91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45348 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_45348  predicted protein  100 
 
 		 481 aa  999    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1708  hypothetical protein  30.58 
 
 		 397 aa  94.7  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0385  cupin 4  32.8 
 
 		 392 aa  92  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3066  Cupin 4 family protein  31.25 
 
 		 452 aa  90.9  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  hitchhiker  0.00228521 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2302  cupin 4 family protein  28.79 
 
 		 432 aa  89.7  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0977306  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14981  predicted protein  36.36 
 
 		 351 aa  89.4  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2428  cupin 4 family protein  31.35 
 
 		 394 aa  89.7  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02500  Cupin superfamily protein  34.83 
 
 		 414 aa  86.7  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2909  Cupin 4 family protein  30.69 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2151  cupin 4 family protein  31.63 
 
 		 496 aa  81.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247247  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1339  Cupin 4 family protein  33.9 
 
 		 434 aa  80.1  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.696496  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5630  cupin 4 family protein  35.97 
 
 		 404 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.533226 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5250  cupin 4  35.25 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.109199  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5339  cupin 4 family protein  35.25 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.77653  normal  0.333851 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3279  Cupin 4 family protein  34.72 
 
 		 436 aa  77  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0373  hypothetical protein  30.05 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.373081 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3059  cupin 4 family protein  27.36 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211157  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1529  Cupin 4 family protein  29.8 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.567254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0337  cupin 4 family protein  33.82 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4378  cupin 4 family protein  32.1 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1857  hypothetical protein  29.61 
 
 		 395 aa  67  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335047  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1460  hypothetical protein  29.25 
 
 		 209 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.866672 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15879  predicted protein  33.66 
 
 		 515 aa  66.2  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3032  cupin 4  28.26 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0159331  hitchhiker  0.00213714 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1864  Cupin 4 family protein  26.49 
 
 		 373 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2149  Cupin 4 family protein  26.85 
 
 		 373 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46687  predicted protein  30.95 
 
 		 626 aa  55.1  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2875  cupin 4 family protein  33.02 
 
 		 384 aa  53.5  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.0729467 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0394  cupin 4  30.06 
 
 		 406 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8956  Cupin 4 family protein  33.33 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0960  cupin 4 family protein  25.81 
 
 		 375 aa  53.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.786571  normal  0.101373 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2481  cupin 4 family protein  29.73 
 
 		 379 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1870  Cupin 4 family protein  29.73 
 
 		 379 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000786372  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2236  cupin 4 family protein  29.73 
 
 		 379 aa  51.6  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.817609  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1937  Cupin 4 family protein  27.73 
 
 		 373 aa  51.6  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2474  cupin 4 family protein  29.73 
 
 		 379 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030086  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1641  cupin 4 family protein  26.98 
 
 		 373 aa  51.2  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2594  cupin 4 family protein  29.73 
 
 		 379 aa  51.6  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46128  normal  0.0566469 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2011  cupin 4 family protein  26.05 
 
 		 373 aa  50.1  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0220075 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0823  cupin region  34.48 
 
 		 301 aa  49.7  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2068  Cupin 4 family protein  26.89 
 
 		 373 aa  49.7  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3269  cupin 4 family protein  27.1 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540912 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1675  cupin 4 family protein  30.65 
 
 		 379 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2636  hypothetical protein  29.03 
 
 		 380 aa  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1744  cupin 4 family protein  30.65 
 
 		 379 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1600  cupin 4 family protein  30.65 
 
 		 379 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1952  hypothetical protein  30.53 
 
 		 390 aa  47.4  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2988  cupin family protein  33.33 
 
 		 373 aa  47  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3067  cupin 4 family protein  33.33 
 
 		 373 aa  47  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5269  Cupin 4 family protein  32.2 
 
 		 395 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242855  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0473  Cupin 4 family protein  33.33 
 
 		 373 aa  46.6  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33394  predicted protein  29.17 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.551934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2642  cupin 4 family protein  35.37 
 
 		 418 aa  46.2  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1955  cupin family protein  30.43 
 
 		 373 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.280047  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2519  Cupin 4 family protein  30.43 
 
 		 373 aa  45.8  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0666495  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2137  cupin family protein  30.43 
 
 		 373 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0624468 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1308  cupin family protein  30.43 
 
 		 373 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.579202  normal  0.591966 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1569  cupin family protein  30.43 
 
 		 373 aa  45.8  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486119  hitchhiker  0.00000357486 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01134  hypothetical protein  30.43 
 
 		 373 aa  45.8  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1825  cupin 4  28.47 
 
 		 376 aa  45.8  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1346  cupin family protein  30.43 
 
 		 373 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.986526 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1330  cupin family protein  30.43 
 
 		 373 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.233449  normal  0.341936 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1306  cupin family protein  30.43 
 
 		 373 aa  45.8  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1997  cupin family protein  30.43 
 
 		 373 aa  45.8  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.446284 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2475  cupin 4 family protein  30.43 
 
 		 373 aa  45.8  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1248  cupin family protein  30.43 
 
 		 373 aa  45.8  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1291  cupin family protein  30.43 
 
 		 373 aa  45.8  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2408  cupin 4 family protein  28.33 
 
 		 380 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0501658  hitchhiker  0.000275258 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01126  hypothetical protein  30.43 
 
 		 373 aa  45.8  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0392  Cupin 4 family protein  32.1 
 
 		 373 aa  45.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1908  cupin 4 family protein  28.23 
 
 		 386 aa  45.1  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1606  cupin family protein  26.56 
 
 		 373 aa  44.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0038  Cupin 4 family protein  30.15 
 
 		 392 aa  44.7  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0491  cupin 4 family protein  30.23 
 
 		 373 aa  44.3  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1713  cupin 4 family protein  26.56 
 
 		 373 aa  44.3  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1404  Cupin 4 family protein  37.63 
 
 		 397 aa  44.3  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2263  cupin 4 family protein  27.97 
 
 		 380 aa  44.3  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2857  hypothetical protein  25.78 
 
 		 373 aa  44.3  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02373  putative enzyme with RmlC-like domain  28.74 
 
 		 388 aa  43.9  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.965281  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2004  Cupin 4 family protein  27.42 
 
 		 385 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.367195  hitchhiker  0.0000511749 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1850  Cupin 4 family protein  31.82 
 
 		 397 aa  44.3  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.469672  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2343  cupin 4 family protein  27.42 
 
 		 385 aa  43.9  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2354  cupin 4 family protein  27.42 
 
 		 385 aa  43.9  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2459  cupin 4 family protein  27.42 
 
 		 385 aa  43.9  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.378112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1408  Cupin 4 family protein  30.86 
 
 		 374 aa  43.9  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1144  cupin 4  27.69 
 
 		 390 aa  43.5  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.929566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0502  cupin 4 family protein  30.86 
 
 		 373 aa  43.5  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1247  hypothetical protein  28.46 
 
 		 390 aa  43.5  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000169648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4326  hypothetical protein  25.5 
 
 		 338 aa  43.1  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43870  predicted protein  27.22 
 
 		 549 aa  43.1  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1285  Cupin 4 family protein  30.86 
 
 		 373 aa  43.1  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>