24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_3251 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_3251  predicted protein  100 
 
 
294 aa  613  9.999999999999999e-175  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42117  predicted protein  41.69 
 
 
446 aa  224  1e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0484588  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12370  predicted protein  35.23 
 
 
308 aa  141  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_35989  predicted protein  34.58 
 
 
434 aa  135  9e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33787  predicted protein  36.6 
 
 
586 aa  118  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.715519  normal  0.121325 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02933  F-box and JmjC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08170)  33.48 
 
 
384 aa  117  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.89532 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46234  predicted protein  33.18 
 
 
535 aa  111  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1970  JmjC domain-containing protein  27.76 
 
 
263 aa  89.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0481  JmjC domain-containing protein  28.14 
 
 
263 aa  89  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0632946  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2065  JmjC domain-containing protein  28.14 
 
 
263 aa  89  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0793  JmjC domain-containing protein  27.38 
 
 
263 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.972855  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0552  JmjC domain-containing protein  27.38 
 
 
263 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0664  JmjC domain-containing protein  27.38 
 
 
263 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.544453  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1617  JmjC domain-containing protein  27.38 
 
 
263 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148097  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43557  predicted protein  28.75 
 
 
418 aa  72  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48473  predicted protein  22.98 
 
 
343 aa  52  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31860  predicted protein  26.45 
 
 
136 aa  45.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.841856 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_93634  predicted protein  23.81 
 
 
390 aa  43.9  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.38611 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_94145  predicted protein  23.81 
 
 
390 aa  43.9  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.899181  hitchhiker  0.0031942 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0936  JmjC domain-containing protein  22.47 
 
 
294 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0374685  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0224  JmjC domain-containing protein  22.03 
 
 
353 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000739958  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1563  JmjC domain-containing protein  22.03 
 
 
353 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100796  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1121  JmjC domain-containing protein  22.03 
 
 
353 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000573239  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2148  JmjC domain-containing protein  22.03 
 
 
353 aa  42.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000110668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>