51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1857 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1857  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  788    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335047  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1529  Cupin 4 family protein  64 
 
 		 400 aa  500  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.567254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5269  Cupin 4 family protein  41.54 
 
 		 395 aa  222  8e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242855  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0394  cupin 4  30.89 
 
 		 406 aa  159  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8956  Cupin 4 family protein  38.37 
 
 		 395 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3066  Cupin 4 family protein  27.3 
 
 		 452 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  hitchhiker  0.00228521 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0373  hypothetical protein  25.57 
 
 		 428 aa  120  3.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.373081 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3032  cupin 4  25.19 
 
 		 385 aa  117  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0159331  hitchhiker  0.00213714 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2909  Cupin 4 family protein  32.14 
 
 		 414 aa  106  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3059  cupin 4 family protein  25.38 
 
 		 298 aa  106  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211157  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5630  cupin 4 family protein  26.95 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.533226 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5250  cupin 4  27.25 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.109199  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5339  cupin 4 family protein  27.25 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.77653  normal  0.333851 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3279  Cupin 4 family protein  32.38 
 
 		 436 aa  103  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3174  cupin 4 family protein  30.81 
 
 		 303 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0337  cupin 4 family protein  31.72 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2428  cupin 4 family protein  27.67 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2875  cupin 4 family protein  30.48 
 
 		 384 aa  97.8  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.0729467 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02500  Cupin superfamily protein  29.75 
 
 		 414 aa  97.8  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2151  cupin 4 family protein  30.26 
 
 		 496 aa  96.7  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247247  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1339  Cupin 4 family protein  30 
 
 		 434 aa  96.3  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.696496  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2302  cupin 4 family protein  31.96 
 
 		 432 aa  95.5  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0977306  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0385  cupin 4  28.24 
 
 		 392 aa  84  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4378  cupin 4 family protein  27.01 
 
 		 403 aa  82.8  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1708  hypothetical protein  29.51 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45348  predicted protein  29.61 
 
 		 481 aa  67  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0823  cupin region  26.53 
 
 		 301 aa  67  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15879  predicted protein  26.92 
 
 		 515 aa  62.8  0.000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2568  hypothetical protein  30.26 
 
 		 382 aa  55.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14981  predicted protein  33.33 
 
 		 351 aa  53.1  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1132  transcription factor jumonji, jmjC  22.92 
 
 		 401 aa  51.2  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3269  cupin 4 family protein  30.65 
 
 		 400 aa  50.4  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540912 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2127  cupin 4 family protein  27.18 
 
 		 407 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14925  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2642  cupin 4 family protein  23.94 
 
 		 418 aa  47.4  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0920  Cupin 4 family protein  28.97 
 
 		 373 aa  47.4  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0960  cupin 4 family protein  24.18 
 
 		 375 aa  47  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.786571  normal  0.101373 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2011  cupin 4 family protein  22.7 
 
 		 373 aa  46.6  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0220075 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2644  cupin 4  25.83 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3437  Cupin 4 family protein  24.44 
 
 		 381 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02373  putative enzyme with RmlC-like domain  21.73 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.965281  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2523  Cupin 4 family protein  23.6 
 
 		 368 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000942208  decreased coverage  0.00000000060733 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5986  cupin 4  27.46 
 
 		 406 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.143009  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1937  Cupin 4 family protein  25.27 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2091  cupin 4 family protein  27.46 
 
 		 406 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0444344  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2110  cupin 4 family protein  26.71 
 
 		 406 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.191653  hitchhiker  0.00823788 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1408  Cupin 4 family protein  25.18 
 
 		 374 aa  44.3  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1108  cupin region  28.4 
 
 		 402 aa  43.9  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0473  Cupin 4 family protein  23.74 
 
 		 373 aa  43.5  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1641  cupin 4 family protein  23.6 
 
 		 373 aa  43.1  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2133  hypothetical protein  28.71 
 
 		 383 aa  43.1  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.764598  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0392  Cupin 4 family protein  23.74 
 
 		 373 aa  42.7  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>