24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2243 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2243  Sterol-binding domain protein  100 
 
 
106 aa  219  9e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2343  putative sterol carrier protein  35.48 
 
 
110 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.606511  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1621  Sterol-binding domain protein  35.48 
 
 
110 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0522723  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1526  Sterol-binding domain protein  35.48 
 
 
110 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1531  sterol-binding domain-containing protein  35.16 
 
 
111 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.642179  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0733  Sterol-binding domain protein  30 
 
 
116 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0141  Sterol-binding domain protein  30.59 
 
 
117 aa  60.1  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1572  sterol-binding domain-containing protein  34.88 
 
 
104 aa  57.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246813  hitchhiker  0.000825534 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.44 
 
 
913 aa  57.4  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01560  sterol-binding protein  35.96 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2198  Sterol-binding domain protein  28.92 
 
 
110 aa  53.9  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2459  sterol-binding protein  35.35 
 
 
116 aa  53.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.676777  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1772  sterol-binding domain-containing protein  24.76 
 
 
115 aa  52.8  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2880  sterol-binding  35.14 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.933965 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6206  Sterol-binding domain protein  48.84 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.369856  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3405  hypothetical protein  22.22 
 
 
115 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.952914  normal  0.525211 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2973  hypothetical protein  24.75 
 
 
183 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3466  hypothetical protein  25 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40860  hypothetical protein  25 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1890  sterol-binding domain-containing protein  23.76 
 
 
183 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.019099  hitchhiker  0.00481889 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3558  sterol-binding domain-containing protein  23.71 
 
 
105 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336208  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0571  sterol-binding  36.23 
 
 
104 aa  40.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00913104  hitchhiker  0.00000396662 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4726  Sterol-binding domain protein  36.36 
 
 
100 aa  40.4  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3313  sterol-binding  33.33 
 
 
99 aa  40  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00254715  normal  0.0577925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>