156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3032 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3032  cupin 4  100 
 
 		 385 aa  797    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0159331  hitchhiker  0.00213714 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0373  hypothetical protein  37.33 
 
 		 428 aa  258  1e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.373081 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3066  Cupin 4 family protein  32 
 
 		 452 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  hitchhiker  0.00228521 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02500  Cupin superfamily protein  33.1 
 
 		 414 aa  154  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5269  Cupin 4 family protein  28.77 
 
 		 395 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242855  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2909  Cupin 4 family protein  31.75 
 
 		 414 aa  144  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5250  cupin 4  30.74 
 
 		 404 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.109199  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5339  cupin 4 family protein  30.74 
 
 		 404 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.77653  normal  0.333851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5630  cupin 4 family protein  30.37 
 
 		 404 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.533226 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3279  Cupin 4 family protein  31.47 
 
 		 436 aa  143  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0337  cupin 4 family protein  31.2 
 
 		 402 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3174  cupin 4 family protein  33.03 
 
 		 303 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1339  Cupin 4 family protein  32.87 
 
 		 434 aa  127  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.696496  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2151  cupin 4 family protein  32.03 
 
 		 496 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247247  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2302  cupin 4 family protein  27.38 
 
 		 432 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0977306  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0385  cupin 4  29.83 
 
 		 392 aa  120  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1857  hypothetical protein  25.19 
 
 		 395 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335047  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0394  cupin 4  35 
 
 		 406 aa  114  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4378  cupin 4 family protein  30.19 
 
 		 403 aa  107  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3059  cupin 4 family protein  28.84 
 
 		 298 aa  106  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211157  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1529  Cupin 4 family protein  30.13 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.567254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1708  hypothetical protein  29.66 
 
 		 397 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2875  cupin 4 family protein  29.03 
 
 		 384 aa  100  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.0729467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8956  Cupin 4 family protein  33.85 
 
 		 395 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2428  cupin 4 family protein  21.98 
 
 		 394 aa  91.7  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15879  predicted protein  32.48 
 
 		 515 aa  78.6  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14981  predicted protein  35.1 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1143  cupin region  25.33 
 
 		 415 aa  65.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000830013  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0823  cupin region  25.77 
 
 		 301 aa  65.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02373  putative enzyme with RmlC-like domain  25.45 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.965281  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2568  hypothetical protein  32.17 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2000  cupin 4 family protein  26.91 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30100  hypothetical protein  22.34 
 
 		 389 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1908  cupin 4 family protein  25.09 
 
 		 386 aa  62.8  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2199  cupin 4 family protein  25.12 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00219592  hitchhiker  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2354  cupin 4 family protein  25.83 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2343  cupin 4 family protein  25.83 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2459  cupin 4 family protein  25.83 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.378112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2004  Cupin 4 family protein  25.83 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.367195  hitchhiker  0.0000511749 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1600  cupin 4 family protein  21.23 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2577  hypothetical protein  21.63 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0294442  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0920  Cupin 4 family protein  32.63 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1675  cupin 4 family protein  20.72 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0838  cupin 4  23.91 
 
 		 392 aa  59.3  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000238733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0982  cupin 4  23.91 
 
 		 392 aa  59.3  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000496862  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1148  hypothetical protein  24.59 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1744  cupin 4 family protein  20.46 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45348  predicted protein  28.26 
 
 		 481 aa  58.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2383  cupin 4  24.3 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1765  cupin 4 family protein  22.89 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0255627  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1850  Cupin 4 family protein  21.7 
 
 		 397 aa  57  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.469672  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3437  Cupin 4 family protein  29.81 
 
 		 381 aa  57  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1825  cupin 4  21.61 
 
 		 376 aa  57  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2644  cupin 4  30.1 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1274  Cupin 4 family protein  26.92 
 
 		 385 aa  56.6  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2403  cupin 4 family protein  22.79 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.969826  normal  0.0823577 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2408  cupin 4 family protein  23.53 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0501658  hitchhiker  0.000275258 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1870  Cupin 4 family protein  21.41 
 
 		 379 aa  56.2  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000786372  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0585  hypothetical protein  23.81 
 
 		 377 aa  55.8  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.269935  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1086  Cupin 4 family protein  24.1 
 
 		 409 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46687  predicted protein  29.68 
 
 		 626 aa  55.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0990  Cupin 4 family protein  26.74 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.210343 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2857  hypothetical protein  26.24 
 
 		 373 aa  54.7  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1713  cupin 4 family protein  26.24 
 
 		 373 aa  55.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2523  Cupin 4 family protein  30 
 
 		 368 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000942208  decreased coverage  0.00000000060733 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2658  cupin 4 family protein  28.85 
 
 		 393 aa  54.7  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0302893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2474  cupin 4 family protein  22.92 
 
 		 379 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030086  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1606  cupin family protein  24.35 
 
 		 373 aa  54.7  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2594  cupin 4 family protein  21.68 
 
 		 379 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46128  normal  0.0566469 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4017  cupin 4 family protein  22.17 
 
 		 390 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593926  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2708  cupin 4 family protein  25.53 
 
 		 374 aa  53.9  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.112259 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2481  cupin 4 family protein  21.41 
 
 		 379 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1816  cupin 4 family protein  22.17 
 
 		 388 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal  0.222085 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3622  cupin 4 family protein  22.17 
 
 		 388 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1402  cupin 4 family protein  30.56 
 
 		 370 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  hitchhiker  0.000000587517 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1674  hypothetical protein  35.35 
 
 		 383 aa  53.5  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2236  cupin 4 family protein  21.43 
 
 		 379 aa  53.5  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.817609  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1404  Cupin 4 family protein  25.23 
 
 		 397 aa  53.5  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0473  Cupin 4 family protein  28.33 
 
 		 373 aa  53.1  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0960  cupin 4 family protein  25.7 
 
 		 375 aa  53.1  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.786571  normal  0.101373 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1910  hypothetical protein  28.83 
 
 		 422 aa  53.1  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507646  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2065  cupin 4  24.02 
 
 		 372 aa  53.1  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.439804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3269  cupin 4 family protein  25.33 
 
 		 400 aa  53.1  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540912 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2011  cupin 4 family protein  25.79 
 
 		 373 aa  53.1  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0220075 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0038  Cupin 4 family protein  24.79 
 
 		 392 aa  53.1  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2127  cupin 4 family protein  28.42 
 
 		 407 aa  52.8  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14925  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1937  Cupin 4 family protein  24.26 
 
 		 373 aa  53.1  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43870  predicted protein  25.48 
 
 		 549 aa  52.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2263  cupin 4 family protein  22.55 
 
 		 380 aa  52.8  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28390  clavaminate synthase-like superfamily protein  24.38 
 
 		 388 aa  52.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2988  cupin family protein  28.27 
 
 		 373 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1183  cupin 4 family protein  28.28 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0687664  hitchhiker  0.0000384717 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3067  cupin 4 family protein  28.27 
 
 		 373 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5986  cupin 4  30.53 
 
 		 406 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.143009  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2091  cupin 4 family protein  30.53 
 
 		 406 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0444344  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1005  cupin 4 family protein  31.58 
 
 		 373 aa  51.6  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2562  cupin domain-containing protein  27.68 
 
 		 395 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245241  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2615  cupin domain-containing protein  27.68 
 
 		 395 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0491  cupin 4 family protein  28.27 
 
 		 373 aa  51.6  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1641  cupin 4 family protein  25 
 
 		 373 aa  51.6  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>