14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1520 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1520  transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase  100 
 
 		 313 aa  646    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1272  transcription factor jumonji, jmjC  91.05 
 
 		 313 aa  595  1e-169  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306298  normal  0.0564395 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0253  transcription factor jumonji jmjC domain protein  54.77 
 
 		 293 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2998  transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase  40.21 
 
 		 303 aa  225  8e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279954 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1842  transcription factor jumonji/aspartyl beta- hydroxylase  37.55 
 
 		 297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1699  transcription factor jumonji JmjC domain protein  33.46 
 
 		 297 aa  149  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.298752 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1917  transcription factor jumonji, JmjC  34.69 
 
 		 291 aa  147  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.208156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1700  transcription factor jumonji JmjC domain protein  33.1 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.394813 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0004  hypothetical protein  29.89 
 
 		 328 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1065  transcription factor jumonji, jmjC  29.62 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1682  transcription factor jumonji domain-containing protein  28.89 
 
 		 328 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0968359  normal  0.585972 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3861  transcription factor jumonji JmjC domain protein  25.08 
 
 		 352 aa  78.2  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0608418 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1726  hypothetical protein  24.1 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50022  normal  0.167249 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1353  hypothetical protein  23.39 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>