37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3405 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3405  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  237  4e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.952914  normal  0.525211 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1523  sterol-binding domain-containing protein  82.88 
 
 		 112 aa  192  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0540458 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40860  hypothetical protein  39.81 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3466  hypothetical protein  39.81 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1531  sterol-binding domain-containing protein  41.76 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00600993  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3116  sterol-binding  38.61 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1939  sterol-binding  35.05 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.530915  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2532  sterol-binding domain-containing protein  35.92 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0766724  normal  0.1396 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27580  Sterol-binding protein  36.36 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3558  sterol-binding domain-containing protein  38.38 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336208  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3213  sterol-binding domain-containing protein  37.37 
 
 		 105 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.533818 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1911  sterol-binding domain-containing protein  37.37 
 
 		 105 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272988  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3924  sterol-binding domain protein  37.37 
 
 		 105 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0884325 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1572  sterol-binding domain-containing protein  33 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246813  hitchhiker  0.000825534 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0733  Sterol-binding domain protein  35.16 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2458  sterol-binding  35.29 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0333182  normal  0.0363969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2725  SCP-2 sterol transfer family protein  34.31 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0141  Sterol-binding domain protein  35.29 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2198  Sterol-binding domain protein  32.22 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.42 
 
 		 913 aa  53.5  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1608  hypothetical protein  38.75 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2243  Sterol-binding domain protein  22.22 
 
 		 106 aa  45.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2997  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.93 
 
 		 442 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6978  hypothetical protein  24.76 
 
 		 212 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.664684  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2343  putative sterol carrier protein  24.39 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.606511  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1621  Sterol-binding domain protein  24.39 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0522723  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1526  Sterol-binding domain protein  24.39 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2813  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.39 
 
 		 450 aa  44.3  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0357883  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2004  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.3 
 
 		 450 aa  43.9  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.18 
 
 		 710 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.82 
 
 		 445 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0143  sterol-binding domain-containing protein  27.55 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.110171  decreased coverage  0.0000248953 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3162  hypothetical protein  33.9 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00846617  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0960  sterol-binding domain-containing protein  28.36 
 
 		 179 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2459  sterol-binding protein  24.3 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.676777  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2973  hypothetical protein  25.61 
 
 		 183 aa  40  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  32.65 
 
 		 229 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>