16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48473 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_48473  predicted protein  100 
 
 
343 aa  713    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43557  predicted protein  36.51 
 
 
418 aa  103  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42117  predicted protein  25.81 
 
 
446 aa  64.3  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0484588  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0793  JmjC domain-containing protein  27.08 
 
 
263 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.972855  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0552  JmjC domain-containing protein  27.08 
 
 
263 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0664  JmjC domain-containing protein  27.08 
 
 
263 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.544453  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1617  JmjC domain-containing protein  27.08 
 
 
263 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148097  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_35989  predicted protein  29.93 
 
 
434 aa  59.7  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1970  JmjC domain-containing protein  27.08 
 
 
263 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0481  JmjC domain-containing protein  27.08 
 
 
263 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0632946  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2065  JmjC domain-containing protein  27.08 
 
 
263 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12370  predicted protein  28.57 
 
 
308 aa  56.6  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_3251  predicted protein  22.98 
 
 
294 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33787  predicted protein  22.54 
 
 
586 aa  50.4  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.715519  normal  0.121325 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00210  conserved hypothetical protein  32.88 
 
 
189 aa  45.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.154915  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46234  predicted protein  25 
 
 
535 aa  44.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>