106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0337 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0337  cupin 4 family protein  100 
 
 		 402 aa  793    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5250  cupin 4  68.5 
 
 		 404 aa  534  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.109199  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5339  cupin 4 family protein  68.5 
 
 		 404 aa  534  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.77653  normal  0.333851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5630  cupin 4 family protein  68.5 
 
 		 404 aa  535  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.533226 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2909  Cupin 4 family protein  59.4 
 
 		 414 aa  441  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3066  Cupin 4 family protein  47.77 
 
 		 452 aa  340  4e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  hitchhiker  0.00228521 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2151  cupin 4 family protein  44.31 
 
 		 496 aa  297  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247247  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3279  Cupin 4 family protein  45.89 
 
 		 436 aa  292  6e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2302  cupin 4 family protein  45.21 
 
 		 432 aa  290  4e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0977306  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02500  Cupin superfamily protein  46.15 
 
 		 414 aa  234  1.0000000000000001e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1339  Cupin 4 family protein  40.72 
 
 		 434 aa  202  6e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.696496  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4378  cupin 4 family protein  36.73 
 
 		 403 aa  168  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0385  cupin 4  37.7 
 
 		 392 aa  146  6e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3032  cupin 4  31.2 
 
 		 385 aa  140  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0159331  hitchhiker  0.00213714 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2428  cupin 4 family protein  28.21 
 
 		 394 aa  129  9.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0373  hypothetical protein  31.43 
 
 		 428 aa  120  3.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.373081 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5269  Cupin 4 family protein  33.77 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242855  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1529  Cupin 4 family protein  29.84 
 
 		 400 aa  106  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.567254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1857  hypothetical protein  31.72 
 
 		 395 aa  102  8e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335047  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3059  cupin 4 family protein  29.65 
 
 		 298 aa  92  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211157  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15879  predicted protein  41.9 
 
 		 515 aa  85.5  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0394  cupin 4  31.25 
 
 		 406 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8956  Cupin 4 family protein  29.66 
 
 		 395 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2875  cupin 4 family protein  26.91 
 
 		 384 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.0729467 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14981  predicted protein  42.59 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2408  cupin 4 family protein  25.19 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0501658  hitchhiker  0.000275258 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3174  cupin 4 family protein  24.17 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1708  hypothetical protein  29.93 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2199  cupin 4 family protein  27.6 
 
 		 381 aa  72  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00219592  hitchhiker  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2000  cupin 4 family protein  27.47 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45348  predicted protein  33.82 
 
 		 481 aa  68.6  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1132  transcription factor jumonji, jmjC  26.67 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3269  cupin 4 family protein  29.7 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540912 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2354  cupin 4 family protein  28.57 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2343  cupin 4 family protein  28.57 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2459  cupin 4 family protein  28.57 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.378112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1460  hypothetical protein  24.87 
 
 		 209 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.866672 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1908  cupin 4 family protein  28.91 
 
 		 386 aa  62.4  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2004  Cupin 4 family protein  28.19 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.367195  hitchhiker  0.0000511749 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2642  cupin 4 family protein  26.91 
 
 		 418 aa  60.5  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2541  cupin 4 family protein  22.13 
 
 		 376 aa  60.1  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2263  cupin 4 family protein  20.65 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1557  cupin 4 family protein  23.08 
 
 		 386 aa  58.2  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.215237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2708  cupin 4 family protein  31.08 
 
 		 374 aa  56.2  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.112259 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1404  Cupin 4 family protein  27.44 
 
 		 397 aa  56.2  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0038  Cupin 4 family protein  26.93 
 
 		 392 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2594  cupin 4 family protein  23.55 
 
 		 379 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46128  normal  0.0566469 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0920  Cupin 4 family protein  27.92 
 
 		 373 aa  54.7  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1274  Cupin 4 family protein  29.68 
 
 		 385 aa  53.9  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1825  cupin 4  24.85 
 
 		 376 aa  53.9  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2065  cupin 4  26.18 
 
 		 372 aa  53.9  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.439804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1870  Cupin 4 family protein  23.55 
 
 		 379 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000786372  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1600  cupin 4 family protein  20.99 
 
 		 379 aa  53.5  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2474  cupin 4 family protein  23.55 
 
 		 379 aa  53.1  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030086  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1675  cupin 4 family protein  20.74 
 
 		 379 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1744  cupin 4 family protein  23.14 
 
 		 379 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2481  cupin 4 family protein  23.55 
 
 		 379 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2236  cupin 4 family protein  23.55 
 
 		 379 aa  52.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.817609  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2636  hypothetical protein  25.85 
 
 		 380 aa  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2644  cupin 4  25.47 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45966  predicted protein  22.84 
 
 		 492 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02373  putative enzyme with RmlC-like domain  33.33 
 
 		 388 aa  51.6  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.965281  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2383  cupin 4  35.29 
 
 		 389 aa  50.4  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0958  cupin 4 family protein  24.04 
 
 		 391 aa  50.4  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0589089  hitchhiker  0.00146846 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1641  cupin 4 family protein  26.78 
 
 		 373 aa  50.1  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2011  cupin 4 family protein  32.35 
 
 		 373 aa  50.1  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0220075 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0960  cupin 4 family protein  24.08 
 
 		 375 aa  48.9  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.786571  normal  0.101373 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46687  predicted protein  27.87 
 
 		 626 aa  49.3  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2447  cupin 4  26.06 
 
 		 397 aa  48.1  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2568  hypothetical protein  32.71 
 
 		 382 aa  48.9  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1952  hypothetical protein  22.11 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1850  Cupin 4 family protein  28.12 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.469672  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1606  cupin family protein  29.41 
 
 		 373 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2857  hypothetical protein  29.41 
 
 		 373 aa  47.8  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1713  cupin 4 family protein  29.41 
 
 		 373 aa  47.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2149  Cupin 4 family protein  30.48 
 
 		 373 aa  46.2  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1143  cupin region  23.01 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000830013  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3421  cupin 4 family protein  24.28 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1330  cupin family protein  30.48 
 
 		 373 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.233449  normal  0.341936 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1308  cupin family protein  30.48 
 
 		 373 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.579202  normal  0.591966 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1955  cupin family protein  30.48 
 
 		 373 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.280047  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2137  cupin family protein  30.48 
 
 		 373 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0624468 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28390  clavaminate synthase-like superfamily protein  31.01 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1937  Cupin 4 family protein  30.39 
 
 		 373 aa  45.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1864  Cupin 4 family protein  29.41 
 
 		 373 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01126  hypothetical protein  30.48 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2519  Cupin 4 family protein  30.48 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0666495  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2577  hypothetical protein  26.24 
 
 		 389 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0294442  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1248  cupin family protein  30.48 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1291  cupin family protein  30.48 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2475  cupin 4 family protein  30.48 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1997  cupin family protein  30.48 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.446284 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1306  cupin family protein  30.48 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1569  cupin family protein  30.48 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486119  hitchhiker  0.00000357486 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2068  Cupin 4 family protein  31.43 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01134  hypothetical protein  30.48 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0392  Cupin 4 family protein  27.93 
 
 		 373 aa  44.3  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0491  cupin 4 family protein  31.25 
 
 		 373 aa  44.3  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1346  cupin family protein  29.41 
 
 		 373 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.986526 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1285  Cupin 4 family protein  30.3 
 
 		 373 aa  44.3  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>