39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1529 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1529  Cupin 4 family protein  100 
 
 		 400 aa  790    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.567254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1857  hypothetical protein  64 
 
 		 395 aa  500  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335047  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5269  Cupin 4 family protein  40 
 
 		 395 aa  202  8e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242855  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8956  Cupin 4 family protein  38.3 
 
 		 395 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0394  cupin 4  30.81 
 
 		 406 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0373  hypothetical protein  27.37 
 
 		 428 aa  130  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.373081 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3174  cupin 4 family protein  30.34 
 
 		 303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2909  Cupin 4 family protein  31.92 
 
 		 414 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5250  cupin 4  30.63 
 
 		 404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.109199  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5339  cupin 4 family protein  30.63 
 
 		 404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.77653  normal  0.333851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5630  cupin 4 family protein  30.33 
 
 		 404 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.533226 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3066  Cupin 4 family protein  25.91 
 
 		 452 aa  109  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  hitchhiker  0.00228521 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3279  Cupin 4 family protein  33.19 
 
 		 436 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2151  cupin 4 family protein  30.7 
 
 		 496 aa  107  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247247  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3059  cupin 4 family protein  27.98 
 
 		 298 aa  106  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211157  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3032  cupin 4  30.13 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0159331  hitchhiker  0.00213714 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0337  cupin 4 family protein  29.84 
 
 		 402 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02500  Cupin superfamily protein  30.49 
 
 		 414 aa  100  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1339  Cupin 4 family protein  31.06 
 
 		 434 aa  100  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.696496  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2428  cupin 4 family protein  29.43 
 
 		 394 aa  98.2  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2302  cupin 4 family protein  30.08 
 
 		 432 aa  96.7  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0977306  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4378  cupin 4 family protein  28.37 
 
 		 403 aa  96.3  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0385  cupin 4  28.57 
 
 		 392 aa  90.1  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1708  hypothetical protein  31.69 
 
 		 397 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2875  cupin 4 family protein  25.23 
 
 		 384 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.0729467 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14981  predicted protein  35.42 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45348  predicted protein  29.8 
 
 		 481 aa  68.6  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15879  predicted protein  30.47 
 
 		 515 aa  61.6  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2568  hypothetical protein  28.12 
 
 		 382 aa  55.8  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0823  cupin region  25.37 
 
 		 301 aa  54.3  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46687  predicted protein  33.61 
 
 		 626 aa  50.4  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42544  predicted protein  27.15 
 
 		 239 aa  49.3  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.165779  normal  0.224356 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1132  transcription factor jumonji, jmjC  25 
 
 		 401 aa  47.4  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2541  cupin 4 family protein  28.21 
 
 		 376 aa  47  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43870  predicted protein  21.58 
 
 		 549 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2011  cupin 4 family protein  25.36 
 
 		 373 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0220075 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0960  cupin 4 family protein  23.92 
 
 		 375 aa  43.9  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.786571  normal  0.101373 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2642  cupin 4 family protein  24.62 
 
 		 418 aa  43.9  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1952  hypothetical protein  21.77 
 
 		 390 aa  43.1  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>