58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0802 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0802  transcription factor jumonji domain-containing protein  100 
 
 
288 aa  599  1e-170  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02690  hypothetical protein  63.12 
 
 
294 aa  403  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03820  jmjC domain protein  49.65 
 
 
292 aa  310  2e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0373  hypothetical protein  39.3 
 
 
293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0372  hypothetical protein  36.59 
 
 
293 aa  223  4e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4653  transcription factor jumonji jmjC domain protein  38.19 
 
 
284 aa  216  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.538116  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3091  hypothetical protein  36.08 
 
 
291 aa  208  9e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.855499  normal  0.0356785 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0347  transcription factor jumonji jmjC domain protein  36.08 
 
 
289 aa  208  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4326  hypothetical protein  26 
 
 
338 aa  89  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2065  JmjC domain-containing protein  22.98 
 
 
263 aa  89  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0481  JmjC domain-containing protein  22.98 
 
 
263 aa  89  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0632946  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1970  JmjC domain-containing protein  22.98 
 
 
263 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1617  JmjC domain-containing protein  23.4 
 
 
263 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148097  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0664  JmjC domain-containing protein  23.4 
 
 
263 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.544453  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0552  JmjC domain-containing protein  23.4 
 
 
263 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0793  JmjC domain-containing protein  23.4 
 
 
263 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.972855  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0113  transcription factor jumonji domain-containing protein  24.6 
 
 
332 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0394  transcription factor jumonji jmjC domain protein  26 
 
 
338 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1737  hypothetical protein  38.94 
 
 
316 aa  80.1  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5761  transcription factor jumonji jmjC domain protein  23.79 
 
 
267 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1737  hypothetical protein  38.39 
 
 
316 aa  78.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1814  hypothetical protein  23.77 
 
 
353 aa  75.9  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39523  predicted protein  27.15 
 
 
235 aa  75.1  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0537777  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1301  Transcription factor jumonji  23.19 
 
 
402 aa  69.7  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140521  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0224  JmjC domain-containing protein  24.03 
 
 
353 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000739958  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1121  JmjC domain-containing protein  24.03 
 
 
353 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000573239  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1563  JmjC domain-containing protein  24.03 
 
 
353 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100796  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2012  JmjC domain-containing protein  24.24 
 
 
294 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0936  JmjC domain-containing protein  24.24 
 
 
294 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0374685  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1992  JmjC domain-containing protein  24.24 
 
 
294 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2148  JmjC domain-containing protein  24.03 
 
 
353 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000110668  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2829  Pass1-related protein  21.95 
 
 
356 aa  63.2  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.960611  hitchhiker  0.00121107 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3788  transcription factor jumonji domain-containing protein  22.22 
 
 
373 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1843  transcription factor jumonji, jmjC  23.14 
 
 
376 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413035  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12370  predicted protein  21.85 
 
 
308 aa  59.7  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1103  Pass1-related protein  24.51 
 
 
335 aa  59.3  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3735  PASS1 domain-containing protein  24.1 
 
 
335 aa  58.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1210  transcription factor jumonji domain-containing protein  20.86 
 
 
339 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  normal  0.625502 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3180  transcription factor jumonji jmjC domain protein  21.19 
 
 
339 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1122  transcription factor jumonji domain-containing protein  20.86 
 
 
339 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1400  Pass1-related protein  24.45 
 
 
317 aa  57  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012865 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25410  JmjC-domain protein  22.73 
 
 
375 aa  56.6  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1177  transcription factor jumonji domain-containing protein  20.27 
 
 
339 aa  55.5  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1310  transcription factor jumonji domain-containing protein  20.72 
 
 
339 aa  55.5  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1641  transcription factor jumonji  21.9 
 
 
373 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18023  predicted protein  25 
 
 
369 aa  53.5  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.150148 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13914  predicted protein  23.37 
 
 
508 aa  52.8  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0453978  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27446  predicted protein  28.57 
 
 
175 aa  52.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0257366 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1141  transcription factor jumonji domain-containing protein  22.37 
 
 
338 aa  50.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3547  transcription factor jumonji domain-containing protein  20.08 
 
 
376 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00888  JmjC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15510)  50 
 
 
568 aa  47.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1845  transcription factor jumonji domain-containing protein  20.31 
 
 
334 aa  46.2  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0719587  normal  0.0313082 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37877  predicted protein  27.19 
 
 
297 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.11402  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34749  predicted protein  28.91 
 
 
373 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.533757  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2409  hypothetical protein  22.83 
 
 
344 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110953  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31334  predicted protein  25.84 
 
 
198 aa  43.5  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000173501  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10542  JmjC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06210)  20.71 
 
 
320 aa  43.5  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02201  pass1 domain protein  28.43 
 
 
348 aa  42.4  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>