142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2151 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2151  cupin 4 family protein  100 
 
 		 496 aa  969    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247247  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2302  cupin 4 family protein  90.75 
 
 		 432 aa  677    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0977306  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3066  Cupin 4 family protein  49.29 
 
 		 452 aa  370  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  hitchhiker  0.00228521 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3279  Cupin 4 family protein  51.36 
 
 		 436 aa  341  2e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5630  cupin 4 family protein  44.72 
 
 		 404 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.533226 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5250  cupin 4  44.72 
 
 		 404 aa  310  5e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.109199  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5339  cupin 4 family protein  44.72 
 
 		 404 aa  310  5e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.77653  normal  0.333851 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2909  Cupin 4 family protein  44.36 
 
 		 414 aa  299  9e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0337  cupin 4 family protein  44.31 
 
 		 402 aa  295  1e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1339  Cupin 4 family protein  42.45 
 
 		 434 aa  236  8e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.696496  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02500  Cupin superfamily protein  46.06 
 
 		 414 aa  236  1.0000000000000001e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4378  cupin 4 family protein  38.32 
 
 		 403 aa  189  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0385  cupin 4  32.74 
 
 		 392 aa  170  7e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0373  hypothetical protein  31.16 
 
 		 428 aa  137  6.0000000000000005e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.373081 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3032  cupin 4  26.21 
 
 		 385 aa  126  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0159331  hitchhiker  0.00213714 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1708  hypothetical protein  31.16 
 
 		 397 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5269  Cupin 4 family protein  32.45 
 
 		 395 aa  109  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242855  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1529  Cupin 4 family protein  32.36 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.567254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2428  cupin 4 family protein  31.76 
 
 		 394 aa  105  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8956  Cupin 4 family protein  29.62 
 
 		 395 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1857  hypothetical protein  30.43 
 
 		 395 aa  99  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335047  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3059  cupin 4 family protein  28.65 
 
 		 298 aa  95.1  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211157  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14981  predicted protein  42.55 
 
 		 351 aa  92.8  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2875  cupin 4 family protein  28.82 
 
 		 384 aa  92.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.0729467 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0394  cupin 4  27.89 
 
 		 406 aa  90.5  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15879  predicted protein  40.16 
 
 		 515 aa  89.7  9e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45348  predicted protein  31.63 
 
 		 481 aa  80.9  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3174  cupin 4 family protein  24.12 
 
 		 303 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0823  cupin region  31.05 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0920  Cupin 4 family protein  26.67 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2568  hypothetical protein  34.21 
 
 		 382 aa  63.2  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2642  cupin 4 family protein  31.72 
 
 		 418 aa  62.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2199  cupin 4 family protein  28.93 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00219592  hitchhiker  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2658  cupin 4 family protein  27 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0302893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02373  putative enzyme with RmlC-like domain  25.15 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.965281  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2644  cupin 4  28.05 
 
 		 384 aa  56.2  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2000  cupin 4 family protein  27.05 
 
 		 381 aa  55.1  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0960  cupin 4 family protein  34.65 
 
 		 375 aa  54.7  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.786571  normal  0.101373 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1143  cupin region  27.95 
 
 		 415 aa  54.3  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000830013  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1332  cupin 4 family protein  26.67 
 
 		 378 aa  54.3  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3269  cupin 4 family protein  25.11 
 
 		 400 aa  53.9  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540912 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1148  hypothetical protein  26.8 
 
 		 409 aa  53.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1132  transcription factor jumonji, jmjC  23.53 
 
 		 401 aa  52.8  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2408  cupin 4 family protein  25.93 
 
 		 380 aa  53.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0501658  hitchhiker  0.000275258 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5092  cupin 4 family protein  34.31 
 
 		 376 aa  52.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581531  normal  0.0289513 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46687  predicted protein  28.69 
 
 		 626 aa  52.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1908  cupin 4 family protein  29.39 
 
 		 386 aa  52  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1183  cupin 4 family protein  28.57 
 
 		 408 aa  51.6  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0687664  hitchhiker  0.0000384717 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1274  Cupin 4 family protein  26.67 
 
 		 385 aa  51.2  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1460  hypothetical protein  23.84 
 
 		 209 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.866672 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2127  cupin 4 family protein  28.5 
 
 		 407 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14925  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1005  cupin 4 family protein  25.87 
 
 		 373 aa  51.2  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0038  Cupin 4 family protein  27.5 
 
 		 392 aa  51.2  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1937  Cupin 4 family protein  26.69 
 
 		 373 aa  50.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5986  cupin 4  29.39 
 
 		 406 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.143009  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2091  cupin 4 family protein  29.39 
 
 		 406 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0444344  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1108  cupin region  32.76 
 
 		 402 aa  50.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1072  cupin 4  27.64 
 
 		 375 aa  50.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.474375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1765  cupin 4 family protein  32.41 
 
 		 383 aa  50.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0255627  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2263  cupin 4 family protein  25.51 
 
 		 380 aa  50.1  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2236  cupin 4 family protein  31.53 
 
 		 379 aa  50.1  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.817609  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1952  hypothetical protein  29.41 
 
 		 390 aa  50.1  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5397  cupin domain-containing protein  28.26 
 
 		 406 aa  50.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705727  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2354  cupin 4 family protein  26.02 
 
 		 385 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2481  cupin 4 family protein  30.63 
 
 		 379 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2004  Cupin 4 family protein  26.23 
 
 		 385 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.367195  hitchhiker  0.0000511749 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1557  cupin 4 family protein  31.82 
 
 		 386 aa  49.7  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.215237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2343  cupin 4 family protein  26.02 
 
 		 385 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2474  cupin 4 family protein  31.53 
 
 		 379 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030086  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1870  Cupin 4 family protein  30.63 
 
 		 379 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000786372  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2541  cupin 4 family protein  24.4 
 
 		 376 aa  49.7  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2459  cupin 4 family protein  26.02 
 
 		 385 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.378112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2110  cupin 4 family protein  28.95 
 
 		 406 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.191653  hitchhiker  0.00823788 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2011  cupin 4 family protein  31.78 
 
 		 373 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0220075 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2594  cupin 4 family protein  29.09 
 
 		 379 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46128  normal  0.0566469 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2628  Cupin 4 family protein  27.45 
 
 		 471 aa  49.3  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.229429  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2001  cupin 4 family protein  27.05 
 
 		 406 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.484534  hitchhiker  0.000000254865 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1191  cupin 4 family protein  26.56 
 
 		 413 aa  48.5  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327917  normal  0.915059 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2523  Cupin 4 family protein  35.51 
 
 		 368 aa  48.5  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000942208  decreased coverage  0.00000000060733 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1641  cupin 4 family protein  33.64 
 
 		 373 aa  48.5  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2403  cupin 4 family protein  29.14 
 
 		 388 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.969826  normal  0.0823577 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2149  Cupin 4 family protein  24.12 
 
 		 373 aa  48.5  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1864  Cupin 4 family protein  24.12 
 
 		 373 aa  48.1  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1825  cupin 4  28.18 
 
 		 376 aa  47.8  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2708  cupin 4 family protein  32.97 
 
 		 374 aa  47.8  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.112259 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2636  hypothetical protein  30 
 
 		 380 aa  47.8  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1675  cupin 4 family protein  24.58 
 
 		 379 aa  47.8  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0585  hypothetical protein  29.2 
 
 		 377 aa  47.4  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.269935  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1744  cupin 4 family protein  24.58 
 
 		 379 aa  47.4  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3141  hypothetical protein  33.06 
 
 		 407 aa  47.4  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0502  cupin 4 family protein  28.68 
 
 		 373 aa  47.4  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1600  cupin 4 family protein  24.58 
 
 		 379 aa  47.4  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2177  hypothetical protein  33.06 
 
 		 395 aa  47.4  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0429596  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1450  hypothetical protein  33.06 
 
 		 395 aa  47.4  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.90536  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1816  cupin 4 family protein  23.86 
 
 		 388 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal  0.222085 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3421  cupin 4 family protein  24.35 
 
 		 388 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0990  Cupin 4 family protein  29.46 
 
 		 375 aa  47  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.210343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1086  Cupin 4 family protein  29.46 
 
 		 409 aa  47  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1614  hypothetical protein  26.72 
 
 		 382 aa  47  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000816657  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0850  cupin 4 family protein  25.48 
 
 		 410 aa  47  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>