa  287  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.439804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2594  cupin 4 family protein  39.58 
 
 		 379 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46128  normal  0.0566469 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2481  cupin 4 family protein  39.58 
 
 		 379 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3361  hypothetical protein  40.05 
 
 		 388 aa  252  7e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.036154  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3193  transcription factor jumonji, jmjC  39.78 
 
 		 388 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.021443 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2383  cupin 4  37.04 
 
 		 389 aa  249  4e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3421  cupin 4 family protein  37.37 
 
 		 388 aa  245  8e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2447  cupin 4  37.93 
 
 		 397 aa  245  9e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2403  cupin 4 family protein  39.26 
 
 		 388 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.969826  normal  0.0823577 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28390  clavaminate synthase-like superfamily protein  37.9 
 
 		 388 aa  242  6e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1816  cupin 4 family protein  36.56 
 
 		 388 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal  0.222085 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02373  putative enzyme with RmlC-like domain  36.87 
 
 		 388 aa  242  1e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.965281  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3622  cupin 4 family protein  36.56 
 
 		 388 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4017  cupin 4 family protein  36.56 
 
 		 390 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593926  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1765  cupin 4 family protein  37.83 
 
 		 383 aa  233  6e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0255627  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3599  transcription factor jumonji, jmjC  36.63 
 
 		 391 aa  229  8e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.404465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2577  hypothetical protein  36.73 
 
 		 389 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0294442  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30100  hypothetical protein  36.19 
 
 		 389 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3269  cupin 4 family protein  37.89 
 
 		 400 aa  220  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540912 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0038  Cupin 4 family protein  33.96 
 
 		 392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1674  hypothetical protein  35.88 
 
 		 383 aa  211  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0838  cupin 4  36.84 
 
 		 392 aa  208  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000238733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0982  cupin 4  36.84 
 
 		 392 aa  208  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000496862  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1404  Cupin 4 family protein  41.11 
 
 		 397 aa  206  5e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1143  cupin region  37.21 
 
 		 415 aa  205  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000830013  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1850  Cupin 4 family protein  34.73 
 
 		 397 aa  203  5e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.469672  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01200  transcription factor jumonji, JmjC  32.81 
 
 		 498 aa  202  8e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0804  cupin 4 family protein  33.07 
 
 		 422 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0891  hypothetical protein  33.07 
 
 		 422 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.637321  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0585  hypothetical protein  35.22 
 
 		 377 aa  187  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.269935  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2628  Cupin 4 family protein  35.67 
 
 		 471 aa  187  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.229429  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1148  hypothetical protein  35.82 
 
 		 409 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1132  transcription factor jumonji, jmjC  32.19 
 
 		 401 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1614  hypothetical protein  33.53 
 
 		 382 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000816657  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1332  cupin 4 family protein  33.88 
 
 		 378 aa  180  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1874  hypothetical protein  36.53 
 
 		 395 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1865  hypothetical protein  31.1 
 
 		 395 aa  176  7e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2523  Cupin 4 family protein  32.45 
 
 		 368 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000942208  decreased coverage  0.00000000060733 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1086  Cupin 4 family protein  33.63 
 
 		 409 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1183  cupin 4 family protein  31.52 
 
 		 408 aa  170  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0687664  hitchhiker  0.0000384717 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2644  cupin 4  33.51 
 
 		 384 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0990  Cupin 4 family protein  34.04 
 
 		 375 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.210343 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5092  cupin 4 family protein  32.27 
 
 		 376 aa  167  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581531  normal  0.0289513 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5986  cupin 4  31.52 
 
 		 406 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.143009  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2091  cupin 4 family protein  31.52 
 
 		 406 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0444344  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1191  cupin 4 family protein  31.89 
 
 		 413 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327917  normal  0.915059 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>