174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0713 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0713  reductive dehalogenase  100 
 
 
458 aa  968    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0689  reductive dehalogenase  63.38 
 
 
463 aa  580  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0737  reductive dehalogenase  60.63 
 
 
445 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0132568  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0711  reductive dehalogenase  61.4 
 
 
488 aa  567  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.189708  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3578  reductive dehalogenase  39.93 
 
 
1070 aa  205  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.960062  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3974  reductive dehalogenase  41.52 
 
 
1069 aa  201  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_169  reductive dehalogenase  31.28 
 
 
455 aa  169  8e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.764081  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0180  reductive dehalogenase, putative  31.06 
 
 
455 aa  167  5e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0173  reductive dehalogenase  31.06 
 
 
455 aa  163  6e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1349  reductive dehalogenase  28.6 
 
 
461 aa  161  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  41.81 
 
 
474 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0343  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  41.24 
 
 
484 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2620  reductive dehalogenase  30.74 
 
 
345 aa  126  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0331  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  28.53 
 
 
491 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0341  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  26.7 
 
 
640 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0329  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  30.74 
 
 
640 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.48075  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0353  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  26.7 
 
 
640 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.200551  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2100  tetrachloroethene dehalogenase  31.65 
 
 
474 aa  121  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0693  reductive dehalogenase  28.79 
 
 
352 aa  121  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1360  reductive dehalogenase  31.87 
 
 
532 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1171  reductive dehalogenase, putative  31.47 
 
 
532 aa  120  6e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0464828  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1729  tetrachloroethene dehalogenase  32.08 
 
 
472 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000209595 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3769  hypothetical protein  32.67 
 
 
468 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0696  reductive dehalogenase  33.33 
 
 
550 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000940573  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0988  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.47 
 
 
532 aa  116  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2872  reductive dehalogenase  32.91 
 
 
514 aa  114  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.111424  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2870  reductive dehalogenase  32.91 
 
 
514 aa  113  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0453791  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2103  hypothetical protein  31.47 
 
 
507 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66471  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1968  reductive dehalogenase  29.29 
 
 
399 aa  107  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.821094  normal  0.460125 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1340  reductive dehalogenase  27.01 
 
 
480 aa  107  6e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1353  reductive dehalogenase  27.18 
 
 
514 aa  106  7e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0121  reductive dehalogenase  26.86 
 
 
514 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0302  reductive dehalogenase, putative  26.77 
 
 
514 aa  105  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0924005  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0276  reductive dehalogenase  30.34 
 
 
523 aa  105  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_104  reductive dehalogenase  30.19 
 
 
523 aa  103  6e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1344  reductive dehalogenase  28.04 
 
 
488 aa  96.3  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1421  reductive dehalogenase  25.82 
 
 
475 aa  95.9  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0296  reductive dehalogenase  30.92 
 
 
512 aa  95.5  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0794176  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_88  reductive dehalogenase  30.43 
 
 
512 aa  94.7  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1538  reductive dehalogenase, putative  30.05 
 
 
492 aa  94.4  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.308887  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4120  hypothetical protein  28.79 
 
 
489 aa  94.4  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00634153  normal  0.015035 
 
 
-
 
NC_002936  DET0173  reductive dehalogenase, putative  24.79 
 
 
510 aa  92.8  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0112  reductive dehalogenase  26.47 
 
 
506 aa  92.4  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1314  reductive dehalogenase  25.73 
 
 
481 aa  92.8  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1430  reductive dehalogenase  28.63 
 
 
492 aa  91.3  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1387  reductive dehalogenase  29.28 
 
 
491 aa  91.7  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.54917  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1522  reductive dehalogenase, putative  28.91 
 
 
507 aa  90.5  5e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.664066  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1263  reductive dehalogenase  24.51 
 
 
497 aa  89.4  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1427  reductive dehalogenase  31.79 
 
 
496 aa  89.7  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1260  reductive dehalogenase  31.79 
 
 
509 aa  89.7  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1535  reductive dehalogenase, putative  23.73 
 
 
494 aa  88.6  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0185962  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1327  reductive dehalogenase  25.32 
 
 
499 aa  89  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1329  reductive dehalogenase  27.94 
 
 
473 aa  88.6  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0318  reductive dehalogenase, putative  28.75 
 
 
495 aa  87.8  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.82363  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_82  reductive dehalogenase  25.4 
 
 
474 aa  87.8  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0876  reductive dehalogenase, putative  27.52 
 
 
510 aa  87.4  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.177849  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1399  reductive dehalogenase  22.71 
 
 
494 aa  86.7  7e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0618677  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0079  trichloroethene reductive dehalogenase  29.74 
 
 
554 aa  86.7  9e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00164109  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0306  reductive dehalogenase, putative  29.33 
 
 
505 aa  86.3  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00204473  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1559  reductive dehalogenase, putative  27.19 
 
 
482 aa  84.7  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.206091  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1324  reductive dehalogenase  22.37 
 
 
493 aa  84.7  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0687887  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1316  reductive dehalogenase  22.03 
 
 
494 aa  84.7  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1402  reductive dehalogenase  25.09 
 
 
499 aa  84.3  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00204674  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1378  reductive dehalogenase  26.52 
 
 
508 aa  84  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1371  reductive dehalogenase  28.52 
 
 
505 aa  83.6  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0284  reductive dehalogenase  26.11 
 
 
496 aa  82.8  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1336  reductive dehalogenase  26.27 
 
 
496 aa  82  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_96  reductive dehalogenase  26.27 
 
 
496 aa  82  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1393  reductive dehalogenase  28.33 
 
 
495 aa  82.4  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00328103  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1545  reductive dehalogenase, putative  24.62 
 
 
500 aa  80.9  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1291  vinyl chloride reductive dehalogenase  27.31 
 
 
519 aa  79  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0311  reductive dehalogenase, putative  25 
 
 
515 aa  78.2  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1519  reductive dehalogenase, putative  28.25 
 
 
505 aa  77.8  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.639229  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1375  reductive dehalogenase  28.21 
 
 
505 aa  78.2  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0104  reductive dehalogenase  24.39 
 
 
515 aa  78.2  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1528  reductive dehalogenase, putative  28.23 
 
 
469 aa  77.8  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.636917  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1364  reductive dehalogenase  29.91 
 
 
518 aa  76.6  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1436  reductive dehalogenase  23.66 
 
 
523 aa  76.3  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0119  reductive dehalogenase  21.05 
 
 
480 aa  73.6  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1320  reductive dehalogenase  25.52 
 
 
509 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1308  reductive dehalogenase  31.47 
 
 
149 aa  70.9  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1383  reductive dehalogenase  24.47 
 
 
505 aa  70.1  0.00000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0235  reductive dehalogenase, putative  25.51 
 
 
490 aa  67.8  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0847  reductive dehalogenase  26.73 
 
 
516 aa  65.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1342  reductive dehalogenase  23.03 
 
 
473 aa  64.3  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1347  reductive dehalogenase  23.01 
 
 
429 aa  63.5  0.000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0088  reductive dehalogenase domain-containing protein  28.46 
 
 
153 aa  61.6  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0721794  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0281  reductive dehalogenase  26.89 
 
 
470 aa  61.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_99  reductive dehalogenase  27.49 
 
 
470 aa  58.9  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1046  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.81 
 
 
263 aa  58.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3394  uncharacterized Fe-S protein  24.69 
 
 
229 aa  55.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.145168  normal  0.150282 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1520  4Fe-4S ferredoxin protein  27.55 
 
 
438 aa  54.7  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0107493  normal  0.24299 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0117  hypothetical protein  33.33 
 
 
105 aa  53.1  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.45 
 
 
233 aa  53.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000614225  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1404  iron-sulfur cluster-binding protein  25.95 
 
 
308 aa  52  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0830  putative iron-sulfur cluster binding protein  27.74 
 
 
428 aa  51.2  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0166  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.09 
 
 
226 aa  51.6  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0440  domain of unknown function DUF1730  31.86 
 
 
353 aa  51.6  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00797528  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3998  domain of unknown function DUF1730  30.09 
 
 
308 aa  50.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0656648  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1058  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.43 
 
 
231 aa  50.1  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>