29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0960 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0960  sterol-binding domain-containing protein  100 
 
 		 179 aa  362  2e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2973  hypothetical protein  35.83 
 
 		 183 aa  108  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1890  sterol-binding domain-containing protein  32.26 
 
 		 183 aa  96.7  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.019099  hitchhiker  0.00481889 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0226  sterol-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4957  hypothetical protein  25.53 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3107  sterol-binding domain-containing protein  30.4 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2343  putative sterol carrier protein  35.62 
 
 		 110 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.606511  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1621  Sterol-binding domain protein  35.62 
 
 		 110 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0522723  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1526  Sterol-binding domain protein  35.62 
 
 		 110 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0733  Sterol-binding domain protein  40.82 
 
 		 116 aa  51.6  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6206  Sterol-binding domain protein  43.1 
 
 		 98 aa  48.9  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.369856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1531  sterol-binding domain-containing protein  54.05 
 
 		 111 aa  48.5  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.642179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3466  hypothetical protein  47.92 
 
 		 104 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40860  hypothetical protein  47.92 
 
 		 104 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2880  sterol-binding  43.75 
 
 		 93 aa  45.1  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.933965 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1830  sterol-binding domain-containing protein  47.83 
 
 		 94 aa  44.7  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.955664  normal  0.546759 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0141  Sterol-binding domain protein  42.22 
 
 		 117 aa  44.7  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3313  sterol-binding  42.86 
 
 		 99 aa  44.3  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00254715  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2532  sterol-binding domain-containing protein  39.24 
 
 		 103 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0766724  normal  0.1396 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1531  sterol-binding domain-containing protein  45.83 
 
 		 104 aa  43.9  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00600993  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0781  sterol-binding domain protein  42.86 
 
 		 95 aa  44.3  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0276166  normal  0.045948 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2725  SCP-2 sterol transfer family protein  34.02 
 
 		 105 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0571  sterol-binding  46.81 
 
 		 104 aa  43.5  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00913104  hitchhiker  0.00000396662 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3405  hypothetical protein  28.36 
 
 		 115 aa  42  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.952914  normal  0.525211 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1562  sterol-binding domain-containing protein  41.86 
 
 		 94 aa  41.6  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764307  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27580  Sterol-binding protein  42.55 
 
 		 104 aa  41.6  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3088  Sterol-binding domain protein  34.78 
 
 		 99 aa  41.6  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.54712 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1083  sterol-binding domain-containing protein  41.86 
 
 		 94 aa  41.2  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2419  hypothetical protein  41.86 
 
 		 94 aa  41.2  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.457886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>