31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1523 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1523  sterol-binding domain-containing protein  100 
 
 		 112 aa  230  5e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0540458 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3405  hypothetical protein  82.88 
 
 		 115 aa  192  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.952914  normal  0.525211 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2532  sterol-binding domain-containing protein  35.92 
 
 		 103 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0766724  normal  0.1396 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3466  hypothetical protein  38.83 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40860  hypothetical protein  38.83 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3213  sterol-binding domain-containing protein  38.61 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.533818 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3116  sterol-binding  38.38 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1531  sterol-binding domain-containing protein  39.56 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00600993  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3558  sterol-binding domain-containing protein  38.61 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336208  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1911  sterol-binding domain-containing protein  37.62 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272988  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3924  sterol-binding domain protein  37.62 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0884325 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27580  Sterol-binding protein  35.29 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2458  sterol-binding  36.27 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0333182  normal  0.0363969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2725  SCP-2 sterol transfer family protein  34.31 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1939  sterol-binding  32.22 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.530915  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2198  Sterol-binding domain protein  31.76 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1572  sterol-binding domain-containing protein  31.68 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246813  hitchhiker  0.000825534 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0141  Sterol-binding domain protein  35.29 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.47 
 
 		 913 aa  53.9  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0733  Sterol-binding domain protein  32.18 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2343  putative sterol carrier protein  28.05 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.606511  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2813  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 450 aa  47.4  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0357883  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1772  sterol-binding domain-containing protein  27.91 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1608  hypothetical protein  35.63 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1899  hypothetical protein  32.71 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.242028  hitchhiker  0.0000173761 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2004  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.85 
 
 		 450 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1526  Sterol-binding domain protein  26.83 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1621  Sterol-binding domain protein  26.83 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0522723  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1531  sterol-binding domain-containing protein  23.47 
 
 		 111 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.642179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2459  sterol-binding protein  25.96 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.676777  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.87 
 
 		 445 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>