139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1144 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1247  hypothetical protein  87.95 
 
 		 390 aa  715    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000169648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1144  cupin 4  100 
 
 		 390 aa  797    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.929566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0958  cupin 4 family protein  65.55 
 
 		 391 aa  531  1e-150  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0589089  hitchhiker  0.00146846 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3193  transcription factor jumonji, jmjC  36.34 
 
 		 388 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.021443 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28390  clavaminate synthase-like superfamily protein  35.53 
 
 		 388 aa  226  5.0000000000000005e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3361  hypothetical protein  35.47 
 
 		 388 aa  226  7e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.036154  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30100  hypothetical protein  33.53 
 
 		 389 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4017  cupin 4 family protein  34.29 
 
 		 390 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593926  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2403  cupin 4 family protein  33.43 
 
 		 388 aa  222  9e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.969826  normal  0.0823577 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1816  cupin 4 family protein  34.01 
 
 		 388 aa  222  9e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal  0.222085 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3622  cupin 4 family protein  34.01 
 
 		 388 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2577  hypothetical protein  33.24 
 
 		 389 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0294442  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3599  transcription factor jumonji, jmjC  33.92 
 
 		 391 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.404465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3421  cupin 4 family protein  34.29 
 
 		 388 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0038  Cupin 4 family protein  37.03 
 
 		 392 aa  211  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2447  cupin 4  36.49 
 
 		 397 aa  207  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1765  cupin 4 family protein  34.42 
 
 		 383 aa  206  5e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0255627  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1674  hypothetical protein  33.69 
 
 		 383 aa  203  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1404  Cupin 4 family protein  39.79 
 
 		 397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1874  hypothetical protein  34.05 
 
 		 395 aa  199  7.999999999999999e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1865  hypothetical protein  33.69 
 
 		 395 aa  196  7e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3269  cupin 4 family protein  32.47 
 
 		 400 aa  192  6e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540912 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1850  Cupin 4 family protein  34.39 
 
 		 397 aa  189  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.469672  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1132  transcription factor jumonji, jmjC  34.65 
 
 		 401 aa  187  3e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2000  cupin 4 family protein  32.89 
 
 		 381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2628  Cupin 4 family protein  33.9 
 
 		 471 aa  182  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.229429  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1908  cupin 4 family protein  32.8 
 
 		 386 aa  182  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2133  hypothetical protein  31.22 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.764598  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2004  Cupin 4 family protein  34.42 
 
 		 385 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.367195  hitchhiker  0.0000511749 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2354  cupin 4 family protein  34.12 
 
 		 385 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2343  cupin 4 family protein  34.12 
 
 		 385 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2459  cupin 4 family protein  34.12 
 
 		 385 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.378112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0585  hypothetical protein  31.76 
 
 		 377 aa  175  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.269935  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1952  hypothetical protein  31.58 
 
 		 390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2199  cupin 4 family protein  35.12 
 
 		 381 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00219592  hitchhiker  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1143  cupin region  30.71 
 
 		 415 aa  173  5e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000830013  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01200  transcription factor jumonji, JmjC  38.03 
 
 		 498 aa  172  5.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2519  Cupin 4 family protein  32.27 
 
 		 373 aa  172  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0666495  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01126  hypothetical protein  32.27 
 
 		 373 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01134  hypothetical protein  32.27 
 
 		 373 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1248  cupin family protein  32.27 
 
 		 373 aa  171  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1291  cupin family protein  32.27 
 
 		 373 aa  171  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0502  cupin 4 family protein  31.01 
 
 		 373 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1306  cupin family protein  32.27 
 
 		 373 aa  171  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2475  cupin 4 family protein  32.27 
 
 		 373 aa  171  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1997  cupin family protein  32.27 
 
 		 373 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.446284 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1569  cupin family protein  31.98 
 
 		 373 aa  169  5e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486119  hitchhiker  0.00000357486 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0838  cupin 4  37.95 
 
 		 392 aa  168  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000238733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0982  cupin 4  37.95 
 
 		 392 aa  168  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000496862  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2137  cupin family protein  30.81 
 
 		 373 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0624468 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2594  cupin 4 family protein  30.05 
 
 		 379 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46128  normal  0.0566469 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1955  cupin family protein  30.81 
 
 		 373 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.280047  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1308  cupin family protein  30.81 
 
 		 373 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.579202  normal  0.591966 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1330  cupin family protein  30.81 
 
 		 373 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.233449  normal  0.341936 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2408  cupin 4 family protein  35.47 
 
 		 380 aa  166  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0501658  hitchhiker  0.000275258 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0804  cupin 4 family protein  30 
 
 		 422 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1870  Cupin 4 family protein  30.05 
 
 		 379 aa  166  8e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000786372  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2541  cupin 4 family protein  30.68 
 
 		 376 aa  166  8e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0891  hypothetical protein  30 
 
 		 422 aa  166  8e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.637321  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1557  cupin 4 family protein  31.07 
 
 		 386 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.215237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2474  cupin 4 family protein  29.79 
 
 		 379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030086  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1346  cupin family protein  30.52 
 
 		 373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.986526 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2481  cupin 4 family protein  29.79 
 
 		 379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2068  Cupin 4 family protein  30.17 
 
 		 373 aa  164  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1864  Cupin 4 family protein  30.62 
 
 		 373 aa  164  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2236  cupin 4 family protein  29.24 
 
 		 379 aa  164  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.817609  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2149  Cupin 4 family protein  30.34 
 
 		 373 aa  162  7e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2636  hypothetical protein  30.88 
 
 		 380 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1274  Cupin 4 family protein  37.5 
 
 		 385 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1641  cupin 4 family protein  30.29 
 
 		 373 aa  162  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2708  cupin 4 family protein  31.19 
 
 		 374 aa  161  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.112259 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2263  cupin 4 family protein  31.02 
 
 		 380 aa  160  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2644  cupin 4  29.52 
 
 		 384 aa  160  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0473  Cupin 4 family protein  31.61 
 
 		 373 aa  160  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1744  cupin 4 family protein  30.31 
 
 		 379 aa  160  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1600  cupin 4 family protein  30.47 
 
 		 379 aa  159  9e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0392  Cupin 4 family protein  29.58 
 
 		 373 aa  159  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1675  cupin 4 family protein  30.31 
 
 		 379 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1825  cupin 4  30.59 
 
 		 376 aa  157  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0491  cupin 4 family protein  30.77 
 
 		 373 aa  158  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02373  putative enzyme with RmlC-like domain  31.23 
 
 		 388 aa  157  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.965281  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1606  cupin family protein  29.76 
 
 		 373 aa  156  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2011  cupin 4 family protein  30.09 
 
 		 373 aa  156  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0220075 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1937  Cupin 4 family protein  29.75 
 
 		 373 aa  155  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2857  hypothetical protein  30.36 
 
 		 373 aa  155  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1713  cupin 4 family protein  30.36 
 
 		 373 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2988  cupin family protein  29.3 
 
 		 373 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3067  cupin 4 family protein  29.3 
 
 		 373 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5986  cupin 4  40.55 
 
 		 406 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.143009  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2091  cupin 4 family protein  40.55 
 
 		 406 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0444344  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1332  cupin 4 family protein  35.65 
 
 		 378 aa  152  7e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5397  cupin domain-containing protein  39.72 
 
 		 406 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705727  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0920  Cupin 4 family protein  35.91 
 
 		 373 aa  152  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1408  Cupin 4 family protein  28.33 
 
 		 374 aa  151  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2110  cupin 4 family protein  40.55 
 
 		 406 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.191653  hitchhiker  0.00823788 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1614  hypothetical protein  29.77 
 
 		 382 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000816657  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1285  Cupin 4 family protein  27.84 
 
 		 373 aa  150  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1183  cupin 4 family protein  40.95 
 
 		 408 aa  149  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0687664  hitchhiker  0.0000384717 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2658  cupin 4 family protein  37.33 
 
 		 393 aa  149  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0302893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5092  cupin 4 family protein  36.99 
 
 		 376 aa  149  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581531  normal  0.0289513 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>