151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1825 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1825  cupin 4  100 
 
 		 376 aa  767    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2263  cupin 4 family protein  71.54 
 
 		 380 aa  570  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1675  cupin 4 family protein  70.74 
 
 		 379 aa  565  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1600  cupin 4 family protein  70.21 
 
 		 379 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1744  cupin 4 family protein  69.95 
 
 		 379 aa  558  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2236  cupin 4 family protein  69.68 
 
 		 379 aa  558  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.817609  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1870  Cupin 4 family protein  69.15 
 
 		 379 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000786372  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2474  cupin 4 family protein  69.41 
 
 		 379 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030086  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2636  hypothetical protein  68.62 
 
 		 380 aa  550  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2481  cupin 4 family protein  69.15 
 
 		 379 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2594  cupin 4 family protein  69.15 
 
 		 379 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46128  normal  0.0566469 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2541  cupin 4 family protein  59.31 
 
 		 376 aa  488  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2065  cupin 4  62.5 
 
 		 372 aa  479  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.439804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2708  cupin 4 family protein  58.13 
 
 		 374 aa  472  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.112259 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1557  cupin 4 family protein  57.07 
 
 		 386 aa  456  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.215237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2068  Cupin 4 family protein  45.24 
 
 		 373 aa  317  2e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1346  cupin family protein  43.47 
 
 		 373 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.986526 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1641  cupin 4 family protein  42.67 
 
 		 373 aa  317  3e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2133  hypothetical protein  45.03 
 
 		 383 aa  316  4e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.764598  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1308  cupin family protein  43.2 
 
 		 373 aa  316  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.579202  normal  0.591966 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2137  cupin family protein  43.2 
 
 		 373 aa  316  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0624468 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1569  cupin family protein  43.2 
 
 		 373 aa  315  7e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486119  hitchhiker  0.00000357486 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1955  cupin family protein  43.2 
 
 		 373 aa  315  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.280047  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1330  cupin family protein  43.2 
 
 		 373 aa  315  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.233449  normal  0.341936 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2519  Cupin 4 family protein  43.2 
 
 		 373 aa  315  8e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0666495  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01126  hypothetical protein  43.2 
 
 		 373 aa  315  9e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1306  cupin family protein  43.2 
 
 		 373 aa  315  9e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1248  cupin family protein  43.2 
 
 		 373 aa  315  9e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1291  cupin family protein  43.2 
 
 		 373 aa  315  9e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01134  hypothetical protein  43.2 
 
 		 373 aa  315  9e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2475  cupin 4 family protein  43.2 
 
 		 373 aa  315  9e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1997  cupin family protein  43.2 
 
 		 373 aa  315  9e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.446284 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1864  Cupin 4 family protein  43.5 
 
 		 373 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2988  cupin family protein  43.39 
 
 		 373 aa  312  7.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1937  Cupin 4 family protein  43.92 
 
 		 373 aa  311  1e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2149  Cupin 4 family protein  43.12 
 
 		 373 aa  311  2e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3067  cupin 4 family protein  43.12 
 
 		 373 aa  309  4e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2857  hypothetical protein  42.18 
 
 		 373 aa  309  5.9999999999999995e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1606  cupin family protein  41.91 
 
 		 373 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1713  cupin 4 family protein  41.91 
 
 		 373 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0960  cupin 4 family protein  42.4 
 
 		 375 aa  307  2.0000000000000002e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.786571  normal  0.101373 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0473  Cupin 4 family protein  43.12 
 
 		 373 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2011  cupin 4 family protein  42.86 
 
 		 373 aa  305  9.000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0220075 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0502  cupin 4 family protein  43.12 
 
 		 373 aa  304  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1285  Cupin 4 family protein  42.59 
 
 		 373 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1408  Cupin 4 family protein  42.33 
 
 		 374 aa  301  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0491  cupin 4 family protein  42.06 
 
 		 373 aa  298  1e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0392  Cupin 4 family protein  42.33 
 
 		 373 aa  297  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2199  cupin 4 family protein  41.24 
 
 		 381 aa  287  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00219592  hitchhiker  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2408  cupin 4 family protein  42.05 
 
 		 380 aa  285  7e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0501658  hitchhiker  0.000275258 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2000  cupin 4 family protein  40.58 
 
 		 381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1952  hypothetical protein  37.01 
 
 		 390 aa  273  4.0000000000000004e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1908  cupin 4 family protein  40.11 
 
 		 386 aa  267  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2004  Cupin 4 family protein  39.58 
 
 		 385 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.367195  hitchhiker  0.0000511749 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2354  cupin 4 family protein  39.05 
 
 		 385 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2343  cupin 4 family protein  38.79 
 
 		 385 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2459  cupin 4 family protein  38.79 
 
 		 385 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.378112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02373  putative enzyme with RmlC-like domain  38.54 
 
 		 388 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.965281  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2447  cupin 4  39.04 
 
 		 397 aa  236  4e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3361  hypothetical protein  38.07 
 
 		 388 aa  232  9e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.036154  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2383  cupin 4  35.11 
 
 		 389 aa  231  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3193  transcription factor jumonji, jmjC  37.53 
 
 		 388 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.021443 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3421  cupin 4 family protein  39.47 
 
 		 388 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1816  cupin 4 family protein  38.68 
 
 		 388 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal  0.222085 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3622  cupin 4 family protein  38.95 
 
 		 388 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30100  hypothetical protein  37.53 
 
 		 389 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4017  cupin 4 family protein  38.68 
 
 		 390 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593926  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3269  cupin 4 family protein  40.48 
 
 		 400 aa  226  6e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540912 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2577  hypothetical protein  37.27 
 
 		 389 aa  226  6e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0294442  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1850  Cupin 4 family protein  36.07 
 
 		 397 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.469672  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2403  cupin 4 family protein  37.3 
 
 		 388 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.969826  normal  0.0823577 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3599  transcription factor jumonji, jmjC  37.43 
 
 		 391 aa  223  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.404465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28390  clavaminate synthase-like superfamily protein  36.51 
 
 		 388 aa  222  7e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1765  cupin 4 family protein  34.13 
 
 		 383 aa  219  7e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0255627  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0038  Cupin 4 family protein  36.7 
 
 		 392 aa  218  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1674  hypothetical protein  36.67 
 
 		 383 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0804  cupin 4 family protein  33.85 
 
 		 422 aa  209  5e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1404  Cupin 4 family protein  38.26 
 
 		 397 aa  209  6e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01200  transcription factor jumonji, JmjC  33.78 
 
 		 498 aa  209  7e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0891  hypothetical protein  33.85 
 
 		 422 aa  209  7e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.637321  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1143  cupin region  35.76 
 
 		 415 aa  206  5e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000830013  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0838  cupin 4  36.99 
 
 		 392 aa  204  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000238733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0982  cupin 4  36.99 
 
 		 392 aa  204  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000496862  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2628  Cupin 4 family protein  34.83 
 
 		 471 aa  204  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.229429  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0585  hypothetical protein  32.86 
 
 		 377 aa  191  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.269935  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1874  hypothetical protein  36 
 
 		 395 aa  188  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1865  hypothetical protein  34.19 
 
 		 395 aa  186  6e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1132  transcription factor jumonji, jmjC  31.93 
 
 		 401 aa  186  6e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1274  Cupin 4 family protein  35.25 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1910  hypothetical protein  32.9 
 
 		 422 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507646  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2568  hypothetical protein  31.34 
 
 		 382 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2615  cupin domain-containing protein  37.63 
 
 		 395 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2694  cupin superfamily protein family  37.28 
 
 		 422 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183857  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5986  cupin 4  32.72 
 
 		 406 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.143009  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2091  cupin 4 family protein  32.72 
 
 		 406 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0444344  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2562  cupin domain-containing protein  37.28 
 
 		 395 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245241  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1402  cupin 4 family protein  32.45 
 
 		 370 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  hitchhiker  0.000000587517 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2177  hypothetical protein  36.92 
 
 		 395 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0429596  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1450  hypothetical protein  36.92 
 
 		 395 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.90536  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1072  cupin 4  33.23 
 
 		 375 aa  176  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.474375  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>