16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1065 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1065  transcription factor jumonji, jmjC  100 
 
 		 293 aa  602  1.0000000000000001e-171  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1917  transcription factor jumonji, JmjC  55.64 
 
 		 291 aa  300  2e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.208156  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1842  transcription factor jumonji/aspartyl beta- hydroxylase  35.42 
 
 		 297 aa  181  9.000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2998  transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase  38.21 
 
 		 303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279954 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0253  transcription factor jumonji jmjC domain protein  35.29 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1520  transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase  30.31 
 
 		 313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1272  transcription factor jumonji, jmjC  29.27 
 
 		 313 aa  133  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306298  normal  0.0564395 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1700  transcription factor jumonji JmjC domain protein  35.71 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.394813 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0004  hypothetical protein  29.77 
 
 		 328 aa  125  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1682  transcription factor jumonji domain-containing protein  29.64 
 
 		 328 aa  109  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0968359  normal  0.585972 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1699  transcription factor jumonji JmjC domain protein  26.98 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.298752 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3861  transcription factor jumonji JmjC domain protein  27.84 
 
 		 352 aa  87.8  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0608418 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1353  hypothetical protein  25.74 
 
 		 305 aa  53.1  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4326  hypothetical protein  27.73 
 
 		 338 aa  46.6  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34749  predicted protein  30.36 
 
 		 373 aa  43.1  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.533757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42544  predicted protein  25.44 
 
 		 239 aa  42.7  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.165779  normal  0.224356 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>