16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1842 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1842  transcription factor jumonji/aspartyl beta- hydroxylase  100 
 
 		 297 aa  624  1e-178  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2998  transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase  42.07 
 
 		 303 aa  218  8.999999999999998e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279954 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1520  transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase  37.55 
 
 		 313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0253  transcription factor jumonji jmjC domain protein  36.67 
 
 		 293 aa  179  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1272  transcription factor jumonji, jmjC  34.41 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306298  normal  0.0564395 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1917  transcription factor jumonji, JmjC  35.93 
 
 		 291 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.208156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1065  transcription factor jumonji, jmjC  35.42 
 
 		 293 aa  165  9e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1699  transcription factor jumonji JmjC domain protein  33.74 
 
 		 297 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.298752 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1700  transcription factor jumonji JmjC domain protein  32.84 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.394813 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1682  transcription factor jumonji domain-containing protein  31.95 
 
 		 328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0968359  normal  0.585972 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0004  hypothetical protein  29.51 
 
 		 328 aa  115  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3861  transcription factor jumonji JmjC domain protein  27.92 
 
 		 352 aa  99.8  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0608418 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1353  hypothetical protein  27.27 
 
 		 305 aa  75.5  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1726  hypothetical protein  23.48 
 
 		 317 aa  67  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50022  normal  0.167249 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37877  predicted protein  31.25 
 
 		 297 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.11402  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4326  hypothetical protein  25.86 
 
 		 338 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>