47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_27580 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_27580  Sterol-binding protein  100 
 
 		 104 aa  214  4e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3466  hypothetical protein  76.92 
 
 		 104 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40860  hypothetical protein  76.92 
 
 		 104 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2532  sterol-binding domain-containing protein  68.63 
 
 		 103 aa  151  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0766724  normal  0.1396 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2458  sterol-binding  67.62 
 
 		 105 aa  147  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0333182  normal  0.0363969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2725  SCP-2 sterol transfer family protein  64.76 
 
 		 105 aa  144  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3213  sterol-binding domain-containing protein  64.42 
 
 		 105 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.533818 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3924  sterol-binding domain protein  63.46 
 
 		 105 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0884325 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1911  sterol-binding domain-containing protein  63.46 
 
 		 105 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3116  sterol-binding  61.54 
 
 		 105 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3558  sterol-binding domain-containing protein  61.54 
 
 		 105 aa  131  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336208  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1939  sterol-binding  54.37 
 
 		 105 aa  123  9e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.530915  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1531  sterol-binding domain-containing protein  54.9 
 
 		 104 aa  122  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00600993  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1572  sterol-binding domain-containing protein  46.6 
 
 		 104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246813  hitchhiker  0.000825534 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2198  Sterol-binding domain protein  35.92 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0733  Sterol-binding domain protein  40.57 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0141  Sterol-binding domain protein  44.71 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3405  hypothetical protein  36.36 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.952914  normal  0.525211 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1523  sterol-binding domain-containing protein  35.29 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0540458 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 		 913 aa  64.7  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.31 
 
 		 710 aa  57.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  30.85 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2459  sterol-binding protein  34.95 
 
 		 116 aa  52.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.676777  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0781  sterol-binding domain protein  34.74 
 
 		 95 aa  49.7  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0276166  normal  0.045948 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0137  sterol-binding domain-containing protein  27.45 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0558  sterol-binding domain-containing protein  25.49 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184806 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0143  sterol-binding domain-containing protein  33.82 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.110171  decreased coverage  0.0000248953 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01560  sterol-binding protein  26.47 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1531  sterol-binding domain-containing protein  31.48 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.642179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1890  sterol-binding domain-containing protein  45.1 
 
 		 183 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.019099  hitchhiker  0.00481889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4826  sterol-binding domain-containing protein  28.85 
 
 		 157 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2973  hypothetical protein  45.1 
 
 		 183 aa  47  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1369  beta-lactamase domain-containing protein  27.16 
 
 		 595 aa  47  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.923314  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0571  sterol-binding  30.39 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00913104  hitchhiker  0.00000396662 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1772  sterol-binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2343  putative sterol carrier protein  30.85 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.606511  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1526  Sterol-binding domain protein  30.85 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1621  Sterol-binding domain protein  30.85 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0522723  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2813  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.88 
 
 		 450 aa  44.7  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0357883  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3015  Sterol-binding domain-containing protein  36.76 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.19531  normal  0.172017 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6978  hypothetical protein  27.27 
 
 		 212 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.664684  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1830  sterol-binding domain-containing protein  46.67 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.955664  normal  0.546759 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3313  sterol-binding  38.98 
 
 		 99 aa  42  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00254715  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4446  sterol-binding domain-containing protein  26.67 
 
 		 103 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.700528  normal  0.0485279 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0960  sterol-binding domain-containing protein  42.55 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1641  transcription factor jumonji  28.12 
 
 		 373 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1002  sterol-binding domain-containing protein  29.91 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>