246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0176 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0176  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
282 aa  590  1e-168  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0030917  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0454  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.75 
 
 
263 aa  91.7  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2589  hypothetical protein  29.41 
 
 
267 aa  91.7  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.93 
 
 
268 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.822479  normal  0.0323586 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.27 
 
 
265 aa  82.4  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101767  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3394  uncharacterized Fe-S protein  29.58 
 
 
229 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.145168  normal  0.150282 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1152  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.11 
 
 
354 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.592617  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.81 
 
 
233 aa  75.5  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000614225  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1058  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.73 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0098  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.48 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0190566 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1627  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.36 
 
 
233 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.717402  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10760  iron-sulfur cluster binding protein, putative  31.93 
 
 
367 aa  70.5  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00274595  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.67 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0137  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.43 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4256  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  25.28 
 
 
344 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4342  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.28 
 
 
344 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.298178  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4635  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.28 
 
 
344 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.183836  normal  0.857379 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1968  reductive dehalogenase  31.13 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.821094  normal  0.460125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.79 
 
 
343 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.418818  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2669  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.22 
 
 
450 aa  67  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.848409  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2004  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.05 
 
 
450 aa  66.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0271  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.49 
 
 
238 aa  65.9  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0840  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  32.64 
 
 
238 aa  65.5  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.283027  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1916  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.78 
 
 
236 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1280  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  24.1 
 
 
236 aa  63.2  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.972743  normal  0.606633 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1271  4Fe-4S cluster binding  28.86 
 
 
374 aa  63.5  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0693  reductive dehalogenase  38.82 
 
 
352 aa  63.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1046  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.26 
 
 
263 aa  63.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3141  iron-sulfur cluster-binding protein  24.44 
 
 
182 aa  63.2  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2103  hypothetical protein  38.3 
 
 
507 aa  62.8  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66471  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.84 
 
 
445 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2064  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.37 
 
 
229 aa  62  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0106474  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2997  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.03 
 
 
442 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1404  iron-sulfur cluster-binding protein  25.1 
 
 
308 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1171  reductive dehalogenase, putative  31.97 
 
 
532 aa  60.5  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0464828  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  28.95 
 
 
357 aa  60.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1360  reductive dehalogenase  31.97 
 
 
532 aa  60.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0166  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  22.27 
 
 
226 aa  60.1  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.95 
 
 
227 aa  59.3  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.63 
 
 
362 aa  59.3  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1876  domain of unknown function DUF1730  35.63 
 
 
314 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  30.08 
 
 
354 aa  58.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2568  Fe-S protein-like protein  26.9 
 
 
220 aa  57.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1081  4Fe-4S cluster binding  37.63 
 
 
404 aa  57.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0503  iron-sulfur cluster binding protein  33.02 
 
 
389 aa  57  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1368  iron-sulfur cluster binding protein  39.53 
 
 
380 aa  57  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0988  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.5 
 
 
532 aa  57  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1382  hypothetical protein  27.33 
 
 
257 aa  56.2  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0599  hypothetical protein  25.53 
 
 
247 aa  55.8  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1581  hypothetical protein  24.48 
 
 
359 aa  55.8  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0460  putative iron-sulfur cluster binding protein  28.87 
 
 
380 aa  55.8  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0199  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.69 
 
 
243 aa  55.5  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.342722  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0658  hypothetical protein  34.48 
 
 
320 aa  55.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1333  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.86 
 
 
259 aa  55.8  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000162101 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2782  putative ferredoxin, 4Fe-4S binding protein  34.41 
 
 
372 aa  55.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0468  putative iron-sulfur cluster binding protein  27.95 
 
 
380 aa  55.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.385519  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1699  domain of unknown function DUF1730  28.28 
 
 
318 aa  55.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0600  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  28.74 
 
 
380 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0245724  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  33.33 
 
 
362 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0457  hypothetical protein  28.74 
 
 
380 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00117546  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0453  hypothetical protein  28.74 
 
 
380 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  33.33 
 
 
362 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0621  putative iron-sulfur cluster-binding protein  28.74 
 
 
380 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0546  putative iron-sulfur cluster-binding protein  28.74 
 
 
380 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9308099999999996e-42 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  33.33 
 
 
361 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0752  domain of unknown function DUF1730  25 
 
 
383 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0582  putative iron-sulfur cluster-binding protein  28.74 
 
 
380 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2620  reductive dehalogenase  33.33 
 
 
345 aa  53.9  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  33.33 
 
 
361 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4756  putative iron-sulfur cluster-binding protein  28.74 
 
 
380 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0149452  hitchhiker  2.27135e-16 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2813  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  21.74 
 
 
450 aa  53.5  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0357883  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0514  iron-sulfur cluster-binding protein  30.95 
 
 
380 aa  53.1  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  32.29 
 
 
359 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0255  iron-sulfur cluster-binding protein  33.33 
 
 
320 aa  53.1  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0545  iron-sulfur cluster-binding protein  30.95 
 
 
380 aa  53.1  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00111549  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00099  iron-sulfur cluster-binding protein  33.33 
 
 
375 aa  53.1  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1362  domain of unknown function DUF1730  35.05 
 
 
385 aa  52.4  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.245497  hitchhiker  0.0074911 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0486  iron-sulfur cluster binding protein  34.04 
 
 
379 aa  52.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0507  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.37 
 
 
386 aa  52.4  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002253  iron-sulfur cluster-binding protein  33.33 
 
 
375 aa  52.4  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000253209  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2753  iron-sulfur cluster-binding protein  26.85 
 
 
369 aa  52.4  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006724  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04033  predicted Fe-S electron transport protein  35.11 
 
 
379 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000233876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3827  iron-sulfur cluster binding protein  35.11 
 
 
379 aa  52  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294328  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3847  iron-sulfur cluster binding protein  35.11 
 
 
379 aa  52  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000133072  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4697  iron-sulfur cluster binding protein  35.11 
 
 
379 aa  52  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4409  iron-sulfur cluster binding protein  35.11 
 
 
379 aa  52  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.448649999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0331  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  35.94 
 
 
491 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5682  iron-sulfur cluster binding protein  35.11 
 
 
379 aa  52  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000046188  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03995  hypothetical protein  35.11 
 
 
379 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000106432  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0343  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  35.94 
 
 
484 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4723  iron-sulfur cluster binding protein  35.11 
 
 
379 aa  52  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626886  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1748  domain of unknown function DUF1730  34 
 
 
335 aa  51.6  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  35.94 
 
 
474 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1722  hypothetical protein  28.26 
 
 
261 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2673  tRNA pseudouridine synthase B  33.33 
 
 
369 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1379  4Fe-4S cluster binding  37.23 
 
 
355 aa  51.2  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0891  4Fe-4S cluster binding protein  36.08 
 
 
363 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0619732  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2870  reductive dehalogenase  36.92 
 
 
514 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0453791  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1423  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.43 
 
 
262 aa  50.8  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2872  reductive dehalogenase  36.92 
 
 
514 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.111424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>