47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1572 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1572  sterol-binding domain-containing protein  100 
 
 		 104 aa  210  4.9999999999999996e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246813  hitchhiker  0.000825534 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1939  sterol-binding  54.37 
 
 		 105 aa  124  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.530915  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1531  sterol-binding domain-containing protein  53.92 
 
 		 104 aa  113  8.999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00600993  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27580  Sterol-binding protein  46.6 
 
 		 104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3466  hypothetical protein  46.6 
 
 		 104 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40860  hypothetical protein  46.6 
 
 		 104 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2532  sterol-binding domain-containing protein  46.39 
 
 		 103 aa  100  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0766724  normal  0.1396 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2458  sterol-binding  46.15 
 
 		 105 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0333182  normal  0.0363969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2725  SCP-2 sterol transfer family protein  45.19 
 
 		 105 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3924  sterol-binding domain protein  44.23 
 
 		 105 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0884325 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1911  sterol-binding domain-containing protein  44.23 
 
 		 105 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3213  sterol-binding domain-containing protein  43.27 
 
 		 105 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.533818 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3558  sterol-binding domain-containing protein  44.23 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336208  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3116  sterol-binding  43.27 
 
 		 105 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2198  Sterol-binding domain protein  33.67 
 
 		 110 aa  70.1  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0141  Sterol-binding domain protein  40.45 
 
 		 117 aa  67  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3405  hypothetical protein  33 
 
 		 115 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.952914  normal  0.525211 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0733  Sterol-binding domain protein  38.32 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1523  sterol-binding domain-containing protein  31.68 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0540458 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1772  sterol-binding domain-containing protein  31.17 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2243  Sterol-binding domain protein  34.88 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0143  sterol-binding domain-containing protein  29.7 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.110171  decreased coverage  0.0000248953 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0137  sterol-binding domain-containing protein  28.71 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26 
 
 		 913 aa  53.9  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1641  transcription factor jumonji  32.91 
 
 		 373 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1608  hypothetical protein  35.82 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2459  sterol-binding protein  29.7 
 
 		 116 aa  51.2  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.676777  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.3 
 
 		 710 aa  50.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2343  putative sterol carrier protein  27.1 
 
 		 110 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.606511  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1621  Sterol-binding domain protein  27.1 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0522723  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1526  Sterol-binding domain protein  27.1 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4826  sterol-binding domain-containing protein  25.74 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0558  sterol-binding domain-containing protein  23.36 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184806 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3088  Sterol-binding domain protein  34.15 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.54712 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0571  sterol-binding  42 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00913104  hitchhiker  0.00000396662 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1531  sterol-binding domain-containing protein  26.17 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.642179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1890  sterol-binding domain-containing protein  39.58 
 
 		 183 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.019099  hitchhiker  0.00481889 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2973  hypothetical protein  39.58 
 
 		 183 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3016  beta-lactamase-like protein  31.82 
 
 		 653 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.401526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  26.14 
 
 		 229 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6978  hypothetical protein  25.51 
 
 		 212 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.664684  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3434  hypothetical protein  25.89 
 
 		 157 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2008  transcriptional regulator, HxlR family  29.67 
 
 		 222 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3788  transcription factor jumonji domain-containing protein  27.37 
 
 		 373 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01560  sterol-binding protein  27.27 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3313  sterol-binding  39.66 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00254715  normal  0.0577925 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05484  lipid transfer protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13280)  29.52 
 
 		 129 aa  40  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>