27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1460 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1460  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  435  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.866672 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1339  Cupin 4 family protein  26.29 
 
 		 434 aa  72.8  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.696496  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0385  cupin 4  27.78 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2909  Cupin 4 family protein  25.53 
 
 		 414 aa  68.9  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3066  Cupin 4 family protein  28.06 
 
 		 452 aa  68.2  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  hitchhiker  0.00228521 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02500  Cupin superfamily protein  27.14 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4378  cupin 4 family protein  27.17 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45348  predicted protein  29.25 
 
 		 481 aa  66.6  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2428  cupin 4 family protein  30.46 
 
 		 394 aa  64.7  0.0000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0337  cupin 4 family protein  24.87 
 
 		 402 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3279  Cupin 4 family protein  27.46 
 
 		 436 aa  59.3  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2302  cupin 4 family protein  25.36 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0977306  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5250  cupin 4  22.68 
 
 		 404 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.109199  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5339  cupin 4 family protein  22.68 
 
 		 404 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.77653  normal  0.333851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5630  cupin 4 family protein  22.16 
 
 		 404 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.533226 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15879  predicted protein  29.03 
 
 		 515 aa  55.1  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1708  hypothetical protein  30.77 
 
 		 397 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14981  predicted protein  29.08 
 
 		 351 aa  52.8  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2151  cupin 4 family protein  23.84 
 
 		 496 aa  51.6  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247247  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0373  hypothetical protein  25.36 
 
 		 428 aa  49.7  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.373081 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0823  cupin region  24.84 
 
 		 301 aa  48.1  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8956  Cupin 4 family protein  23.74 
 
 		 395 aa  48.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5269  Cupin 4 family protein  23.88 
 
 		 395 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242855  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3059  cupin 4 family protein  25.55 
 
 		 298 aa  46.6  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211157  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0394  cupin 4  26.67 
 
 		 406 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3032  cupin 4  24.09 
 
 		 385 aa  45.4  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0159331  hitchhiker  0.00213714 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2875  cupin 4 family protein  24.46 
 
 		 384 aa  42  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.0729467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>