21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1608 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1608  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  263  5e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1939  sterol-binding  35.29 
 
 		 105 aa  53.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.530915  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1572  sterol-binding domain-containing protein  35.82 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246813  hitchhiker  0.000825534 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2198  Sterol-binding domain protein  35.53 
 
 		 110 aa  50.1  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1911  sterol-binding domain-containing protein  30.56 
 
 		 105 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3405  hypothetical protein  38.75 
 
 		 115 aa  47  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.952914  normal  0.525211 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3924  sterol-binding domain protein  30.56 
 
 		 105 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0884325 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3116  sterol-binding  30.56 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1523  sterol-binding domain-containing protein  35.63 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0540458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3558  sterol-binding domain-containing protein  30.56 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336208  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0733  Sterol-binding domain protein  36.23 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3213  sterol-binding domain-containing protein  29.17 
 
 		 105 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.533818 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2532  sterol-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0766724  normal  0.1396 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40860  hypothetical protein  33.33 
 
 		 104 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3466  hypothetical protein  33.33 
 
 		 104 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1908  hypothetical protein  33.82 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.253393 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1772  sterol-binding domain-containing protein  31.03 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2725  SCP-2 sterol transfer family protein  28.21 
 
 		 105 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1531  sterol-binding domain-containing protein  29 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00600993  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2458  sterol-binding  26.92 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0333182  normal  0.0363969 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01560  sterol-binding protein  29.63 
 
 		 138 aa  40  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>