138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5269 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5269  Cupin 4 family protein  100 
 
 		 395 aa  766    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242855  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1857  hypothetical protein  41.54 
 
 		 395 aa  229  4e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335047  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1529  Cupin 4 family protein  40 
 
 		 400 aa  206  5e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.567254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3032  cupin 4  29.74 
 
 		 385 aa  151  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0159331  hitchhiker  0.00213714 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0373  hypothetical protein  30.62 
 
 		 428 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.373081 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0394  cupin 4  32.35 
 
 		 406 aa  146  8.000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8956  Cupin 4 family protein  33.33 
 
 		 395 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5630  cupin 4 family protein  31.55 
 
 		 404 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.533226 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5250  cupin 4  31.55 
 
 		 404 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.109199  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5339  cupin 4 family protein  31.55 
 
 		 404 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.77653  normal  0.333851 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3174  cupin 4 family protein  29.17 
 
 		 303 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0385  cupin 4  31.32 
 
 		 392 aa  120  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0337  cupin 4 family protein  32.28 
 
 		 402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2151  cupin 4 family protein  33.25 
 
 		 496 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247247  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2909  Cupin 4 family protein  33.2 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3066  Cupin 4 family protein  34.36 
 
 		 452 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  hitchhiker  0.00228521 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3279  Cupin 4 family protein  34.3 
 
 		 436 aa  110  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2302  cupin 4 family protein  32.08 
 
 		 432 aa  109  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0977306  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1339  Cupin 4 family protein  31.58 
 
 		 434 aa  104  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.696496  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2428  cupin 4 family protein  30.87 
 
 		 394 aa  103  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02500  Cupin superfamily protein  33.33 
 
 		 414 aa  103  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3059  cupin 4 family protein  28.52 
 
 		 298 aa  102  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211157  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1708  hypothetical protein  33.13 
 
 		 397 aa  98.2  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2875  cupin 4 family protein  28.85 
 
 		 384 aa  93.2  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.0729467 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4378  cupin 4 family protein  33.33 
 
 		 403 aa  90.9  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0823  cupin region  28.7 
 
 		 301 aa  79  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1108  cupin region  35.82 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2127  cupin 4 family protein  34 
 
 		 407 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14925  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1072  cupin 4  34.62 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.474375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2403  cupin 4 family protein  24.92 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.969826  normal  0.0823577 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1404  Cupin 4 family protein  27.85 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15879  predicted protein  29.68 
 
 		 515 aa  60.8  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5397  cupin domain-containing protein  33.77 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705727  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14981  predicted protein  26.87 
 
 		 351 aa  59.7  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5986  cupin 4  32.9 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.143009  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2091  cupin 4 family protein  32.9 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0444344  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2110  cupin 4 family protein  36.52 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.191653  hitchhiker  0.00823788 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3437  Cupin 4 family protein  36 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2001  cupin 4 family protein  36.52 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.484534  hitchhiker  0.000000254865 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1086  Cupin 4 family protein  30.43 
 
 		 409 aa  57  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0990  Cupin 4 family protein  30.43 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.210343 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2577  hypothetical protein  25.95 
 
 		 389 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0294442  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1143  cupin region  30.56 
 
 		 415 aa  55.5  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000830013  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2644  cupin 4  37.25 
 
 		 384 aa  55.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5092  cupin 4 family protein  40.96 
 
 		 376 aa  55.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581531  normal  0.0289513 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2199  cupin 4 family protein  29.41 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00219592  hitchhiker  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2642  cupin 4 family protein  32.32 
 
 		 418 aa  55.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2615  cupin domain-containing protein  36.56 
 
 		 395 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2011  cupin 4 family protein  30.61 
 
 		 373 aa  54.7  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0220075 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2000  cupin 4 family protein  28.65 
 
 		 381 aa  54.7  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1183  cupin 4 family protein  36.27 
 
 		 408 aa  54.7  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0687664  hitchhiker  0.0000384717 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0920  Cupin 4 family protein  37.36 
 
 		 373 aa  54.3  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2694  cupin superfamily protein family  36.56 
 
 		 422 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183857  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3175  cupin 4  37.89 
 
 		 408 aa  53.9  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2177  hypothetical protein  36.56 
 
 		 395 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0429596  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3141  hypothetical protein  36.56 
 
 		 407 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2562  cupin domain-containing protein  36.56 
 
 		 395 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245241  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1450  hypothetical protein  36.56 
 
 		 395 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.90536  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1765  cupin 4 family protein  25.3 
 
 		 383 aa  53.9  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0255627  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2568  hypothetical protein  29.18 
 
 		 382 aa  53.9  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1910  hypothetical protein  32.12 
 
 		 422 aa  53.5  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507646  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28390  clavaminate synthase-like superfamily protein  27.23 
 
 		 388 aa  53.5  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1148  hypothetical protein  30.63 
 
 		 409 aa  53.1  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2523  Cupin 4 family protein  31.39 
 
 		 368 aa  53.1  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000942208  decreased coverage  0.00000000060733 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30100  hypothetical protein  25.63 
 
 		 389 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1332  cupin 4 family protein  34.07 
 
 		 378 aa  52.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2408  cupin 4 family protein  30.41 
 
 		 380 aa  52.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0501658  hitchhiker  0.000275258 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1402  cupin 4 family protein  35.85 
 
 		 370 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  hitchhiker  0.000000587517 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3193  transcription factor jumonji, jmjC  23.81 
 
 		 388 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.021443 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1191  cupin 4 family protein  42.65 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327917  normal  0.915059 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1557  cupin 4 family protein  31.58 
 
 		 386 aa  52.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.215237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2708  cupin 4 family protein  23.92 
 
 		 374 aa  51.6  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.112259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1816  cupin 4 family protein  23.02 
 
 		 388 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal  0.222085 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3622  cupin 4 family protein  25.5 
 
 		 388 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3361  hypothetical protein  24.92 
 
 		 388 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.036154  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3421  cupin 4 family protein  25.08 
 
 		 388 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2383  cupin 4  25.52 
 
 		 389 aa  50.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1864  Cupin 4 family protein  31.25 
 
 		 373 aa  50.4  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1641  cupin 4 family protein  29.17 
 
 		 373 aa  50.4  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3269  cupin 4 family protein  25.55 
 
 		 400 aa  50.4  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540912 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1674  hypothetical protein  24.51 
 
 		 383 aa  50.1  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4017  cupin 4 family protein  23.02 
 
 		 390 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593926  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1606  cupin family protein  31.25 
 
 		 373 aa  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1908  cupin 4 family protein  30.07 
 
 		 386 aa  50.1  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2541  cupin 4 family protein  26.83 
 
 		 376 aa  50.1  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2857  hypothetical protein  31.25 
 
 		 373 aa  50.1  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1713  cupin 4 family protein  31.25 
 
 		 373 aa  50.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2004  Cupin 4 family protein  28.67 
 
 		 385 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.367195  hitchhiker  0.0000511749 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1874  hypothetical protein  28.85 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2658  cupin 4 family protein  35.71 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0302893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1850  Cupin 4 family protein  31.03 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.469672  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2149  Cupin 4 family protein  30.21 
 
 		 373 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1937  Cupin 4 family protein  28.8 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2065  cupin 4  22.87 
 
 		 372 aa  48.5  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.439804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2354  cupin 4 family protein  31.58 
 
 		 385 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2343  cupin 4 family protein  27.97 
 
 		 385 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2459  cupin 4 family protein  27.97 
 
 		 385 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.378112  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1865  hypothetical protein  27.88 
 
 		 395 aa  47.4  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3599  transcription factor jumonji, jmjC  24.19 
 
 		 391 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.404465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1460  hypothetical protein  23.88 
 
 		 209 aa  47  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.866672 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>