13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_43870 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_43870  predicted protein  100 
 
 		 549 aa  1141    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3032  cupin 4  25.48 
 
 		 385 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0159331  hitchhiker  0.00213714 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1301  Transcription factor jumonji  36.45 
 
 		 402 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14981  predicted protein  31.71 
 
 		 351 aa  48.5  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1143  cupin region  27.27 
 
 		 415 aa  47.4  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000830013  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0140  hypothetical protein  29.73 
 
 		 399 aa  46.2  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13914  predicted protein  30.88 
 
 		 508 aa  45.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0453978  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1529  Cupin 4 family protein  21.58 
 
 		 400 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.567254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0920  Cupin 4 family protein  27.27 
 
 		 373 aa  45.4  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2408  cupin 4 family protein  26.74 
 
 		 380 aa  44.3  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0501658  hitchhiker  0.000275258 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1814  hypothetical protein  31.9 
 
 		 353 aa  43.5  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2909  Cupin 4 family protein  30 
 
 		 414 aa  43.5  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3174  cupin 4 family protein  29.47 
 
 		 303 aa  43.5  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386133  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>