26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6206 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6206  Sterol-binding domain protein  100 
 
 		 98 aa  197  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.369856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4726  Sterol-binding domain protein  48.98 
 
 		 100 aa  100  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3088  Sterol-binding domain protein  45.74 
 
 		 99 aa  82.4  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.54712 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2819  sterol-binding  41.84 
 
 		 98 aa  77  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108111  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1218  sterol-binding domain-containing protein  43.01 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1315  sterol-binding  32.22 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2880  sterol-binding  57.14 
 
 		 93 aa  60.8  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.933965 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0781  sterol-binding domain protein  39.51 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0276166  normal  0.045948 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4446  sterol-binding domain-containing protein  32.99 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.700528  normal  0.0485279 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2343  putative sterol carrier protein  42.19 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.606511  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1621  Sterol-binding domain protein  43.08 
 
 		 110 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0522723  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1526  Sterol-binding domain protein  43.08 
 
 		 110 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1562  sterol-binding domain-containing protein  36.67 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764307  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0571  sterol-binding  33.33 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00913104  hitchhiker  0.00000396662 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3313  sterol-binding  34.83 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00254715  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0960  sterol-binding domain-containing protein  43.1 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1531  sterol-binding domain-containing protein  39.06 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.642179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0733  Sterol-binding domain protein  43.48 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2419  hypothetical protein  36.11 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.457886  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1083  sterol-binding domain-containing protein  36.11 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2243  Sterol-binding domain protein  48.84 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0141  Sterol-binding domain protein  40.43 
 
 		 117 aa  44.3  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1830  sterol-binding domain-containing protein  34.15 
 
 		 94 aa  43.9  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.955664  normal  0.546759 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.85 
 
 		 913 aa  43.9  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1980  hypothetical protein  30.68 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.428299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2459  sterol-binding protein  30.39 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.676777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>