152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1606 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1606  cupin family protein  100 
 
 		 373 aa  766    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2011  cupin 4 family protein  86.06 
 
 		 373 aa  681    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0220075 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2857  hypothetical protein  99.46 
 
 		 373 aa  761    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1713  cupin 4 family protein  99.2 
 
 		 373 aa  760    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1641  cupin 4 family protein  79.09 
 
 		 373 aa  630  1e-179  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1864  Cupin 4 family protein  78.02 
 
 		 373 aa  625  1e-178  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1955  cupin family protein  78.44 
 
 		 373 aa  624  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.280047  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1330  cupin family protein  78.44 
 
 		 373 aa  624  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.233449  normal  0.341936 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01126  hypothetical protein  79.25 
 
 		 373 aa  622  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2519  Cupin 4 family protein  78.98 
 
 		 373 aa  621  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0666495  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01134  hypothetical protein  79.25 
 
 		 373 aa  622  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1997  cupin family protein  79.25 
 
 		 373 aa  622  1e-177  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.446284 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1306  cupin family protein  79.25 
 
 		 373 aa  622  1e-177  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1308  cupin family protein  78.17 
 
 		 373 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.579202  normal  0.591966 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1346  cupin family protein  78.17 
 
 		 373 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.986526 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1569  cupin family protein  78.98 
 
 		 373 aa  621  1e-177  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486119  hitchhiker  0.00000357486 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2137  cupin family protein  78.17 
 
 		 373 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0624468 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1248  cupin family protein  79.25 
 
 		 373 aa  622  1e-177  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1291  cupin family protein  79.25 
 
 		 373 aa  622  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2475  cupin 4 family protein  79.25 
 
 		 373 aa  622  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2149  Cupin 4 family protein  76.94 
 
 		 373 aa  617  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1937  Cupin 4 family protein  76.41 
 
 		 373 aa  599  1e-170  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2068  Cupin 4 family protein  73.46 
 
 		 373 aa  587  1e-167  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0392  Cupin 4 family protein  64.61 
 
 		 373 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1285  Cupin 4 family protein  63.81 
 
 		 373 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3067  cupin 4 family protein  63.81 
 
 		 373 aa  515  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0473  Cupin 4 family protein  64.34 
 
 		 373 aa  511  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2988  cupin family protein  63.54 
 
 		 373 aa  512  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0502  cupin 4 family protein  62.2 
 
 		 373 aa  503  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0491  cupin 4 family protein  61.93 
 
 		 373 aa  501  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1408  Cupin 4 family protein  61.66 
 
 		 374 aa  498  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0960  cupin 4 family protein  48.12 
 
 		 375 aa  364  1e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.786571  normal  0.101373 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1952  hypothetical protein  45.65 
 
 		 390 aa  355  5e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2133  hypothetical protein  42.66 
 
 		 383 aa  332  6e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.764598  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2636  hypothetical protein  43.86 
 
 		 380 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2541  cupin 4 family protein  42.71 
 
 		 376 aa  317  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2000  cupin 4 family protein  41.73 
 
 		 381 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2708  cupin 4 family protein  41.07 
 
 		 374 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.112259 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2236  cupin 4 family protein  43.12 
 
 		 379 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.817609  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1675  cupin 4 family protein  42.04 
 
 		 379 aa  311  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1870  Cupin 4 family protein  43.27 
 
 		 379 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000786372  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2474  cupin 4 family protein  43.54 
 
 		 379 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030086  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2594  cupin 4 family protein  43.01 
 
 		 379 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46128  normal  0.0566469 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1600  cupin 4 family protein  42.44 
 
 		 379 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1744  cupin 4 family protein  42.3 
 
 		 379 aa  310  2e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2481  cupin 4 family protein  43.01 
 
 		 379 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2408  cupin 4 family protein  41.35 
 
 		 380 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0501658  hitchhiker  0.000275258 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1825  cupin 4  41.91 
 
 		 376 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2354  cupin 4 family protein  45.16 
 
 		 385 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2263  cupin 4 family protein  41.33 
 
 		 380 aa  306  3e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2343  cupin 4 family protein  44.15 
 
 		 385 aa  305  6e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2459  cupin 4 family protein  44.15 
 
 		 385 aa  305  6e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.378112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2004  Cupin 4 family protein  44.62 
 
 		 385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.367195  hitchhiker  0.0000511749 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2199  cupin 4 family protein  40.65 
 
 		 381 aa  301  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00219592  hitchhiker  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1908  cupin 4 family protein  43.01 
 
 		 386 aa  297  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1557  cupin 4 family protein  40.31 
 
 		 386 aa  289  6e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.215237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2383  cupin 4  42.25 
 
 		 389 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2065  cupin 4  40.05 
 
 		 372 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.439804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02373  putative enzyme with RmlC-like domain  37.47 
 
 		 388 aa  255  8e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.965281  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2447  cupin 4  38.5 
 
 		 397 aa  251  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2403  cupin 4 family protein  37.8 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.969826  normal  0.0823577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3361  hypothetical protein  37 
 
 		 388 aa  239  5e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.036154  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3193  transcription factor jumonji, jmjC  37.53 
 
 		 388 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.021443 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3622  cupin 4 family protein  35.98 
 
 		 388 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0038  Cupin 4 family protein  36.86 
 
 		 392 aa  236  4e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30100  hypothetical protein  36.1 
 
 		 389 aa  236  6e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1816  cupin 4 family protein  35.71 
 
 		 388 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal  0.222085 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4017  cupin 4 family protein  35.71 
 
 		 390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593926  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28390  clavaminate synthase-like superfamily protein  36.73 
 
 		 388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2577  hypothetical protein  36.1 
 
 		 389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0294442  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1765  cupin 4 family protein  34.54 
 
 		 383 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0255627  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3421  cupin 4 family protein  36.12 
 
 		 388 aa  232  9e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3269  cupin 4 family protein  37.46 
 
 		 400 aa  230  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540912 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0838  cupin 4  41.38 
 
 		 392 aa  226  3e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000238733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0982  cupin 4  41.38 
 
 		 392 aa  226  3e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000496862  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3599  transcription factor jumonji, jmjC  34.49 
 
 		 391 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.404465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0891  hypothetical protein  39.87 
 
 		 422 aa  215  8e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.637321  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1674  hypothetical protein  39.86 
 
 		 383 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0804  cupin 4 family protein  39.54 
 
 		 422 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1404  Cupin 4 family protein  37.04 
 
 		 397 aa  211  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1143  cupin region  34.15 
 
 		 415 aa  211  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000830013  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2628  Cupin 4 family protein  38.44 
 
 		 471 aa  211  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.229429  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01200  transcription factor jumonji, JmjC  36.39 
 
 		 498 aa  208  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1850  Cupin 4 family protein  35.77 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.469672  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1614  hypothetical protein  35.42 
 
 		 382 aa  199  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000816657  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1910  hypothetical protein  33.6 
 
 		 422 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507646  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1183  cupin 4 family protein  34.47 
 
 		 408 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0687664  hitchhiker  0.0000384717 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2001  cupin 4 family protein  34.47 
 
 		 406 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.484534  hitchhiker  0.000000254865 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2615  cupin domain-containing protein  36.92 
 
 		 395 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5986  cupin 4  34.16 
 
 		 406 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.143009  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2091  cupin 4 family protein  34.16 
 
 		 406 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0444344  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2523  Cupin 4 family protein  35.22 
 
 		 368 aa  192  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000942208  decreased coverage  0.00000000060733 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2562  cupin domain-containing protein  37.92 
 
 		 395 aa  192  8e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245241  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2694  cupin superfamily protein family  34.83 
 
 		 422 aa  192  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183857  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2110  cupin 4 family protein  34.64 
 
 		 406 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.191653  hitchhiker  0.00823788 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0585  hypothetical protein  34.06 
 
 		 377 aa  191  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.269935  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1148  hypothetical protein  37.41 
 
 		 409 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1402  cupin 4 family protein  35.31 
 
 		 370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  hitchhiker  0.000000587517 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2177  hypothetical protein  37.12 
 
 		 395 aa  189  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0429596  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1450  hypothetical protein  37.12 
 
 		 395 aa  189  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.90536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>