47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0394 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0394  cupin 4  100 
 
 		 406 aa  835    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8956  Cupin 4 family protein  44.61 
 
 		 395 aa  340  2e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1857  hypothetical protein  30.89 
 
 		 395 aa  159  6e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335047  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5269  Cupin 4 family protein  32.85 
 
 		 395 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242855  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1529  Cupin 4 family protein  30.81 
 
 		 400 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.567254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3032  cupin 4  35 
 
 		 385 aa  114  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0159331  hitchhiker  0.00213714 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0373  hypothetical protein  35.5 
 
 		 428 aa  104  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.373081 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0385  cupin 4  34.74 
 
 		 392 aa  94  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2428  cupin 4 family protein  36.08 
 
 		 394 aa  93.2  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3059  cupin 4 family protein  28.24 
 
 		 298 aa  91.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211157  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5630  cupin 4 family protein  31.09 
 
 		 404 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.533226 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5250  cupin 4  31.09 
 
 		 404 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.109199  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5339  cupin 4 family protein  31.09 
 
 		 404 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.77653  normal  0.333851 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3174  cupin 4 family protein  27.62 
 
 		 303 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2151  cupin 4 family protein  31.74 
 
 		 496 aa  88.2  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247247  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1339  Cupin 4 family protein  31.22 
 
 		 434 aa  87  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.696496  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2302  cupin 4 family protein  28.23 
 
 		 432 aa  87  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0977306  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3066  Cupin 4 family protein  25.62 
 
 		 452 aa  85.5  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  hitchhiker  0.00228521 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0337  cupin 4 family protein  31.25 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02500  Cupin superfamily protein  31.38 
 
 		 414 aa  81.3  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4378  cupin 4 family protein  29.73 
 
 		 403 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3279  Cupin 4 family protein  30.37 
 
 		 436 aa  75.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2909  Cupin 4 family protein  27.08 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2875  cupin 4 family protein  27.37 
 
 		 384 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.0729467 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14981  predicted protein  34.93 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1708  hypothetical protein  27.78 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15879  predicted protein  32.11 
 
 		 515 aa  59.7  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0823  cupin region  23.71 
 
 		 301 aa  54.3  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45348  predicted protein  30.06 
 
 		 481 aa  52.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0960  cupin 4 family protein  24.61 
 
 		 375 aa  52.8  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.786571  normal  0.101373 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2263  cupin 4 family protein  30.46 
 
 		 380 aa  52.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1557  cupin 4 family protein  30.71 
 
 		 386 aa  49.7  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.215237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1143  cupin region  28.99 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000830013  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3269  cupin 4 family protein  27.91 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540912 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1825  cupin 4  29.14 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2541  cupin 4 family protein  27.52 
 
 		 376 aa  47.4  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1744  cupin 4 family protein  30.51 
 
 		 379 aa  46.6  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1675  cupin 4 family protein  30.51 
 
 		 379 aa  46.6  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1600  cupin 4 family protein  30.51 
 
 		 379 aa  46.6  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2199  cupin 4 family protein  26.56 
 
 		 381 aa  45.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00219592  hitchhiker  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2065  cupin 4  25.86 
 
 		 372 aa  45.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.439804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1460  hypothetical protein  26.67 
 
 		 209 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.866672 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46687  predicted protein  23.73 
 
 		 626 aa  44.3  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2708  cupin 4 family protein  30.23 
 
 		 374 aa  43.5  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.112259 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2408  cupin 4 family protein  29.82 
 
 		 380 aa  43.5  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0501658  hitchhiker  0.000275258 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1908  cupin 4 family protein  26.91 
 
 		 386 aa  43.1  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2011  cupin 4 family protein  20.7 
 
 		 373 aa  43.1  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0220075 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>