145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1132 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1132  transcription factor jumonji, jmjC  100 
 
 		 401 aa  831    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1874  hypothetical protein  49.24 
 
 		 395 aa  417  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1865  hypothetical protein  49.36 
 
 		 395 aa  417  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3622  cupin 4 family protein  42.9 
 
 		 388 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3193  transcription factor jumonji, jmjC  40.21 
 
 		 388 aa  286  5e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.021443 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1816  cupin 4 family protein  42.9 
 
 		 388 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal  0.222085 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28390  clavaminate synthase-like superfamily protein  39.74 
 
 		 388 aa  286  5.999999999999999e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30100  hypothetical protein  44.62 
 
 		 389 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2577  hypothetical protein  44.94 
 
 		 389 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0294442  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2447  cupin 4  39.12 
 
 		 397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3421  cupin 4 family protein  43.38 
 
 		 388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2403  cupin 4 family protein  40.27 
 
 		 388 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.969826  normal  0.0823577 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4017  cupin 4 family protein  42.59 
 
 		 390 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593926  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3361  hypothetical protein  40.26 
 
 		 388 aa  282  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.036154  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3599  transcription factor jumonji, jmjC  39.62 
 
 		 391 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.404465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1765  cupin 4 family protein  40.36 
 
 		 383 aa  276  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0255627  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0038  Cupin 4 family protein  37.21 
 
 		 392 aa  263  4e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3269  cupin 4 family protein  38.5 
 
 		 400 aa  252  7e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540912 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1850  Cupin 4 family protein  38.59 
 
 		 397 aa  247  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.469672  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1674  hypothetical protein  43.37 
 
 		 383 aa  245  8e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2628  Cupin 4 family protein  39.05 
 
 		 471 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.229429  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0838  cupin 4  35.79 
 
 		 392 aa  227  3e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000238733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0982  cupin 4  35.79 
 
 		 392 aa  227  3e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000496862  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01200  transcription factor jumonji, JmjC  41.35 
 
 		 498 aa  227  3e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1143  cupin region  43.28 
 
 		 415 aa  226  7e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000830013  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1404  Cupin 4 family protein  40.3 
 
 		 397 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0804  cupin 4 family protein  37.89 
 
 		 422 aa  222  8e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0585  hypothetical protein  42.91 
 
 		 377 aa  222  9e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.269935  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0891  hypothetical protein  37.7 
 
 		 422 aa  222  9e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.637321  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2127  cupin 4 family protein  34.29 
 
 		 407 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14925  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1191  cupin 4 family protein  34.36 
 
 		 413 aa  209  6e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327917  normal  0.915059 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2644  cupin 4  34.72 
 
 		 384 aa  209  7e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2133  hypothetical protein  32.11 
 
 		 383 aa  207  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.764598  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1108  cupin region  40.66 
 
 		 402 aa  208  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2642  cupin 4 family protein  32.26 
 
 		 418 aa  208  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1614  hypothetical protein  35.1 
 
 		 382 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000816657  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1148  hypothetical protein  39.51 
 
 		 409 aa  206  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0920  Cupin 4 family protein  34.32 
 
 		 373 aa  207  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1952  hypothetical protein  34.12 
 
 		 390 aa  205  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1183  cupin 4 family protein  34.55 
 
 		 408 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0687664  hitchhiker  0.0000384717 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5986  cupin 4  35.08 
 
 		 406 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.143009  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2004  Cupin 4 family protein  34.76 
 
 		 385 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.367195  hitchhiker  0.0000511749 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2091  cupin 4 family protein  35.08 
 
 		 406 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0444344  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1332  cupin 4 family protein  48.99 
 
 		 378 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2354  cupin 4 family protein  34.76 
 
 		 385 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1908  cupin 4 family protein  33.76 
 
 		 386 aa  203  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5397  cupin domain-containing protein  34.29 
 
 		 406 aa  203  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705727  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1086  Cupin 4 family protein  40.79 
 
 		 409 aa  202  6e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3437  Cupin 4 family protein  33.87 
 
 		 381 aa  202  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2001  cupin 4 family protein  34.03 
 
 		 406 aa  202  7e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.484534  hitchhiker  0.000000254865 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1910  hypothetical protein  33.42 
 
 		 422 aa  202  8e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507646  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2523  Cupin 4 family protein  33.07 
 
 		 368 aa  202  8e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000942208  decreased coverage  0.00000000060733 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2568  hypothetical protein  33.6 
 
 		 382 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2343  cupin 4 family protein  34.49 
 
 		 385 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2459  cupin 4 family protein  34.49 
 
 		 385 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.378112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0990  Cupin 4 family protein  41.85 
 
 		 375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.210343 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2199  cupin 4 family protein  34.68 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00219592  hitchhiker  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0958  cupin 4 family protein  35.23 
 
 		 391 aa  201  3e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0589089  hitchhiker  0.00146846 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2110  cupin 4 family protein  34.82 
 
 		 406 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.191653  hitchhiker  0.00823788 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5092  cupin 4 family protein  36.84 
 
 		 376 aa  199  7e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581531  normal  0.0289513 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1408  Cupin 4 family protein  32.63 
 
 		 374 aa  199  9e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1402  cupin 4 family protein  45.45 
 
 		 370 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  hitchhiker  0.000000587517 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2263  cupin 4 family protein  31.12 
 
 		 380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1274  Cupin 4 family protein  35.37 
 
 		 385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1072  cupin 4  34.94 
 
 		 375 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.474375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2000  cupin 4 family protein  33.25 
 
 		 381 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2177  hypothetical protein  43.48 
 
 		 395 aa  196  7e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0429596  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1450  hypothetical protein  43.48 
 
 		 395 aa  196  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.90536  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3141  hypothetical protein  43.48 
 
 		 407 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2562  cupin domain-containing protein  43.48 
 
 		 395 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245241  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2615  cupin domain-containing protein  37.86 
 
 		 395 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2694  cupin superfamily protein family  43.48 
 
 		 422 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183857  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3175  cupin 4  33.51 
 
 		 408 aa  195  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1600  cupin 4 family protein  32.89 
 
 		 379 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2474  cupin 4 family protein  33.25 
 
 		 379 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030086  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2068  Cupin 4 family protein  35.16 
 
 		 373 aa  192  6e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2236  cupin 4 family protein  33.25 
 
 		 379 aa  193  6e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.817609  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1744  cupin 4 family protein  32.89 
 
 		 379 aa  192  7e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1005  cupin 4 family protein  33.51 
 
 		 373 aa  192  7e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2658  cupin 4 family protein  45.1 
 
 		 393 aa  192  7e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0302893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2708  cupin 4 family protein  34.22 
 
 		 374 aa  192  7e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.112259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1675  cupin 4 family protein  32.89 
 
 		 379 aa  192  8e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1870  Cupin 4 family protein  32.72 
 
 		 379 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000786372  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1937  Cupin 4 family protein  36.11 
 
 		 373 aa  191  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2594  cupin 4 family protein  32.45 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46128  normal  0.0566469 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2636  hypothetical protein  32.72 
 
 		 380 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2481  cupin 4 family protein  32.72 
 
 		 379 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0392  Cupin 4 family protein  36.06 
 
 		 373 aa  189  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0473  Cupin 4 family protein  36.43 
 
 		 373 aa  189  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0491  cupin 4 family protein  31.38 
 
 		 373 aa  188  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2988  cupin family protein  29.84 
 
 		 373 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1285  Cupin 4 family protein  31.83 
 
 		 373 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3067  cupin 4 family protein  29.84 
 
 		 373 aa  188  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1144  cupin 4  34.65 
 
 		 390 aa  187  3e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.929566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2011  cupin 4 family protein  34.49 
 
 		 373 aa  187  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0220075 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0502  cupin 4 family protein  31.1 
 
 		 373 aa  187  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2408  cupin 4 family protein  32.17 
 
 		 380 aa  186  5e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0501658  hitchhiker  0.000275258 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1825  cupin 4  31.93 
 
 		 376 aa  186  6e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1864  Cupin 4 family protein  37.05 
 
 		 373 aa  186  7e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1557  cupin 4 family protein  34.23 
 
 		 386 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.215237  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>