151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1908 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2004  Cupin 4 family protein  88.02 
 
 		 385 aa  708    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.367195  hitchhiker  0.0000511749 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2354  cupin 4 family protein  87.76 
 
 		 385 aa  707    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1908  cupin 4 family protein  100 
 
 		 386 aa  792    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2343  cupin 4 family protein  87.5 
 
 		 385 aa  704    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2459  cupin 4 family protein  87.5 
 
 		 385 aa  704    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.378112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2408  cupin 4 family protein  72.3 
 
 		 380 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0501658  hitchhiker  0.000275258 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2199  cupin 4 family protein  71.5 
 
 		 381 aa  580  1e-164  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00219592  hitchhiker  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2000  cupin 4 family protein  70 
 
 		 381 aa  570  1e-161  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2133  hypothetical protein  53.97 
 
 		 383 aa  420  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.764598  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2988  cupin family protein  44.62 
 
 		 373 aa  331  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0502  cupin 4 family protein  46.6 
 
 		 373 aa  330  2e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3067  cupin 4 family protein  44.62 
 
 		 373 aa  330  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1285  Cupin 4 family protein  46.34 
 
 		 373 aa  328  7e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0392  Cupin 4 family protein  45.29 
 
 		 373 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0473  Cupin 4 family protein  45.55 
 
 		 373 aa  326  3e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1408  Cupin 4 family protein  44.09 
 
 		 374 aa  321  9.999999999999999e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0960  cupin 4 family protein  43.57 
 
 		 375 aa  314  9.999999999999999e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.786571  normal  0.101373 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0491  cupin 4 family protein  43.83 
 
 		 373 aa  315  9.999999999999999e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1641  cupin 4 family protein  43.94 
 
 		 373 aa  314  1.9999999999999998e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1864  Cupin 4 family protein  44.47 
 
 		 373 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2149  Cupin 4 family protein  44.74 
 
 		 373 aa  312  6.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1937  Cupin 4 family protein  45.55 
 
 		 373 aa  311  9e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2068  Cupin 4 family protein  43.67 
 
 		 373 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2011  cupin 4 family protein  42.05 
 
 		 373 aa  304  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0220075 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1346  cupin family protein  42.16 
 
 		 373 aa  299  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.986526 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1308  cupin family protein  41.89 
 
 		 373 aa  299  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.579202  normal  0.591966 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1955  cupin family protein  41.89 
 
 		 373 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.280047  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1330  cupin family protein  41.89 
 
 		 373 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.233449  normal  0.341936 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2137  cupin family protein  42.16 
 
 		 373 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0624468 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1952  hypothetical protein  40.7 
 
 		 390 aa  297  2e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1606  cupin family protein  43.01 
 
 		 373 aa  297  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1713  cupin 4 family protein  43.28 
 
 		 373 aa  297  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2857  hypothetical protein  43.01 
 
 		 373 aa  296  3e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2519  Cupin 4 family protein  42.16 
 
 		 373 aa  296  5e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0666495  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1569  cupin family protein  42.16 
 
 		 373 aa  295  8e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486119  hitchhiker  0.00000357486 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01126  hypothetical protein  42.16 
 
 		 373 aa  295  1e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01134  hypothetical protein  42.16 
 
 		 373 aa  295  1e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1306  cupin family protein  42.16 
 
 		 373 aa  295  1e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1248  cupin family protein  42.16 
 
 		 373 aa  295  1e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1291  cupin family protein  42.16 
 
 		 373 aa  295  1e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2475  cupin 4 family protein  42.16 
 
 		 373 aa  295  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1997  cupin family protein  42.16 
 
 		 373 aa  295  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.446284 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2263  cupin 4 family protein  40.64 
 
 		 380 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2541  cupin 4 family protein  39.52 
 
 		 376 aa  278  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1744  cupin 4 family protein  39.08 
 
 		 379 aa  275  7e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2636  hypothetical protein  40.16 
 
 		 380 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1675  cupin 4 family protein  38.81 
 
 		 379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2236  cupin 4 family protein  40.05 
 
 		 379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.817609  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1600  cupin 4 family protein  39.04 
 
 		 379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2474  cupin 4 family protein  39.57 
 
 		 379 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030086  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1870  Cupin 4 family protein  39.62 
 
 		 379 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000786372  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1557  cupin 4 family protein  44.72 
 
 		 386 aa  269  7e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.215237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1825  cupin 4  40.11 
 
 		 376 aa  267  2e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2594  cupin 4 family protein  39.2 
 
 		 379 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46128  normal  0.0566469 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2481  cupin 4 family protein  39.08 
 
 		 379 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2708  cupin 4 family protein  40 
 
 		 374 aa  262  8e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.112259 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2447  cupin 4  39.49 
 
 		 397 aa  249  8e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2065  cupin 4  39.4 
 
 		 372 aa  248  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.439804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1765  cupin 4 family protein  38.05 
 
 		 383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0255627  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02373  putative enzyme with RmlC-like domain  36.46 
 
 		 388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.965281  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3269  cupin 4 family protein  37.12 
 
 		 400 aa  233  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540912 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3421  cupin 4 family protein  35.45 
 
 		 388 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2403  cupin 4 family protein  35.96 
 
 		 388 aa  232  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.969826  normal  0.0823577 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3599  transcription factor jumonji, jmjC  35.96 
 
 		 391 aa  231  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.404465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2383  cupin 4  37.97 
 
 		 389 aa  230  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30100  hypothetical protein  36.48 
 
 		 389 aa  229  7e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0038  Cupin 4 family protein  36.24 
 
 		 392 aa  228  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2577  hypothetical protein  36.22 
 
 		 389 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0294442  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3361  hypothetical protein  36.36 
 
 		 388 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.036154  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3193  transcription factor jumonji, jmjC  36.2 
 
 		 388 aa  226  7e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.021443 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28390  clavaminate synthase-like superfamily protein  35.26 
 
 		 388 aa  226  7e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4017  cupin 4 family protein  34.12 
 
 		 390 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593926  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1816  cupin 4 family protein  34.12 
 
 		 388 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal  0.222085 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3622  cupin 4 family protein  34.3 
 
 		 388 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0838  cupin 4  36.24 
 
 		 392 aa  218  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000238733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0982  cupin 4  36.24 
 
 		 392 aa  218  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000496862  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1143  cupin region  35.77 
 
 		 415 aa  210  3e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000830013  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1850  Cupin 4 family protein  37.05 
 
 		 397 aa  206  5e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.469672  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1404  Cupin 4 family protein  38.77 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1132  transcription factor jumonji, jmjC  33.76 
 
 		 401 aa  203  3e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1274  Cupin 4 family protein  38.11 
 
 		 385 aa  202  9e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1874  hypothetical protein  34.92 
 
 		 395 aa  199  5e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2628  Cupin 4 family protein  34.36 
 
 		 471 aa  199  7e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.229429  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1865  hypothetical protein  34.66 
 
 		 395 aa  198  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0958  cupin 4 family protein  35 
 
 		 391 aa  194  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0589089  hitchhiker  0.00146846 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1674  hypothetical protein  35.1 
 
 		 383 aa  192  7e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1332  cupin 4 family protein  36.39 
 
 		 378 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0585  hypothetical protein  33.99 
 
 		 377 aa  191  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.269935  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5986  cupin 4  34.55 
 
 		 406 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.143009  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2091  cupin 4 family protein  34.55 
 
 		 406 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0444344  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1108  cupin region  36.72 
 
 		 402 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1910  hypothetical protein  33.25 
 
 		 422 aa  187  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507646  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1148  hypothetical protein  37.54 
 
 		 409 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1247  hypothetical protein  31.97 
 
 		 390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000169648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2615  cupin domain-containing protein  33.25 
 
 		 395 aa  183  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2644  cupin 4  35.49 
 
 		 384 aa  182  7e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2694  cupin superfamily protein family  33.25 
 
 		 422 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183857  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1144  cupin 4  32.8 
 
 		 390 aa  182  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.929566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2562  cupin domain-containing protein  33.25 
 
 		 395 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245241  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2001  cupin 4 family protein  32.82 
 
 		 406 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.484534  hitchhiker  0.000000254865 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>