29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_35989 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_35989  predicted protein  100 
 
 
434 aa  898    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42117  predicted protein  32.26 
 
 
446 aa  147  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0484588  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12370  predicted protein  36.84 
 
 
308 aa  139  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_3251  predicted protein  34.58 
 
 
294 aa  135  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02933  F-box and JmjC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08170)  29.63 
 
 
384 aa  107  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.89532 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46234  predicted protein  31.06 
 
 
535 aa  105  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33787  predicted protein  29.58 
 
 
586 aa  100  4e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.715519  normal  0.121325 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0793  JmjC domain-containing protein  32.65 
 
 
263 aa  87  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.972855  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0552  JmjC domain-containing protein  32.65 
 
 
263 aa  87  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0664  JmjC domain-containing protein  32.65 
 
 
263 aa  87  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.544453  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1617  JmjC domain-containing protein  32.65 
 
 
263 aa  87  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148097  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0481  JmjC domain-containing protein  32.65 
 
 
263 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0632946  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2065  JmjC domain-containing protein  32.65 
 
 
263 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1970  JmjC domain-containing protein  32.24 
 
 
263 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43557  predicted protein  30.28 
 
 
418 aa  64.3  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48473  predicted protein  29.93 
 
 
343 aa  59.7  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53771  predicted protein  29.06 
 
 
483 aa  52.8  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.229435  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00210  conserved hypothetical protein  43.9 
 
 
189 aa  50.4  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.154915  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_93634  predicted protein  28.47 
 
 
390 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.38611 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18023  predicted protein  29.73 
 
 
369 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.150148 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_94145  predicted protein  28.47 
 
 
390 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.899181  hitchhiker  0.0031942 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27446  predicted protein  29.73 
 
 
175 aa  47.4  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0257366 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0394  transcription factor jumonji jmjC domain protein  28.82 
 
 
338 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4326  hypothetical protein  27.07 
 
 
338 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0224  JmjC domain-containing protein  26.86 
 
 
353 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000739958  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1563  JmjC domain-containing protein  26.86 
 
 
353 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100796  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1121  JmjC domain-containing protein  26.86 
 
 
353 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000573239  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2148  JmjC domain-containing protein  26.86 
 
 
353 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000110668  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0936  JmjC domain-containing protein  26.86 
 
 
294 aa  43.5  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0374685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>