234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2620 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2620  reductive dehalogenase  100 
 
 
345 aa  725    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2103  hypothetical protein  37.85 
 
 
507 aa  225  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66471  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1171  reductive dehalogenase, putative  33.12 
 
 
532 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0464828  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1360  reductive dehalogenase  33.77 
 
 
532 aa  197  3e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0988  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.45 
 
 
532 aa  194  2e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1968  reductive dehalogenase  30.53 
 
 
399 aa  126  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.821094  normal  0.460125 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0713  reductive dehalogenase  30.74 
 
 
458 aa  126  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0693  reductive dehalogenase  28.72 
 
 
352 aa  122  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0737  reductive dehalogenase  34.25 
 
 
445 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0132568  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1559  reductive dehalogenase, putative  30.54 
 
 
482 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.206091  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0711  reductive dehalogenase  31.54 
 
 
488 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.189708  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1729  tetrachloroethene dehalogenase  30.11 
 
 
472 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000209595 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0341  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  31.4 
 
 
640 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0353  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  31.4 
 
 
640 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.200551  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2100  tetrachloroethene dehalogenase  31.25 
 
 
474 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0329  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  29.44 
 
 
640 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.48075  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4120  hypothetical protein  28.89 
 
 
489 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00634153  normal  0.015035 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1349  reductive dehalogenase  36.16 
 
 
461 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0343  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  25 
 
 
484 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0696  reductive dehalogenase  27.08 
 
 
550 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000940573  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0689  reductive dehalogenase  30.38 
 
 
463 aa  105  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0079  trichloroethene reductive dehalogenase  35.16 
 
 
554 aa  104  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00164109  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3974  reductive dehalogenase  31.93 
 
 
1069 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  24.71 
 
 
474 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0180  reductive dehalogenase, putative  29.57 
 
 
455 aa  104  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_169  reductive dehalogenase  29.57 
 
 
455 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.764081  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0173  reductive dehalogenase  30 
 
 
455 aa  104  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3769  hypothetical protein  27.57 
 
 
468 aa  103  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2872  reductive dehalogenase  25.85 
 
 
514 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.111424  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2870  reductive dehalogenase  25.85 
 
 
514 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0453791  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0331  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  24.66 
 
 
491 aa  99.4  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_82  reductive dehalogenase  29.77 
 
 
474 aa  98.2  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1324  reductive dehalogenase  28.9 
 
 
493 aa  93.6  5e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0687887  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_96  reductive dehalogenase  28.93 
 
 
496 aa  92.8  8e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1336  reductive dehalogenase  28.93 
 
 
496 aa  92.8  8e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0284  reductive dehalogenase  28.93 
 
 
496 aa  92.8  8e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3578  reductive dehalogenase  29.41 
 
 
1070 aa  92  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.960062  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1340  reductive dehalogenase  29.48 
 
 
480 aa  92  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1260  reductive dehalogenase  28.8 
 
 
509 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1427  reductive dehalogenase  28.8 
 
 
496 aa  90.9  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0302  reductive dehalogenase, putative  26.85 
 
 
514 aa  90.1  5e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0924005  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0104  reductive dehalogenase  34.12 
 
 
515 aa  90.1  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1344  reductive dehalogenase  34.05 
 
 
488 aa  89.4  8e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1387  reductive dehalogenase  34.03 
 
 
491 aa  88.2  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.54917  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1421  reductive dehalogenase  27.24 
 
 
475 aa  87.8  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0311  reductive dehalogenase, putative  34.12 
 
 
515 aa  87  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0112  reductive dehalogenase  34.13 
 
 
506 aa  87  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1353  reductive dehalogenase  26.85 
 
 
514 aa  86.7  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0121  reductive dehalogenase  25.93 
 
 
514 aa  86.7  6e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1314  reductive dehalogenase  27.55 
 
 
481 aa  86.3  7e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1329  reductive dehalogenase  30.23 
 
 
473 aa  85.5  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0306  reductive dehalogenase, putative  28.95 
 
 
505 aa  84.3  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00204473  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_88  reductive dehalogenase  30.09 
 
 
512 aa  84  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1263  reductive dehalogenase  32.09 
 
 
497 aa  83.6  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0281  reductive dehalogenase  32.43 
 
 
470 aa  83.2  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0296  reductive dehalogenase  29.65 
 
 
512 aa  83.2  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0794176  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1535  reductive dehalogenase, putative  30.37 
 
 
494 aa  82.8  0.000000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0185962  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0276  reductive dehalogenase  29.68 
 
 
523 aa  82.8  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1436  reductive dehalogenase  28.76 
 
 
523 aa  82.4  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_104  reductive dehalogenase  27.55 
 
 
523 aa  82.4  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_99  reductive dehalogenase  31 
 
 
470 aa  82  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0318  reductive dehalogenase, putative  31.8 
 
 
495 aa  81.6  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.82363  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1522  reductive dehalogenase, putative  31.71 
 
 
507 aa  81.6  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.664066  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1347  reductive dehalogenase  24.81 
 
 
429 aa  80.9  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1291  vinyl chloride reductive dehalogenase  33.54 
 
 
519 aa  80.9  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1316  reductive dehalogenase  29.32 
 
 
494 aa  80.9  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1538  reductive dehalogenase, putative  27.64 
 
 
492 aa  80.1  0.00000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.308887  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1545  reductive dehalogenase, putative  28.26 
 
 
500 aa  79.7  0.00000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1399  reductive dehalogenase  30.26 
 
 
494 aa  79.7  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0618677  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0847  reductive dehalogenase  27.69 
 
 
516 aa  78.6  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1393  reductive dehalogenase  29.29 
 
 
495 aa  77.8  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00328103  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1320  reductive dehalogenase  29.95 
 
 
509 aa  76.3  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1308  reductive dehalogenase  33.82 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1528  reductive dehalogenase, putative  28.98 
 
 
469 aa  75.1  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.636917  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1430  reductive dehalogenase  24.32 
 
 
492 aa  75.9  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1371  reductive dehalogenase  26.33 
 
 
505 aa  75.9  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1342  reductive dehalogenase  29.45 
 
 
473 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1364  reductive dehalogenase  29.03 
 
 
518 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0876  reductive dehalogenase, putative  24.11 
 
 
510 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.177849  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1402  reductive dehalogenase  29.77 
 
 
499 aa  71.6  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00204674  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1378  reductive dehalogenase  29.61 
 
 
508 aa  71.6  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1327  reductive dehalogenase  25.08 
 
 
499 aa  70.5  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1383  reductive dehalogenase  31.95 
 
 
505 aa  70.1  0.00000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0088  reductive dehalogenase domain-containing protein  31.94 
 
 
153 aa  68.9  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0721794  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0119  reductive dehalogenase  26.42 
 
 
480 aa  66.6  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0173  reductive dehalogenase, putative  26.59 
 
 
510 aa  66.2  0.0000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1375  reductive dehalogenase  28.98 
 
 
505 aa  65.1  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0235  reductive dehalogenase, putative  30.25 
 
 
490 aa  63.5  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0503  iron-sulfur cluster binding protein  28.31 
 
 
389 aa  63.2  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1046  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.51 
 
 
263 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1519  reductive dehalogenase, putative  27.01 
 
 
505 aa  61.6  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.639229  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0440  domain of unknown function DUF1730  28.8 
 
 
353 aa  61.6  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00797528  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1368  iron-sulfur cluster binding protein  28.67 
 
 
380 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.53 
 
 
233 aa  61.2  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000614225  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.78 
 
 
226 aa  60.1  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1392  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  24.85 
 
 
376 aa  60.1  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0517  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  29.03 
 
 
374 aa  60.1  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0468  putative iron-sulfur cluster binding protein  29.6 
 
 
380 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.385519  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3394  uncharacterized Fe-S protein  24.76 
 
 
229 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.145168  normal  0.150282 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1104  hypothetical protein  29.73 
 
 
363 aa  58.5  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0111138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>