248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2813 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2813  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
450 aa  929    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0357883  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  59.95 
 
 
445 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2669  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  56.15 
 
 
450 aa  526  1e-148  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.848409  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2004  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  54.14 
 
 
450 aa  508  1e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2997  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  53.79 
 
 
442 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4256  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  55.06 
 
 
344 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4342  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  55.06 
 
 
344 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.298178  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4635  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  55.06 
 
 
344 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.183836  normal  0.857379 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  53.71 
 
 
343 aa  396  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.418818  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1581  hypothetical protein  28.49 
 
 
359 aa  66.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1699  domain of unknown function DUF1730  29.63 
 
 
318 aa  66.2  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  34.65 
 
 
393 aa  63.2  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0983  putative iron-sulfur cluster-binding protein  29.5 
 
 
404 aa  62.4  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1045  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  29.5 
 
 
398 aa  62.4  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0200  hypothetical protein  26.67 
 
 
383 aa  62  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1748  domain of unknown function DUF1730  25.42 
 
 
335 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0460  putative iron-sulfur cluster binding protein  27.17 
 
 
380 aa  60.8  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1876  domain of unknown function DUF1730  35.87 
 
 
314 aa  60.5  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0600  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  26.63 
 
 
380 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0245724  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0514  iron-sulfur cluster-binding protein  26.63 
 
 
380 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0457  hypothetical protein  26.63 
 
 
380 aa  60.1  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00117546  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0453  hypothetical protein  26.63 
 
 
380 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0545  iron-sulfur cluster-binding protein  26.63 
 
 
380 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00111549  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0621  putative iron-sulfur cluster-binding protein  26.63 
 
 
380 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0546  putative iron-sulfur cluster-binding protein  26.63 
 
 
380 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9308099999999996e-42 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002253  iron-sulfur cluster-binding protein  28.48 
 
 
375 aa  59.7  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000253209  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0582  putative iron-sulfur cluster-binding protein  26.63 
 
 
380 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0177  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.78 
 
 
349 aa  59.3  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0500483  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00099  iron-sulfur cluster-binding protein  27.85 
 
 
375 aa  59.3  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3598  hypothetical protein  28.78 
 
 
383 aa  59.7  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0372  iron-sulfur cluster binding protein  36.59 
 
 
314 aa  59.3  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3534  hypothetical protein  28.78 
 
 
387 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4756  putative iron-sulfur cluster-binding protein  26.63 
 
 
380 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0149452  hitchhiker  2.27135e-16 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0658  hypothetical protein  29.7 
 
 
320 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1368  iron-sulfur cluster binding protein  28.8 
 
 
380 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0340  iron-sulfur cluster binding protein  33.71 
 
 
390 aa  58.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2662  domain of unknown function DUF1730  28.06 
 
 
392 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1152  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.51 
 
 
354 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.592617  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0118  putative iron-sulfur cluster binding protein  26.62 
 
 
372 aa  58.2  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.921505  normal  0.832944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1629  iron-sulfur cluster binding protein  27.03 
 
 
312 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103841  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2833  iron-sulfur cluster-binding protein  24.58 
 
 
323 aa  57.8  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0440  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.15 
 
 
388 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1141  domain of unknown function DUF1730  28.34 
 
 
357 aa  57.8  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10760  iron-sulfur cluster binding protein, putative  31.47 
 
 
367 aa  57.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00274595  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1081  4Fe-4S cluster binding  36.59 
 
 
404 aa  57.4  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2783  hypothetical protein  36.56 
 
 
347 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314535  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0468  putative iron-sulfur cluster binding protein  29.17 
 
 
380 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.385519  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0663  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.11 
 
 
382 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.300921 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1519  iron-sulfur cluster binding protein  34.31 
 
 
308 aa  57.4  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120266  normal  0.625515 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2385  hypothetical protein  28.06 
 
 
349 aa  57  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1334  hypothetical protein  46.38 
 
 
312 aa  57  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0434  iron-sulfur cluster-binding protein  31.78 
 
 
314 aa  56.6  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2784  hypothetical protein  31.18 
 
 
343 aa  56.6  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0503  iron-sulfur cluster binding protein  28.31 
 
 
389 aa  56.6  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2290  hypothetical protein  32.58 
 
 
347 aa  56.6  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0517  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  25.87 
 
 
374 aa  56.2  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4975  domain of unknown function DUF1730  33.33 
 
 
315 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00114037  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2782  putative ferredoxin, 4Fe-4S binding protein  36.59 
 
 
372 aa  55.5  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0043  domain of unknown function DUF1730  33.33 
 
 
370 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3307  putative 4Fe-4S binding domain protein  31.46 
 
 
344 aa  55.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0752  domain of unknown function DUF1730  35.96 
 
 
383 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2342  protein of unknown function DUF1730  27.34 
 
 
356 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.932969 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1271  4Fe-4S cluster binding  33 
 
 
374 aa  55.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2753  iron-sulfur cluster-binding protein  33.7 
 
 
369 aa  55.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006724  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4319  domain of unknown function DUF1730  32.58 
 
 
383 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0221  hypothetical protein  32.58 
 
 
325 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0524  putative 4Fe-4S ferredoxin  35.37 
 
 
405 aa  54.7  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.77669  normal  0.0275938 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1143  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur cluster binding protein  31.46 
 
 
348 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0519  4Fe-4S cluster binding  35.37 
 
 
405 aa  54.7  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0276415  decreased coverage  0.00221689 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  32.58 
 
 
374 aa  55.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0830  putative iron-sulfur cluster binding protein  26.25 
 
 
428 aa  54.7  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.86 
 
 
227 aa  54.7  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3141  iron-sulfur cluster-binding protein  25.56 
 
 
182 aa  54.7  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00061  hypothetical protein  44.93 
 
 
312 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2804  hypothetical protein  31.46 
 
 
348 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04033  predicted Fe-S electron transport protein  34.41 
 
 
379 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000233876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3827  iron-sulfur cluster binding protein  34.41 
 
 
379 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294328  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3682  iron-sulfur cluster binding protein  28.06 
 
 
366 aa  54.7  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.253797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2229  4Fe-4S cluster binding  24.86 
 
 
324 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.212465  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1809  hypothetical protein  32.58 
 
 
385 aa  54.3  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.188281 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03995  hypothetical protein  34.41 
 
 
379 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000106432  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3998  domain of unknown function DUF1730  34.02 
 
 
308 aa  54.3  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0656648  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4723  iron-sulfur cluster binding protein  34.41 
 
 
379 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626886  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4634  putative iron-sulfur cluster binding protein  34.41 
 
 
384 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000341327  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4753  putative iron-sulfur cluster binding protein  34.41 
 
 
384 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00412785  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2853  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  33.62 
 
 
343 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4774  putative iron-sulfur cluster binding protein  34.41 
 
 
384 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0366705  normal  0.043554 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4624  putative iron-sulfur cluster binding protein  34.41 
 
 
384 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000999766  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.46 
 
 
380 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4697  iron-sulfur cluster binding protein  34.41 
 
 
379 aa  54.3  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4821  putative iron-sulfur cluster binding protein  34.15 
 
 
308 aa  54.7  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4409  iron-sulfur cluster binding protein  34.41 
 
 
379 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.448649999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5682  iron-sulfur cluster binding protein  34.41 
 
 
379 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000046188  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3847  iron-sulfur cluster binding protein  34.41 
 
 
379 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000133072  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5422  domain of unknown function DUF1730  27.71 
 
 
389 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.98716  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0447  domain of unknown function DUF1730  34.18 
 
 
414 aa  54.3  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4582  domain of unknown function DUF1730  33.71 
 
 
385 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4717  putative iron-sulfur cluster binding protein  34.41 
 
 
384 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000105537  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1392  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  34.15 
 
 
376 aa  54.3  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3314  iron-sulfur cluster binding protein  28.06 
 
 
392 aa  54.3  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.117611  normal  0.493581 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>