25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4826 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4826  sterol-binding domain-containing protein  100 
 
 		 157 aa  317  3e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0137  sterol-binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 150 aa  120  9e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0143  sterol-binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.110171  decreased coverage  0.0000248953 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6978  hypothetical protein  39.73 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.664684  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3434  hypothetical protein  40 
 
 		 157 aa  106  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1303  hypothetical protein  37.91 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.097022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0558  sterol-binding domain-containing protein  40.15 
 
 		 149 aa  96.3  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3015  Sterol-binding domain-containing protein  31.82 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.19531  normal  0.172017 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1531  sterol-binding domain-containing protein  26.92 
 
 		 104 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00600993  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3466  hypothetical protein  27.88 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40860  hypothetical protein  27.88 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2532  sterol-binding domain-containing protein  26.92 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0766724  normal  0.1396 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1572  sterol-binding domain-containing protein  25.74 
 
 		 104 aa  47.8  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246813  hitchhiker  0.000825534 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27580  Sterol-binding protein  28.85 
 
 		 104 aa  47.4  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3213  sterol-binding domain-containing protein  29.29 
 
 		 105 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.533818 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2198  Sterol-binding domain protein  28.3 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1911  sterol-binding domain-containing protein  29.29 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272988  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3924  sterol-binding domain protein  29.29 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0884325 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.18 
 
 		 913 aa  45.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3558  sterol-binding domain-containing protein  29.29 
 
 		 105 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336208  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0733  Sterol-binding domain protein  27.84 
 
 		 116 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 710 aa  43.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1939  sterol-binding  25.71 
 
 		 105 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.530915  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3116  sterol-binding  27.27 
 
 		 105 aa  41.6  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2458  sterol-binding  27.72 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0333182  normal  0.0363969 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>