44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2459 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2459  sterol-binding protein  100 
 
 		 116 aa  236  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.676777  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1621  Sterol-binding domain protein  34.86 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0522723  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1526  Sterol-binding domain protein  34.86 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2343  putative sterol carrier protein  34.86 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.606511  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1531  sterol-binding domain-containing protein  34.29 
 
 		 111 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.642179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2198  Sterol-binding domain protein  34.58 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4446  sterol-binding domain-containing protein  40.4 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.700528  normal  0.0485279 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1531  sterol-binding domain-containing protein  32.04 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00600993  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0141  Sterol-binding domain protein  33.96 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3558  sterol-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336208  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0733  Sterol-binding domain protein  31.13 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27580  Sterol-binding protein  34.95 
 
 		 104 aa  52.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2243  Sterol-binding domain protein  35.35 
 
 		 106 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3924  sterol-binding domain protein  31.37 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0884325 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3213  sterol-binding domain-containing protein  31.37 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.533818 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1911  sterol-binding domain-containing protein  31.37 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0781  sterol-binding domain protein  36.36 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0276166  normal  0.045948 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1572  sterol-binding domain-containing protein  29.7 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246813  hitchhiker  0.000825534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3116  sterol-binding  30.39 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40860  hypothetical protein  30.61 
 
 		 104 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3466  hypothetical protein  30.61 
 
 		 104 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1939  sterol-binding  27.18 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.530915  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3088  Sterol-binding domain protein  33.73 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.54712 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2532  sterol-binding domain-containing protein  30.61 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0766724  normal  0.1396 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2725  SCP-2 sterol transfer family protein  30.39 
 
 		 105 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2458  sterol-binding  29.41 
 
 		 105 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0333182  normal  0.0363969 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1830  sterol-binding domain-containing protein  44.68 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.955664  normal  0.546759 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47942  predicted protein  43.24 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.1 
 
 		 710 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05484  lipid transfer protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13280)  31.87 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2880  sterol-binding  29.79 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.933965 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01560  sterol-binding protein  25.49 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2819  sterol-binding  35.29 
 
 		 98 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108111  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1523  sterol-binding domain-containing protein  25.96 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0540458 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0571  sterol-binding  32.91 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00913104  hitchhiker  0.00000396662 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1315  sterol-binding  28 
 
 		 99 aa  41.2  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0143  sterol-binding domain-containing protein  29.52 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.110171  decreased coverage  0.0000248953 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3405  hypothetical protein  24.3 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.952914  normal  0.525211 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2419  hypothetical protein  32.56 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.457886  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1843  transcription factor jumonji, jmjC  31.03 
 
 		 376 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1083  sterol-binding domain-containing protein  32.56 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6206  Sterol-binding domain protein  30.39 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.369856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1002  sterol-binding domain-containing protein  30 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3313  sterol-binding  34.52 
 
 		 99 aa  40  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00254715  normal  0.0577925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>