148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1674 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1674  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  793    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28390  clavaminate synthase-like superfamily protein  53.56 
 
 		 388 aa  319  5e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3361  hypothetical protein  52.11 
 
 		 388 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.036154  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3193  transcription factor jumonji, jmjC  43.49 
 
 		 388 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.021443 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2403  cupin 4 family protein  51.76 
 
 		 388 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.969826  normal  0.0823577 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30100  hypothetical protein  45.21 
 
 		 389 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3599  transcription factor jumonji, jmjC  51.58 
 
 		 391 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.404465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2577  hypothetical protein  50.18 
 
 		 389 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0294442  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1816  cupin 4 family protein  50.35 
 
 		 388 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal  0.222085 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3622  cupin 4 family protein  50.35 
 
 		 388 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3421  cupin 4 family protein  50 
 
 		 388 aa  299  7e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4017  cupin 4 family protein  50 
 
 		 390 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593926  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2447  cupin 4  42.23 
 
 		 397 aa  293  4e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1765  cupin 4 family protein  40.16 
 
 		 383 aa  276  4e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0255627  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1850  Cupin 4 family protein  45.61 
 
 		 397 aa  269  5e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.469672  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0038  Cupin 4 family protein  39.5 
 
 		 392 aa  269  7e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0838  cupin 4  41.19 
 
 		 392 aa  263  3e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000238733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0982  cupin 4  41.19 
 
 		 392 aa  263  3e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000496862  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1865  hypothetical protein  36.68 
 
 		 395 aa  253  3e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1404  Cupin 4 family protein  44.13 
 
 		 397 aa  254  3e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1874  hypothetical protein  36.67 
 
 		 395 aa  252  9.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1143  cupin region  41 
 
 		 415 aa  251  1e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000830013  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1132  transcription factor jumonji, jmjC  43.37 
 
 		 401 aa  245  8e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3269  cupin 4 family protein  40.85 
 
 		 400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540912 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1614  hypothetical protein  43.54 
 
 		 382 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000816657  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0585  hypothetical protein  37.5 
 
 		 377 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.269935  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1072  cupin 4  37.91 
 
 		 375 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.474375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2523  Cupin 4 family protein  39.77 
 
 		 368 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000942208  decreased coverage  0.00000000060733 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1108  cupin region  37.03 
 
 		 402 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2644  cupin 4  36.27 
 
 		 384 aa  233  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2628  Cupin 4 family protein  37.33 
 
 		 471 aa  233  4.0000000000000004e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.229429  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01200  transcription factor jumonji, JmjC  37.28 
 
 		 498 aa  233  6e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1910  hypothetical protein  41.61 
 
 		 422 aa  229  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507646  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0804  cupin 4 family protein  36.41 
 
 		 422 aa  229  8e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0891  hypothetical protein  36.41 
 
 		 422 aa  229  8e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.637321  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0920  Cupin 4 family protein  39.41 
 
 		 373 aa  227  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2636  hypothetical protein  37.17 
 
 		 380 aa  226  4e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1952  hypothetical protein  40.88 
 
 		 390 aa  226  4e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1402  cupin 4 family protein  44.37 
 
 		 370 aa  226  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  hitchhiker  0.000000587517 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2694  cupin superfamily protein family  37.75 
 
 		 422 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183857  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2562  cupin domain-containing protein  37.75 
 
 		 395 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245241  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2615  cupin domain-containing protein  37.75 
 
 		 395 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5092  cupin 4 family protein  37.03 
 
 		 376 aa  223  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581531  normal  0.0289513 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1332  cupin 4 family protein  38.24 
 
 		 378 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1148  hypothetical protein  37.95 
 
 		 409 aa  220  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3141  hypothetical protein  37.1 
 
 		 407 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5986  cupin 4  38.37 
 
 		 406 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.143009  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2091  cupin 4 family protein  38.37 
 
 		 406 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0444344  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2177  hypothetical protein  37.46 
 
 		 395 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0429596  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1450  hypothetical protein  37.46 
 
 		 395 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.90536  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5397  cupin domain-containing protein  37.6 
 
 		 406 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705727  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2110  cupin 4 family protein  40.34 
 
 		 406 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.191653  hitchhiker  0.00823788 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0958  cupin 4 family protein  36.36 
 
 		 391 aa  218  1e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0589089  hitchhiker  0.00146846 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1247  hypothetical protein  36.75 
 
 		 390 aa  218  2e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000169648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2001  cupin 4 family protein  37.9 
 
 		 406 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.484534  hitchhiker  0.000000254865 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1183  cupin 4 family protein  37.85 
 
 		 408 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0687664  hitchhiker  0.0000384717 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1641  cupin 4 family protein  36.62 
 
 		 373 aa  217  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1744  cupin 4 family protein  35.69 
 
 		 379 aa  216  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2568  hypothetical protein  34.6 
 
 		 382 aa  216  4e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2011  cupin 4 family protein  38.79 
 
 		 373 aa  216  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0220075 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1600  cupin 4 family protein  35.99 
 
 		 379 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1675  cupin 4 family protein  35.69 
 
 		 379 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1606  cupin family protein  39.86 
 
 		 373 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1274  Cupin 4 family protein  39.36 
 
 		 385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2127  cupin 4 family protein  37.61 
 
 		 407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14925  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2658  cupin 4 family protein  46.88 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0302893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2236  cupin 4 family protein  36.58 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.817609  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1825  cupin 4  36.67 
 
 		 376 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1937  Cupin 4 family protein  35.47 
 
 		 373 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2857  hypothetical protein  39.5 
 
 		 373 aa  213  4.9999999999999996e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1713  cupin 4 family protein  39.5 
 
 		 373 aa  213  4.9999999999999996e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1086  Cupin 4 family protein  39.59 
 
 		 409 aa  212  7e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2474  cupin 4 family protein  36.28 
 
 		 379 aa  213  7e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030086  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1864  Cupin 4 family protein  40.07 
 
 		 373 aa  211  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1870  Cupin 4 family protein  35.99 
 
 		 379 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000786372  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0960  cupin 4 family protein  35.88 
 
 		 375 aa  211  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.786571  normal  0.101373 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2594  cupin 4 family protein  35.99 
 
 		 379 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46128  normal  0.0566469 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2149  Cupin 4 family protein  40.43 
 
 		 373 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2481  cupin 4 family protein  35.99 
 
 		 379 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0491  cupin 4 family protein  37 
 
 		 373 aa  210  4e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2068  Cupin 4 family protein  38.63 
 
 		 373 aa  209  6e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0990  Cupin 4 family protein  40.36 
 
 		 375 aa  209  8e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.210343 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1005  cupin 4 family protein  38.12 
 
 		 373 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0392  Cupin 4 family protein  36.15 
 
 		 373 aa  207  4e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2263  cupin 4 family protein  33.93 
 
 		 380 aa  206  8e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1408  Cupin 4 family protein  34.9 
 
 		 374 aa  205  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1285  Cupin 4 family protein  35.57 
 
 		 373 aa  204  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1308  cupin family protein  37.82 
 
 		 373 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.579202  normal  0.591966 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2642  cupin 4 family protein  33.81 
 
 		 418 aa  204  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3067  cupin 4 family protein  35.5 
 
 		 373 aa  204  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1330  cupin family protein  37.82 
 
 		 373 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.233449  normal  0.341936 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1144  cupin 4  33.69 
 
 		 390 aa  203  4e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.929566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1955  cupin family protein  37.82 
 
 		 373 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.280047  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2988  cupin family protein  38.77 
 
 		 373 aa  203  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0502  cupin 4 family protein  36.05 
 
 		 373 aa  203  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2137  cupin family protein  37.82 
 
 		 373 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0624468 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2541  cupin 4 family protein  35.47 
 
 		 376 aa  203  5e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1346  cupin family protein  37.45 
 
 		 373 aa  202  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.986526 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2065  cupin 4  32.43 
 
 		 372 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.439804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3437  Cupin 4 family protein  34.77 
 
 		 381 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>