149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2636 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1870  Cupin 4 family protein  81.79 
 
 		 379 aa  664    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000786372  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2636  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  783    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1600  cupin 4 family protein  89.97 
 
 		 379 aa  714    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1675  cupin 4 family protein  90.21 
 
 		 379 aa  716    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1744  cupin 4 family protein  91.01 
 
 		 379 aa  721    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2481  cupin 4 family protein  81.79 
 
 		 379 aa  663    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2236  cupin 4 family protein  81.79 
 
 		 379 aa  663    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.817609  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2474  cupin 4 family protein  81.53 
 
 		 379 aa  660    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030086  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2594  cupin 4 family protein  81.79 
 
 		 379 aa  662    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46128  normal  0.0566469 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2263  cupin 4 family protein  68.52 
 
 		 380 aa  551  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1825  cupin 4  68.62 
 
 		 376 aa  550  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2708  cupin 4 family protein  61.33 
 
 		 374 aa  501  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.112259 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2541  cupin 4 family protein  60.37 
 
 		 376 aa  494  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2065  cupin 4  62.33 
 
 		 372 aa  479  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.439804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1557  cupin 4 family protein  59.69 
 
 		 386 aa  478  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.215237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1641  cupin 4 family protein  44.83 
 
 		 373 aa  337  1.9999999999999998e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1937  Cupin 4 family protein  45.69 
 
 		 373 aa  335  5.999999999999999e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1346  cupin family protein  45.6 
 
 		 373 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.986526 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1308  cupin family protein  45.33 
 
 		 373 aa  332  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.579202  normal  0.591966 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1864  Cupin 4 family protein  45.09 
 
 		 373 aa  332  9e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1955  cupin family protein  45.33 
 
 		 373 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.280047  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2137  cupin family protein  45.33 
 
 		 373 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0624468 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1330  cupin family protein  45.33 
 
 		 373 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.233449  normal  0.341936 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2149  Cupin 4 family protein  44.56 
 
 		 373 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01126  hypothetical protein  44.27 
 
 		 373 aa  323  3e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2519  Cupin 4 family protein  44.27 
 
 		 373 aa  323  3e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0666495  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01134  hypothetical protein  44.27 
 
 		 373 aa  323  3e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1569  cupin family protein  44.27 
 
 		 373 aa  323  3e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486119  hitchhiker  0.00000357486 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1248  cupin family protein  44.27 
 
 		 373 aa  323  3e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1291  cupin family protein  44.27 
 
 		 373 aa  323  3e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1306  cupin family protein  44.27 
 
 		 373 aa  323  3e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2475  cupin 4 family protein  44.27 
 
 		 373 aa  323  3e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1997  cupin family protein  44.27 
 
 		 373 aa  323  3e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.446284 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1606  cupin family protein  43.86 
 
 		 373 aa  321  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2068  Cupin 4 family protein  43.08 
 
 		 373 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2857  hypothetical protein  43.86 
 
 		 373 aa  320  3e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2988  cupin family protein  45.24 
 
 		 373 aa  319  5e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1713  cupin 4 family protein  43.6 
 
 		 373 aa  318  7e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3067  cupin 4 family protein  45.24 
 
 		 373 aa  318  7e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2011  cupin 4 family protein  42.82 
 
 		 373 aa  314  9.999999999999999e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0220075 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0473  Cupin 4 family protein  44.83 
 
 		 373 aa  312  4.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1285  Cupin 4 family protein  43.77 
 
 		 373 aa  311  1e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0502  cupin 4 family protein  42.71 
 
 		 373 aa  311  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0491  cupin 4 family protein  43.22 
 
 		 373 aa  308  8e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0392  Cupin 4 family protein  44.03 
 
 		 373 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1408  Cupin 4 family protein  42.15 
 
 		 374 aa  305  8.000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0960  cupin 4 family protein  41.91 
 
 		 375 aa  296  5e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.786571  normal  0.101373 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2354  cupin 4 family protein  41.22 
 
 		 385 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2343  cupin 4 family protein  41.22 
 
 		 385 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2459  cupin 4 family protein  41.22 
 
 		 385 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.378112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2000  cupin 4 family protein  40.05 
 
 		 381 aa  281  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2004  Cupin 4 family protein  40.96 
 
 		 385 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.367195  hitchhiker  0.0000511749 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2133  hypothetical protein  38.62 
 
 		 383 aa  276  4e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.764598  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2408  cupin 4 family protein  38.98 
 
 		 380 aa  275  8e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0501658  hitchhiker  0.000275258 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1908  cupin 4 family protein  40.16 
 
 		 386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1952  hypothetical protein  36.43 
 
 		 390 aa  273  5.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2199  cupin 4 family protein  39.84 
 
 		 381 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00219592  hitchhiker  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30100  hypothetical protein  37.76 
 
 		 389 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3193  transcription factor jumonji, jmjC  37.14 
 
 		 388 aa  242  9e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.021443 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3361  hypothetical protein  36.87 
 
 		 388 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.036154  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2577  hypothetical protein  37.24 
 
 		 389 aa  239  8e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0294442  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2447  cupin 4  35.37 
 
 		 397 aa  237  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2403  cupin 4 family protein  36.03 
 
 		 388 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.969826  normal  0.0823577 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02373  putative enzyme with RmlC-like domain  48.1 
 
 		 388 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.965281  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3599  transcription factor jumonji, jmjC  35.84 
 
 		 391 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.404465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1850  Cupin 4 family protein  35.17 
 
 		 397 aa  233  6e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.469672  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2383  cupin 4  34.99 
 
 		 389 aa  230  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1674  hypothetical protein  37.17 
 
 		 383 aa  226  3e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28390  clavaminate synthase-like superfamily protein  35.43 
 
 		 388 aa  226  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3421  cupin 4 family protein  36.51 
 
 		 388 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1816  cupin 4 family protein  36.48 
 
 		 388 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal  0.222085 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3622  cupin 4 family protein  39.41 
 
 		 388 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4017  cupin 4 family protein  36.48 
 
 		 390 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593926  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0038  Cupin 4 family protein  35.83 
 
 		 392 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1765  cupin 4 family protein  33.6 
 
 		 383 aa  215  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0255627  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3269  cupin 4 family protein  36.67 
 
 		 400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540912 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0838  cupin 4  37.57 
 
 		 392 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000238733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0982  cupin 4  37.57 
 
 		 392 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000496862  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1143  cupin region  34.3 
 
 		 415 aa  211  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000830013  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0804  cupin 4 family protein  33.68 
 
 		 422 aa  209  8e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0891  hypothetical protein  33.68 
 
 		 422 aa  208  1e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.637321  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2628  Cupin 4 family protein  32.4 
 
 		 471 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.229429  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1404  Cupin 4 family protein  39.27 
 
 		 397 aa  208  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01200  transcription factor jumonji, JmjC  33.33 
 
 		 498 aa  199  7.999999999999999e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1874  hypothetical protein  44.3 
 
 		 395 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2568  hypothetical protein  33.05 
 
 		 382 aa  193  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1865  hypothetical protein  32.28 
 
 		 395 aa  192  6e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1132  transcription factor jumonji, jmjC  32.72 
 
 		 401 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3175  cupin 4  31.61 
 
 		 408 aa  187  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0585  hypothetical protein  31.92 
 
 		 377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.269935  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1274  Cupin 4 family protein  34.84 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1910  hypothetical protein  32.62 
 
 		 422 aa  182  7e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507646  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2694  cupin superfamily protein family  32.89 
 
 		 422 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183857  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2562  cupin domain-containing protein  32.89 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245241  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2615  cupin domain-containing protein  32.89 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1191  cupin 4 family protein  31.9 
 
 		 413 aa  177  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327917  normal  0.915059 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2177  hypothetical protein  32.62 
 
 		 395 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0429596  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3141  hypothetical protein  32.62 
 
 		 407 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1450  hypothetical protein  32.62 
 
 		 395 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.90536  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2110  cupin 4 family protein  41.63 
 
 		 406 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.191653  hitchhiker  0.00823788 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>