123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0373 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0373  hypothetical protein  100 
 
 		 428 aa  870    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.373081 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3032  cupin 4  37.33 
 
 		 385 aa  258  2e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0159331  hitchhiker  0.00213714 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02500  Cupin superfamily protein  34.55 
 
 		 414 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5269  Cupin 4 family protein  30.62 
 
 		 395 aa  146  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242855  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3066  Cupin 4 family protein  34.67 
 
 		 452 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  hitchhiker  0.00228521 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5630  cupin 4 family protein  32.13 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.533226 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5250  cupin 4  32.4 
 
 		 404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.109199  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5339  cupin 4 family protein  32.4 
 
 		 404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.77653  normal  0.333851 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1529  Cupin 4 family protein  27.37 
 
 		 400 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.567254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2151  cupin 4 family protein  33.77 
 
 		 496 aa  129  7.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247247  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2909  Cupin 4 family protein  32.14 
 
 		 414 aa  130  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3279  Cupin 4 family protein  30 
 
 		 436 aa  129  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2302  cupin 4 family protein  34.19 
 
 		 432 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0977306  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0385  cupin 4  32.34 
 
 		 392 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1339  Cupin 4 family protein  34.04 
 
 		 434 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.696496  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1857  hypothetical protein  25.57 
 
 		 395 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335047  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0337  cupin 4 family protein  31.43 
 
 		 402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1708  hypothetical protein  36.06 
 
 		 397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3174  cupin 4 family protein  26.52 
 
 		 303 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0394  cupin 4  35.5 
 
 		 406 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8956  Cupin 4 family protein  31.8 
 
 		 395 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2875  cupin 4 family protein  29.05 
 
 		 384 aa  94.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.0729467 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4378  cupin 4 family protein  28.07 
 
 		 403 aa  94.4  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3059  cupin 4 family protein  27.06 
 
 		 298 aa  94.4  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211157  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2428  cupin 4 family protein  27.4 
 
 		 394 aa  88.6  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15879  predicted protein  37.61 
 
 		 515 aa  72.4  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45348  predicted protein  30.05 
 
 		 481 aa  71.6  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14981  predicted protein  35.92 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1143  cupin region  28.84 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000830013  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0823  cupin region  27.83 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1765  cupin 4 family protein  23.04 
 
 		 383 aa  62.4  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0255627  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2577  hypothetical protein  24.04 
 
 		 389 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0294442  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2568  hypothetical protein  26.03 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0838  cupin 4  26.43 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000238733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0982  cupin 4  26.43 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000496862  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30100  hypothetical protein  24.49 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0473  Cupin 4 family protein  25 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0960  cupin 4 family protein  26.7 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.786571  normal  0.101373 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0392  Cupin 4 family protein  24.63 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1404  Cupin 4 family protein  26.63 
 
 		 397 aa  57  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02373  putative enzyme with RmlC-like domain  23.26 
 
 		 388 aa  57  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.965281  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1557  cupin 4 family protein  26.63 
 
 		 386 aa  55.8  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.215237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2642  cupin 4 family protein  24.44 
 
 		 418 aa  56.2  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3361  hypothetical protein  23.42 
 
 		 388 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.036154  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2636  hypothetical protein  26.83 
 
 		 380 aa  54.7  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1132  transcription factor jumonji, jmjC  23.87 
 
 		 401 aa  54.7  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2644  cupin 4  23.75 
 
 		 384 aa  54.7  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28390  clavaminate synthase-like superfamily protein  23.39 
 
 		 388 aa  55.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2199  cupin 4 family protein  24.89 
 
 		 381 aa  54.7  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00219592  hitchhiker  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3193  transcription factor jumonji, jmjC  23.42 
 
 		 388 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.021443 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1600  cupin 4 family protein  26.83 
 
 		 379 aa  53.9  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1744  cupin 4 family protein  26.83 
 
 		 379 aa  53.9  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3067  cupin 4 family protein  24.54 
 
 		 373 aa  53.5  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1675  cupin 4 family protein  26.83 
 
 		 379 aa  53.5  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2988  cupin family protein  24.54 
 
 		 373 aa  53.5  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3622  cupin 4 family protein  23.65 
 
 		 388 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3599  transcription factor jumonji, jmjC  23.22 
 
 		 391 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.404465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2236  cupin 4 family protein  24.89 
 
 		 379 aa  52.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.817609  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2474  cupin 4 family protein  24.89 
 
 		 379 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030086  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2000  cupin 4 family protein  25.45 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46687  predicted protein  25.6 
 
 		 626 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1148  hypothetical protein  26.88 
 
 		 409 aa  52.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2065  cupin 4  22.27 
 
 		 372 aa  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.439804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5092  cupin 4 family protein  26.32 
 
 		 376 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581531  normal  0.0289513 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2004  Cupin 4 family protein  25.78 
 
 		 385 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.367195  hitchhiker  0.0000511749 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1908  cupin 4 family protein  26.07 
 
 		 386 aa  51.6  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2708  cupin 4 family protein  27.09 
 
 		 374 aa  51.2  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.112259 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1870  Cupin 4 family protein  24.43 
 
 		 379 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000786372  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2354  cupin 4 family protein  25.39 
 
 		 385 aa  50.4  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2343  cupin 4 family protein  25.19 
 
 		 385 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2459  cupin 4 family protein  25.19 
 
 		 385 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.378112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2594  cupin 4 family protein  24.43 
 
 		 379 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46128  normal  0.0566469 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1816  cupin 4 family protein  23.31 
 
 		 388 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal  0.222085 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2408  cupin 4 family protein  25.34 
 
 		 380 aa  50.4  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0501658  hitchhiker  0.000275258 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4017  cupin 4 family protein  22.79 
 
 		 390 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593926  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0585  hypothetical protein  26.61 
 
 		 377 aa  50.1  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.269935  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2481  cupin 4 family protein  24.43 
 
 		 379 aa  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1460  hypothetical protein  25.36 
 
 		 209 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.866672 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1674  hypothetical protein  21.74 
 
 		 383 aa  49.3  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1086  Cupin 4 family protein  26.25 
 
 		 409 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1408  Cupin 4 family protein  24.18 
 
 		 374 aa  49.3  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0990  Cupin 4 family protein  26.25 
 
 		 375 aa  49.7  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.210343 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1072  cupin 4  25.32 
 
 		 375 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.474375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2263  cupin 4 family protein  25.62 
 
 		 380 aa  48.9  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2403  cupin 4 family protein  23.73 
 
 		 388 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.969826  normal  0.0823577 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1606  cupin family protein  22.79 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0502  cupin 4 family protein  25.63 
 
 		 373 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3437  Cupin 4 family protein  23.11 
 
 		 381 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0920  Cupin 4 family protein  25.33 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1108  cupin region  25.85 
 
 		 402 aa  48.5  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2447  cupin 4  25.17 
 
 		 397 aa  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2658  cupin 4 family protein  31.36 
 
 		 393 aa  48.5  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0302893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18023  predicted protein  34.09 
 
 		 369 aa  47.8  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.150148 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3269  cupin 4 family protein  20.65 
 
 		 400 aa  47.8  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540912 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2541  cupin 4 family protein  25.82 
 
 		 376 aa  47.8  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2857  hypothetical protein  22.79 
 
 		 373 aa  47.4  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1937  Cupin 4 family protein  25.37 
 
 		 373 aa  47.4  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5397  cupin domain-containing protein  26.92 
 
 		 406 aa  47.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705727  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2127  cupin 4 family protein  26.15 
 
 		 407 aa  47.4  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14925  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27446  predicted protein  34.09 
 
 		 175 aa  47  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0257366 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>