151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0473 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0473  Cupin 4 family protein  100 
 
 
373 aa  765    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1285  Cupin 4 family protein  85.52 
 
 
373 aa  667    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1408  Cupin 4 family protein  85.25 
 
 
374 aa  669    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0392  Cupin 4 family protein  96.25 
 
 
373 aa  739    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0491  cupin 4 family protein  84.45 
 
 
373 aa  665    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2988  cupin family protein  85.52 
 
 
373 aa  676    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0502  cupin 4 family protein  86.06 
 
 
373 aa  668    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3067  cupin 4 family protein  85.79 
 
 
373 aa  678    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1569  cupin family protein  68.28 
 
 
373 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486119  hitchhiker  0.00000357486 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01126  hypothetical protein  68.28 
 
 
373 aa  537  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2519  Cupin 4 family protein  68.28 
 
 
373 aa  537  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0666495  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1997  cupin family protein  68.28 
 
 
373 aa  537  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.446284 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1306  cupin family protein  68.28 
 
 
373 aa  537  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01134  hypothetical protein  68.28 
 
 
373 aa  537  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1641  cupin 4 family protein  67.02 
 
 
373 aa  535  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1248  cupin family protein  68.28 
 
 
373 aa  537  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1291  cupin family protein  68.28 
 
 
373 aa  537  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2475  cupin 4 family protein  68.28 
 
 
373 aa  537  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1955  cupin family protein  65.86 
 
 
373 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.280047  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2137  cupin family protein  65.86 
 
 
373 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0624468 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1330  cupin family protein  65.86 
 
 
373 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.233449  normal  0.341936 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1308  cupin family protein  65.59 
 
 
373 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.579202  normal  0.591966 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1346  cupin family protein  65.59 
 
 
373 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.986526 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2011  cupin 4 family protein  63.81 
 
 
373 aa  515  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0220075 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1606  cupin family protein  64.34 
 
 
373 aa  511  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2857  hypothetical protein  64.61 
 
 
373 aa  512  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1713  cupin 4 family protein  64.34 
 
 
373 aa  511  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1937  Cupin 4 family protein  62.8 
 
 
373 aa  506  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1864  Cupin 4 family protein  60.65 
 
 
373 aa  498  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2149  Cupin 4 family protein  59.84 
 
 
373 aa  491  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2068  Cupin 4 family protein  59.84 
 
 
373 aa  478  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0960  cupin 4 family protein  48.66 
 
 
375 aa  373  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.786571  normal  0.101373 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1952  hypothetical protein  45.12 
 
 
390 aa  353  2e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2133  hypothetical protein  44.88 
 
 
383 aa  343  2.9999999999999997e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.764598  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2000  cupin 4 family protein  43.42 
 
 
381 aa  340  2e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2408  cupin 4 family protein  43.46 
 
 
380 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0501658  hitchhiker  0.000275258 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2354  cupin 4 family protein  45.97 
 
 
385 aa  332  5e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2343  cupin 4 family protein  45.97 
 
 
385 aa  332  9e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2459  cupin 4 family protein  45.97 
 
 
385 aa  332  9e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.378112  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2004  Cupin 4 family protein  45.71 
 
 
385 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.367195  hitchhiker  0.0000511749 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2199  cupin 4 family protein  42.16 
 
 
381 aa  330  3e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00219592  hitchhiker  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1908  cupin 4 family protein  45.55 
 
 
386 aa  326  3e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2236  cupin 4 family protein  42.78 
 
 
379 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.817609  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1870  Cupin 4 family protein  42.78 
 
 
379 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000786372  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2474  cupin 4 family protein  42.52 
 
 
379 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030086  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2594  cupin 4 family protein  43.98 
 
 
379 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46128  normal  0.0566469 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2636  hypothetical protein  44.83 
 
 
380 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2481  cupin 4 family protein  43.98 
 
 
379 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2541  cupin 4 family protein  42.89 
 
 
376 aa  311  1e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2263  cupin 4 family protein  42.18 
 
 
380 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1744  cupin 4 family protein  43.77 
 
 
379 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2708  cupin 4 family protein  42.18 
 
 
374 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.112259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1675  cupin 4 family protein  43.77 
 
 
379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1825  cupin 4  43.12 
 
 
376 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1600  cupin 4 family protein  41.69 
 
 
379 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1557  cupin 4 family protein  45.57 
 
 
386 aa  291  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.215237  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2065  cupin 4  46.67 
 
 
372 aa  281  1e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.439804  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2383  cupin 4  38.61 
 
 
389 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2447  cupin 4  39.41 
 
 
397 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2403  cupin 4 family protein  38.99 
 
 
388 aa  249  8e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.969826  normal  0.0823577 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1765  cupin 4 family protein  37.6 
 
 
383 aa  243  3e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0255627  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02373  putative enzyme with RmlC-like domain  36.89 
 
 
388 aa  243  3.9999999999999997e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.965281  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3421  cupin 4 family protein  38.46 
 
 
388 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3622  cupin 4 family protein  42.44 
 
 
388 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1816  cupin 4 family protein  42.44 
 
 
388 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal  0.222085 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4017  cupin 4 family protein  42.12 
 
 
390 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593926  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28390  clavaminate synthase-like superfamily protein  41.3 
 
 
388 aa  238  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3361  hypothetical protein  37.93 
 
 
388 aa  235  8e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.036154  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3193  transcription factor jumonji, jmjC  37.4 
 
 
388 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.021443 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30100  hypothetical protein  36.03 
 
 
389 aa  232  6e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2577  hypothetical protein  36.03 
 
 
389 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0294442  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3599  transcription factor jumonji, jmjC  36.77 
 
 
391 aa  223  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.404465  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0838  cupin 4  36.7 
 
 
392 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000238733  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0982  cupin 4  36.7 
 
 
392 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000496862  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0038  Cupin 4 family protein  36.39 
 
 
392 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2628  Cupin 4 family protein  38.36 
 
 
471 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.229429  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0891  hypothetical protein  39.87 
 
 
422 aa  211  1e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.637321  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01200  transcription factor jumonji, JmjC  37.5 
 
 
498 aa  211  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0804  cupin 4 family protein  39.87 
 
 
422 aa  211  2e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3269  cupin 4 family protein  36.16 
 
 
400 aa  209  7e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00540912 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1143  cupin region  34.17 
 
 
415 aa  206  5e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000830013  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1850  Cupin 4 family protein  37.08 
 
 
397 aa  205  9e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.469672  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1874  hypothetical protein  33.77 
 
 
395 aa  202  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1674  hypothetical protein  34.99 
 
 
383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1865  hypothetical protein  33.51 
 
 
395 aa  198  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1404  Cupin 4 family protein  38.91 
 
 
397 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1614  hypothetical protein  33.23 
 
 
382 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000816657  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1132  transcription factor jumonji, jmjC  36.43 
 
 
401 aa  189  5e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5986  cupin 4  36.02 
 
 
406 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.143009  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2091  cupin 4 family protein  36.02 
 
 
406 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0444344  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2110  cupin 4 family protein  35.94 
 
 
406 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.191653  hitchhiker  0.00823788 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2001  cupin 4 family protein  35.71 
 
 
406 aa  185  9e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.484534  hitchhiker  0.000000254865 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1108  cupin region  34.48 
 
 
402 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1402  cupin 4 family protein  32.58 
 
 
370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  hitchhiker  0.000000587517 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2523  Cupin 4 family protein  33.75 
 
 
368 aa  182  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000942208  decreased coverage  0.00000000060733 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1183  cupin 4 family protein  35.09 
 
 
408 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0687664  hitchhiker  0.0000384717 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0585  hypothetical protein  35.53 
 
 
377 aa  181  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.269935  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1274  Cupin 4 family protein  35.29 
 
 
385 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2127  cupin 4 family protein  35.29 
 
 
407 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14925  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1332  cupin 4 family protein  33.71 
 
 
378 aa  181  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>