173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3141 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3141  iron-sulfur cluster-binding protein  100 
 
 		 182 aa  377  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2589  hypothetical protein  32.35 
 
 		 267 aa  89.7  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.11 
 
 		 268 aa  74.7  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.822479  normal  0.0323586 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3394  uncharacterized Fe-S protein  28.57 
 
 		 229 aa  74.3  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.145168  normal  0.150282 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1058  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.43 
 
 		 231 aa  74.3  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.96 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000614225  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.11 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.26 
 
 		 265 aa  64.7  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101767  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0176  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.44 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0030917  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0166  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.18 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0454  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.75 
 
 		 263 aa  61.6  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.41 
 
 		 445 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1581  hypothetical protein  25.65 
 
 		 359 aa  57  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1152  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.32 
 
 		 354 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.592617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00061  hypothetical protein  48.21 
 
 		 314 aa  55.1  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.454167  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2813  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.56 
 
 		 450 aa  54.7  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0357883  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1046  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.55 
 
 		 263 aa  54.7  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10760  iron-sulfur cluster binding protein, putative  50 
 
 		 367 aa  53.9  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00274595  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4821  putative iron-sulfur cluster binding protein  47.54 
 
 		 308 aa  53.9  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0517  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  24 
 
 		 374 aa  53.5  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2568  Fe-S protein-like protein  45 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1629  iron-sulfur cluster binding protein  44.26 
 
 		 312 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1916  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 236 aa  51.6  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  40.35 
 
 		 361 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0891  4Fe-4S cluster binding protein  42.11 
 
 		 363 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0619732  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0007  4Fe-4S cluster binding  43.86 
 
 		 321 aa  49.7  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4033  iron-sulfur cluster binding protein  40.32 
 
 		 306 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.941411 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  40.35 
 
 		 361 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.34 
 
 		 227 aa  49.7  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  40.35 
 
 		 374 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0255  iron-sulfur cluster-binding protein  44.83 
 
 		 320 aa  49.3  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1910  putative iron-sulfur cluster binding protein  25.73 
 
 		 375 aa  49.3  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263925  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1944  putative iron-sulfur cluster binding protein  25.73 
 
 		 375 aa  49.3  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.331429  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2004  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.29 
 
 		 450 aa  49.3  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1104  hypothetical protein  24.19 
 
 		 363 aa  48.5  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0111138  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0582  4Fe-4S cluster binding  40.74 
 
 		 393 aa  48.1  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2833  iron-sulfur cluster-binding protein  37.1 
 
 		 323 aa  48.1  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.74 
 
 		 355 aa  48.1  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3132  hypothetical protein  42.11 
 
 		 363 aa  47.8  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0840  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  28.85 
 
 		 238 aa  47.8  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.283027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4776  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.35 
 
 		 354 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274975  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4900  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  40.35 
 
 		 354 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.705042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3998  domain of unknown function DUF1730  34.72 
 
 		 308 aa  47  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0656648  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1030  iron-sulfur cluster binding protein  42.59 
 
 		 373 aa  47.4  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0665154  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1280  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.29 
 
 		 236 aa  47.4  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.972743  normal  0.606633 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  40.35 
 
 		 354 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3176  hypothetical protein  41.38 
 
 		 380 aa  47.4  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00061  hypothetical protein  42.86 
 
 		 318 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4019  hypothetical protein  35.29 
 
 		 408 aa  47.8  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170373  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.21 
 
 		 357 aa  47.4  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1302  iron-sulfur cluster binding protein, putative  40.35 
 
 		 373 aa  47  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  40.35 
 
 		 354 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0340  4Fe-4S cluster binding protein  43.86 
 
 		 368 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246127  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1081  4Fe-4S cluster binding  42.59 
 
 		 404 aa  46.6  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.66 
 
 		 380 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2662  domain of unknown function DUF1730  38.89 
 
 		 392 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00061  hypothetical protein  41.07 
 
 		 318 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1876  domain of unknown function DUF1730  41.38 
 
 		 314 aa  46.6  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  44.07 
 
 		 354 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2783  hypothetical protein  40.35 
 
 		 347 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2385  hypothetical protein  38.6 
 
 		 349 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1519  iron-sulfur cluster binding protein  40.35 
 
 		 308 aa  46.6  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120266  normal  0.625515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2886  iron-sulfur cluster binding protein  37.1 
 
 		 311 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  39.66 
 
 		 362 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3210  iron-sulfur cluster binding protein  37.1 
 
 		 311 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  39.66 
 
 		 362 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2229  4Fe-4S cluster binding  37.1 
 
 		 324 aa  45.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.212465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0440  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.6 
 
 		 388 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00061  hypothetical protein  42.86 
 
 		 324 aa  45.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4975  domain of unknown function DUF1730  37.04 
 
 		 315 aa  45.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00114037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2064  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.4 
 
 		 229 aa  46.2  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0106474  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0524  putative 4Fe-4S ferredoxin  40.74 
 
 		 405 aa  45.4  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.77669  normal  0.0275938 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0331  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  25.12 
 
 		 491 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00061  hypothetical protein  41.07 
 
 		 321 aa  45.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.374691  hitchhiker  0.000525225 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1785  iron-sulfur cluster binding protein  28.26 
 
 		 366 aa  45.4  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.280211  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2804  hypothetical protein  38.6 
 
 		 348 aa  45.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2784  hypothetical protein  38.6 
 
 		 343 aa  45.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0629  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.6 
 
 		 357 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.619472 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2669  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25 
 
 		 450 aa  45.4  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.848409  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2342  protein of unknown function DUF1730  36.84 
 
 		 356 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.932969 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1143  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur cluster binding protein  38.6 
 
 		 348 aa  45.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0007  hypothetical protein  41.07 
 
 		 314 aa  45.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0530  4Fe-4S cluster binding  37.7 
 
 		 317 aa  45.4  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.347974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0519  4Fe-4S cluster binding  40.74 
 
 		 405 aa  45.1  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0276415  decreased coverage  0.00221689 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1527  putative iron-sulfur cluster-binding protein  25.93 
 
 		 330 aa  45.1  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000239897  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0118  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.84 
 
 		 372 aa  45.4  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.921505  normal  0.832944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5422  domain of unknown function DUF1730  40.35 
 
 		 389 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.98716  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  41.38 
 
 		 359 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0304  iron-sulfur cluster binding protein  38.6 
 
 		 326 aa  45.1  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000115389  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3280  domain of unknown function DUF1730  35.09 
 
 		 404 aa  45.1  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.387433  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3972  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.68 
 
 		 397 aa  45.1  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2817  iron-sulfur cluster binding protein  40.74 
 
 		 385 aa  45.1  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309396  normal  0.804371 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1392  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  25.71 
 
 		 376 aa  44.7  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2411  iron-sulfur cluster binding protein  40.74 
 
 		 383 aa  44.7  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1890  iron-sulfur cluster binding protein  40.38 
 
 		 312 aa  44.7  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1320  putative iron-sulfur cluster binding protein  25.93 
 
 		 330 aa  44.7  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000383466  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2044  hypothetical protein  23.44 
 
 		 330 aa  44.3  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.281563  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0221  hypothetical protein  37.93 
 
 		 325 aa  44.3  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0434  iron-sulfur cluster-binding protein  26.47 
 
 		 314 aa  43.9  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2991  iron-sulfur cluster binding protein  34.04 
 
 		 398 aa  44.3  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0787505 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>