16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1917 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1917  transcription factor jumonji, JmjC  100 
 
 		 291 aa  590  1e-167  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.208156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1065  transcription factor jumonji, jmjC  55.64 
 
 		 293 aa  286  2e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2998  transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase  38.85 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279954 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1842  transcription factor jumonji/aspartyl beta- hydroxylase  35.93 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1520  transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase  34.69 
 
 		 313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1272  transcription factor jumonji, jmjC  34.29 
 
 		 313 aa  151  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306298  normal  0.0564395 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0253  transcription factor jumonji jmjC domain protein  33.47 
 
 		 293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0004  hypothetical protein  32.56 
 
 		 328 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1700  transcription factor jumonji JmjC domain protein  35.6 
 
 		 297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.394813 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1682  transcription factor jumonji domain-containing protein  34.41 
 
 		 328 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0968359  normal  0.585972 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1699  transcription factor jumonji JmjC domain protein  30.54 
 
 		 297 aa  105  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.298752 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3861  transcription factor jumonji JmjC domain protein  25.18 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0608418 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1353  hypothetical protein  25.64 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1726  hypothetical protein  23.64 
 
 		 317 aa  49.3  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50022  normal  0.167249 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2881  amidohydrolase  33.64 
 
 		 819 aa  49.3  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42544  predicted protein  26.32 
 
 		 239 aa  42.7  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.165779  normal  0.224356 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>