147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1402 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1402  cupin 4 family protein  100 
 
 		 370 aa  757    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  hitchhiker  0.000000587517 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2523  Cupin 4 family protein  80.76 
 
 		 368 aa  625  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000942208  decreased coverage  0.00000000060733 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1614  hypothetical protein  80.22 
 
 		 382 aa  619  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000816657  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1910  hypothetical protein  71.35 
 
 		 422 aa  554  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507646  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2694  cupin superfamily protein family  72.09 
 
 		 422 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5397  cupin domain-containing protein  70.92 
 
 		 406 aa  548  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705727  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5986  cupin 4  70.65 
 
 		 406 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.143009  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2091  cupin 4 family protein  70.65 
 
 		 406 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0444344  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2562  cupin domain-containing protein  71.82 
 
 		 395 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245241  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2615  cupin domain-containing protein  72.09 
 
 		 395 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2177  hypothetical protein  71.82 
 
 		 395 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0429596  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3141  hypothetical protein  71.82 
 
 		 407 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1450  hypothetical protein  71.82 
 
 		 395 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.90536  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2110  cupin 4 family protein  71.74 
 
 		 406 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.191653  hitchhiker  0.00823788 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2001  cupin 4 family protein  70.92 
 
 		 406 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.484534  hitchhiker  0.000000254865 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2127  cupin 4 family protein  70.73 
 
 		 407 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14925  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1183  cupin 4 family protein  70.11 
 
 		 408 aa  536  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0687664  hitchhiker  0.0000384717 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1108  cupin region  57.22 
 
 		 402 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1072  cupin 4  56.18 
 
 		 375 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.474375  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1148  hypothetical protein  53.37 
 
 		 409 aa  368  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0920  Cupin 4 family protein  53.8 
 
 		 373 aa  365  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1332  cupin 4 family protein  53.8 
 
 		 378 aa  365  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0990  Cupin 4 family protein  54.03 
 
 		 375 aa  358  8e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.210343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1086  Cupin 4 family protein  53.76 
 
 		 409 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2644  cupin 4  51.74 
 
 		 384 aa  354  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3437  Cupin 4 family protein  53.62 
 
 		 381 aa  350  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1191  cupin 4 family protein  48.19 
 
 		 413 aa  350  3e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327917  normal  0.915059 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1005  cupin 4 family protein  54.08 
 
 		 373 aa  347  3e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5092  cupin 4 family protein  49.46 
 
 		 376 aa  342  4e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581531  normal  0.0289513 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2568  hypothetical protein  50.41 
 
 		 382 aa  340  2e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0838  cupin 4  47.57 
 
 		 392 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000238733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0982  cupin 4  47.57 
 
 		 392 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000496862  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3175  cupin 4  51.17 
 
 		 408 aa  338  9.999999999999999e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1143  cupin region  47.12 
 
 		 415 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000830013  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2658  cupin 4 family protein  51.89 
 
 		 393 aa  337  1.9999999999999998e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0302893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2642  cupin 4 family protein  47.99 
 
 		 418 aa  316  5e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0585  hypothetical protein  45.48 
 
 		 377 aa  311  2e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.269935  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0850  cupin 4 family protein  46.19 
 
 		 410 aa  300  2e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0989  Cupin 4 family protein  44.13 
 
 		 410 aa  285  9e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0764478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2403  cupin 4 family protein  48.03 
 
 		 388 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.969826  normal  0.0823577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3361  hypothetical protein  47.52 
 
 		 388 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.036154  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3599  transcription factor jumonji, jmjC  48.74 
 
 		 391 aa  242  6e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.404465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2577  hypothetical protein  45.33 
 
 		 389 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0294442  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3193  transcription factor jumonji, jmjC  47.16 
 
 		 388 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.021443 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30100  hypothetical protein  44.98 
 
 		 389 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1816  cupin 4 family protein  45.62 
 
 		 388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal  0.222085 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1765  cupin 4 family protein  39.64 
 
 		 383 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0255627  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28390  clavaminate synthase-like superfamily protein  45.88 
 
 		 388 aa  233  5e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1674  hypothetical protein  44.37 
 
 		 383 aa  232  9e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3622  cupin 4 family protein  45.26 
 
 		 388 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4017  cupin 4 family protein  45.26 
 
 		 390 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593926  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3421  cupin 4 family protein  44.53 
 
 		 388 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1850  Cupin 4 family protein  46.07 
 
 		 397 aa  225  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.469672  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0038  Cupin 4 family protein  40.78 
 
 		 392 aa  223  6e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1874  hypothetical protein  35.94 
 
 		 395 aa  222  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1865  hypothetical protein  36.01 
 
 		 395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2447  cupin 4  41.56 
 
 		 397 aa  218  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1404  Cupin 4 family protein  37.82 
 
 		 397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01200  transcription factor jumonji, JmjC  41.16 
 
 		 498 aa  212  9e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2628  Cupin 4 family protein  41.43 
 
 		 471 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.229429  normal  0.484388 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01126  hypothetical protein  35.23 
 
 		 373 aa  205  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2519  Cupin 4 family protein  35.23 
 
 		 373 aa  205  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0666495  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1569  cupin family protein  35.23 
 
 		 373 aa  205  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486119  hitchhiker  0.00000357486 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1248  cupin family protein  35.23 
 
 		 373 aa  205  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1291  cupin family protein  35.23 
 
 		 373 aa  205  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01134  hypothetical protein  35.23 
 
 		 373 aa  205  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1306  cupin family protein  35.23 
 
 		 373 aa  205  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2475  cupin 4 family protein  35.23 
 
 		 373 aa  205  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1997  cupin family protein  35.23 
 
 		 373 aa  205  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.446284 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1330  cupin family protein  34.86 
 
 		 373 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.233449  normal  0.341936 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1955  cupin family protein  34.86 
 
 		 373 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.280047  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1308  cupin family protein  34.86 
 
 		 373 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.579202  normal  0.591966 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1346  cupin family protein  34.86 
 
 		 373 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.986526 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0891  hypothetical protein  45.8 
 
 		 422 aa  204  3e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.637321  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1274  Cupin 4 family protein  43.06 
 
 		 385 aa  202  6e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2137  cupin family protein  34.59 
 
 		 373 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0624468 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1132  transcription factor jumonji, jmjC  33.94 
 
 		 401 aa  202  9.999999999999999e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0804  cupin 4 family protein  45.38 
 
 		 422 aa  202  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1864  Cupin 4 family protein  32.97 
 
 		 373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1641  cupin 4 family protein  33.6 
 
 		 373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0491  cupin 4 family protein  37.59 
 
 		 373 aa  196  7e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1606  cupin family protein  35.31 
 
 		 373 aa  195  8.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2149  Cupin 4 family protein  32.95 
 
 		 373 aa  194  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2857  hypothetical protein  35.31 
 
 		 373 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1713  cupin 4 family protein  35.31 
 
 		 373 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2068  Cupin 4 family protein  35.71 
 
 		 373 aa  194  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3269  cupin 4 family protein  46.83 
 
 		 400 aa  192  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540912 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1937  Cupin 4 family protein  34.58 
 
 		 373 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2988  cupin family protein  32.49 
 
 		 373 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2011  cupin 4 family protein  32.61 
 
 		 373 aa  191  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0220075 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0473  Cupin 4 family protein  32.58 
 
 		 373 aa  190  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3067  cupin 4 family protein  32.49 
 
 		 373 aa  190  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1825  cupin 4  33.51 
 
 		 376 aa  187  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0392  Cupin 4 family protein  31.16 
 
 		 373 aa  187  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1408  Cupin 4 family protein  33.23 
 
 		 374 aa  187  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1285  Cupin 4 family protein  33.8 
 
 		 373 aa  187  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0502  cupin 4 family protein  34.16 
 
 		 373 aa  186  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2708  cupin 4 family protein  32.53 
 
 		 374 aa  186  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.112259 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1744  cupin 4 family protein  32.7 
 
 		 379 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2236  cupin 4 family protein  33.15 
 
 		 379 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.817609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>