More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3394 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3394  uncharacterized Fe-S protein  100 
 
 
229 aa  474  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.145168  normal  0.150282 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1058  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  73.99 
 
 
231 aa  358  4e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  53.78 
 
 
226 aa  273  2.0000000000000002e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0454  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.67 
 
 
263 aa  105  6e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.46 
 
 
268 aa  102  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.822479  normal  0.0323586 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0199  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.58 
 
 
243 aa  97.1  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.342722  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.12 
 
 
233 aa  90.9  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000614225  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1046  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.8 
 
 
263 aa  89.7  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.31 
 
 
265 aa  88.6  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101767  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0271  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.64 
 
 
238 aa  88.6  8e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0098  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.8 
 
 
247 aa  87.8  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0190566 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1280  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.89 
 
 
236 aa  84  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.972743  normal  0.606633 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0166  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.81 
 
 
226 aa  82  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0176  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.58 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0030917  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.05 
 
 
227 aa  79  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1916  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
236 aa  75.5  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2064  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.73 
 
 
229 aa  74.7  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0106474  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3141  iron-sulfur cluster-binding protein  28.57 
 
 
182 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0583  hypothetical protein  28.57 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.159382  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0137  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.05 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2568  Fe-S protein-like protein  31.14 
 
 
220 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2870  reductive dehalogenase  36.07 
 
 
514 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0453791  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2872  reductive dehalogenase  36.07 
 
 
514 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.111424  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1152  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.57 
 
 
354 aa  68.6  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.592617  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02610  hypothetical protein  27.12 
 
 
275 aa  67  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144951  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  31.18 
 
 
474 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0331  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  31.58 
 
 
491 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0343  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  26.39 
 
 
484 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0514  iron-sulfur cluster-binding protein  23.83 
 
 
380 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0545  iron-sulfur cluster-binding protein  23.83 
 
 
380 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00111549  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1968  reductive dehalogenase  27.14 
 
 
399 aa  66.2  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.821094  normal  0.460125 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0600  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  23.83 
 
 
380 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0245724  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0457  hypothetical protein  23.83 
 
 
380 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00117546  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0453  hypothetical protein  23.83 
 
 
380 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2589  hypothetical protein  28.57 
 
 
267 aa  65.5  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0621  putative iron-sulfur cluster-binding protein  23.83 
 
 
380 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0546  putative iron-sulfur cluster-binding protein  23.83 
 
 
380 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9308099999999996e-42 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0460  putative iron-sulfur cluster binding protein  23.83 
 
 
380 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4756  putative iron-sulfur cluster-binding protein  23.83 
 
 
380 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0149452  hitchhiker  2.27135e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0582  putative iron-sulfur cluster-binding protein  23.83 
 
 
380 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0468  putative iron-sulfur cluster binding protein  24.77 
 
 
380 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.385519  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0711  reductive dehalogenase  27.09 
 
 
488 aa  63.5  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.189708  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0503  iron-sulfur cluster binding protein  29.41 
 
 
389 aa  62  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2103  hypothetical protein  33.94 
 
 
507 aa  61.6  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66471  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0696  reductive dehalogenase  30.67 
 
 
550 aa  61.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000940573  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0840  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  26.98 
 
 
238 aa  61.6  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.283027  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1333  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.94 
 
 
259 aa  61.6  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000162101 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1368  iron-sulfur cluster binding protein  27.73 
 
 
380 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0689  reductive dehalogenase  27.38 
 
 
463 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1581  hypothetical protein  25.98 
 
 
359 aa  60.1  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3974  reductive dehalogenase  38.14 
 
 
1069 aa  59.3  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4019  hypothetical protein  25.63 
 
 
408 aa  59.3  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170373  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2100  tetrachloroethene dehalogenase  28.64 
 
 
474 aa  58.9  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2620  reductive dehalogenase  24.76 
 
 
345 aa  58.9  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3280  domain of unknown function DUF1730  32.5 
 
 
404 aa  58.9  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.387433  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0599  hypothetical protein  35.07 
 
 
247 aa  58.9  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1629  iron-sulfur cluster binding protein  29.31 
 
 
312 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103841  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0329  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  24.84 
 
 
640 aa  58.9  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.48075  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3578  reductive dehalogenase  37.11 
 
 
1070 aa  58.5  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.960062  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1729  tetrachloroethene dehalogenase  28.64 
 
 
472 aa  58.2  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000209595 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1271  4Fe-4S cluster binding  33.04 
 
 
374 aa  58.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1876  domain of unknown function DUF1730  35.83 
 
 
314 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5422  domain of unknown function DUF1730  31.3 
 
 
389 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.98716  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0658  hypothetical protein  40.48 
 
 
320 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0693  reductive dehalogenase  30.17 
 
 
352 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1392  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  27.12 
 
 
376 aa  56.2  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0473  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.88 
 
 
261 aa  56.2  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.915139  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3176  hypothetical protein  32.17 
 
 
380 aa  56.2  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1699  domain of unknown function DUF1730  32.23 
 
 
318 aa  55.8  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0752  domain of unknown function DUF1730  26.09 
 
 
383 aa  55.8  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2833  iron-sulfur cluster-binding protein  28.81 
 
 
323 aa  55.5  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0434  iron-sulfur cluster-binding protein  27.01 
 
 
314 aa  55.5  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1423  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.67 
 
 
262 aa  55.5  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1081  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.74 
 
 
290 aa  55.5  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4033  iron-sulfur cluster binding protein  30.71 
 
 
306 aa  55.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.941411 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0713  reductive dehalogenase  24.69 
 
 
458 aa  55.1  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0341  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  23.64 
 
 
640 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0353  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  23.64 
 
 
640 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.200551  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05220  uncharacterized Fe-S protein  35.94 
 
 
277 aa  54.7  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1171  reductive dehalogenase, putative  28.98 
 
 
532 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0464828  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1404  iron-sulfur cluster-binding protein  33.33 
 
 
308 aa  53.5  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0258  iron-sulfur cluster-binding protein  29.75 
 
 
273 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1360  reductive dehalogenase  28.98 
 
 
532 aa  53.5  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1302  iron-sulfur cluster binding protein, putative  28.44 
 
 
373 aa  53.1  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1298  hypothetical protein  29.73 
 
 
380 aa  53.5  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000112138  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0507  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.57 
 
 
386 aa  53.1  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1627  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.83 
 
 
233 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.717402  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2004  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.68 
 
 
450 aa  52.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2541  putative iron-sulfur 4Fe-4S ferredoxin protein  34.57 
 
 
360 aa  52.4  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1435  hypothetical protein  27.27 
 
 
265 aa  52.4  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.15136  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1496  hypothetical protein  29.45 
 
 
218 aa  52.4  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11041  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2229  4Fe-4S cluster binding  27.97 
 
 
324 aa  52  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.212465  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2783  hypothetical protein  30.43 
 
 
347 aa  52  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314535  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  32.14 
 
 
362 aa  52  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.82 
 
 
445 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1944  putative iron-sulfur cluster binding protein  27.12 
 
 
375 aa  52  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.331429  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00414  iron-sulfur cluster binding protein, putative  24.58 
 
 
355 aa  52  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0243  iron-sulfur cluster-binding protein  31.63 
 
 
275 aa  52  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00409826 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1910  putative iron-sulfur cluster binding protein  27.12 
 
 
375 aa  52  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263925  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0553  hypothetical protein  26 
 
 
218 aa  51.6  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>