55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2198 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2198  Sterol-binding domain protein  100 
 
 		 110 aa  224  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1939  sterol-binding  40.82 
 
 		 105 aa  84  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.530915  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3466  hypothetical protein  37.86 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40860  hypothetical protein  37.86 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27580  Sterol-binding protein  35.92 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1531  sterol-binding domain-containing protein  35.24 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00600993  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1911  sterol-binding domain-containing protein  34.95 
 
 		 105 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272988  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3924  sterol-binding domain protein  34.95 
 
 		 105 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0884325 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2725  SCP-2 sterol transfer family protein  35.92 
 
 		 105 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3558  sterol-binding domain-containing protein  33.98 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336208  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3116  sterol-binding  33.98 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2532  sterol-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0766724  normal  0.1396 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1572  sterol-binding domain-containing protein  33.67 
 
 		 104 aa  70.1  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246813  hitchhiker  0.000825534 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2458  sterol-binding  33.98 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0333182  normal  0.0363969 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3213  sterol-binding domain-containing protein  33.01 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.533818 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.61 
 
 		 913 aa  65.5  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6978  hypothetical protein  33.66 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.664684  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1526  Sterol-binding domain protein  32.08 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1621  Sterol-binding domain protein  32.08 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0522723  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2343  putative sterol carrier protein  32.08 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.606511  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3405  hypothetical protein  32.22 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.952914  normal  0.525211 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0733  Sterol-binding domain protein  31.82 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2459  sterol-binding protein  34.58 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.676777  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1523  sterol-binding domain-containing protein  31.76 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0540458 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0143  sterol-binding domain-containing protein  32.08 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.110171  decreased coverage  0.0000248953 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0137  sterol-binding domain-containing protein  32.08 
 
 		 150 aa  60.1  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.16 
 
 		 710 aa  59.7  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1531  sterol-binding domain-containing protein  32.41 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.642179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1772  sterol-binding domain-containing protein  32.14 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2243  Sterol-binding domain protein  28.92 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0141  Sterol-binding domain protein  29.55 
 
 		 117 aa  52  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0558  sterol-binding domain-containing protein  29.41 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184806 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1608  hypothetical protein  35.53 
 
 		 131 aa  50.1  0.000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6473  Sterol-binding domain protein  26.21 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2813  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.18 
 
 		 450 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0357883  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0781  sterol-binding domain protein  33.33 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0276166  normal  0.045948 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2997  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.67 
 
 		 442 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4826  sterol-binding domain-containing protein  28.3 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3015  Sterol-binding domain-containing protein  28.21 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.19531  normal  0.172017 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1083  sterol-binding domain-containing protein  46 
 
 		 94 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2880  sterol-binding  31.18 
 
 		 93 aa  44.3  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.933965 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2419  hypothetical protein  46 
 
 		 94 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.457886  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1303  hypothetical protein  25.45 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.097022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1843  transcription factor jumonji, jmjC  32.05 
 
 		 376 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3107  sterol-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 189 aa  43.9  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2004  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.45 
 
 		 450 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1641  transcription factor jumonji  31.33 
 
 		 373 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3629  hypothetical protein  32.91 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.191234  normal  0.451021 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1830  sterol-binding domain-containing protein  31.46 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.955664  normal  0.546759 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3088  Sterol-binding domain protein  30.1 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.54712 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1562  sterol-binding domain-containing protein  42 
 
 		 94 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764307  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40664  Oleate-induced peroxisomal protein POX18 (Lipid-transfer protein) (PXP-18)  31.82 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.197968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.33 
 
 		 445 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1890  sterol-binding domain-containing protein  35.29 
 
 		 183 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.019099  hitchhiker  0.00481889 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3788  transcription factor jumonji domain-containing protein  27.71 
 
 		 373 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>