47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_46687 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011679  PHATR_46687  predicted protein  100 
 
 		 626 aa  1293    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1339  Cupin 4 family protein  34.46 
 
 		 434 aa  62  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.696496  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0385  cupin 4  28.12 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5630  cupin 4 family protein  33.88 
 
 		 404 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.533226 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3032  cupin 4  29.68 
 
 		 385 aa  55.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0159331  hitchhiker  0.00213714 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45348  predicted protein  30.95 
 
 		 481 aa  55.1  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4378  cupin 4 family protein  27.59 
 
 		 403 aa  55.1  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2302  cupin 4 family protein  30.33 
 
 		 432 aa  54.7  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0977306  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5250  cupin 4  33.06 
 
 		 404 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.109199  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5339  cupin 4 family protein  33.06 
 
 		 404 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.77653  normal  0.333851 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2909  Cupin 4 family protein  31.75 
 
 		 414 aa  53.9  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8956  Cupin 4 family protein  30.72 
 
 		 395 aa  53.9  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0373  hypothetical protein  25.6 
 
 		 428 aa  52.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.373081 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2151  cupin 4 family protein  28.69 
 
 		 496 aa  52.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247247  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14981  predicted protein  30.43 
 
 		 351 aa  50.8  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1274  Cupin 4 family protein  33.33 
 
 		 385 aa  50.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15879  predicted protein  26.79 
 
 		 515 aa  50.1  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1529  Cupin 4 family protein  33.61 
 
 		 400 aa  50.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.567254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02500  Cupin superfamily protein  26.39 
 
 		 414 aa  49.3  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2428  cupin 4 family protein  29.53 
 
 		 394 aa  49.3  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0989  Cupin 4 family protein  28.77 
 
 		 410 aa  49.7  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0764478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0337  cupin 4 family protein  27.87 
 
 		 402 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1708  hypothetical protein  24.54 
 
 		 397 aa  48.9  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3066  Cupin 4 family protein  29.27 
 
 		 452 aa  47.8  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  hitchhiker  0.00228521 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0823  cupin region  33.33 
 
 		 301 aa  47.4  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2541  cupin 4 family protein  29.55 
 
 		 376 aa  47  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2642  cupin 4 family protein  22.07 
 
 		 418 aa  47  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1952  hypothetical protein  29.49 
 
 		 390 aa  46.6  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2065  cupin 4  28.57 
 
 		 372 aa  47  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.439804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0960  cupin 4 family protein  23.14 
 
 		 375 aa  47  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.786571  normal  0.101373 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3279  Cupin 4 family protein  28.33 
 
 		 436 aa  46.2  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1072  cupin 4  33.33 
 
 		 375 aa  46.6  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.474375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3269  cupin 4 family protein  26.21 
 
 		 400 aa  45.8  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540912 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1825  cupin 4  26.67 
 
 		 376 aa  45.4  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1850  Cupin 4 family protein  31.31 
 
 		 397 aa  45.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.469672  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3174  cupin 4 family protein  33.94 
 
 		 303 aa  44.7  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386133  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2068  Cupin 4 family protein  25.95 
 
 		 373 aa  44.7  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2857  hypothetical protein  27.91 
 
 		 373 aa  44.7  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1713  cupin 4 family protein  27.91 
 
 		 373 aa  44.3  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1606  cupin family protein  27.91 
 
 		 373 aa  44.7  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0394  cupin 4  23.73 
 
 		 406 aa  44.3  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1332  cupin 4 family protein  31.11 
 
 		 378 aa  43.9  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1557  cupin 4 family protein  28.43 
 
 		 386 aa  43.9  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.215237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2568  hypothetical protein  30.77 
 
 		 382 aa  43.9  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0850  cupin 4 family protein  29.35 
 
 		 410 aa  43.9  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5269  Cupin 4 family protein  30.1 
 
 		 395 aa  43.9  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242855  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2644  cupin 4  28.87 
 
 		 384 aa  43.9  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>