272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1699 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1699  domain of unknown function DUF1730  100 
 
 
318 aa  661    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1876  domain of unknown function DUF1730  56.48 
 
 
314 aa  361  1e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1748  domain of unknown function DUF1730  52.26 
 
 
335 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0434  iron-sulfur cluster-binding protein  50.99 
 
 
314 aa  302  5.000000000000001e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0658  hypothetical protein  50.5 
 
 
320 aa  298  1e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2257  domain of unknown function DUF1730  48.06 
 
 
324 aa  293  2e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.340392  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0255  iron-sulfur cluster-binding protein  46.03 
 
 
320 aa  272  6e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0472  iron-sulfur cluster binding protein, putative  40.33 
 
 
331 aa  223  2e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0304  iron-sulfur cluster binding protein  39 
 
 
326 aa  216  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000115389  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1890  iron-sulfur cluster binding protein  38.41 
 
 
312 aa  214  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0372  iron-sulfur cluster binding protein  36.07 
 
 
314 aa  201  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1519  iron-sulfur cluster binding protein  36.69 
 
 
308 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120266  normal  0.625515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3998  domain of unknown function DUF1730  33.99 
 
 
308 aa  195  8.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0656648  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1644  hypothetical protein  35.02 
 
 
308 aa  194  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107937  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01260  putative iron-sulfur cluster-binding protein  35.59 
 
 
309 aa  194  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4975  domain of unknown function DUF1730  34.09 
 
 
315 aa  193  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00114037  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2783  hypothetical protein  38.33 
 
 
347 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314535  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2853  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  37.84 
 
 
343 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2940  domain of unknown function DUF1730  38.18 
 
 
343 aa  182  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.271755  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  35.95 
 
 
361 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0752  domain of unknown function DUF1730  38.34 
 
 
383 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1520  4Fe-4S ferredoxin protein  37.34 
 
 
438 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0107493  normal  0.24299 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  35.81 
 
 
361 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3034  domain of unknown function DUF1730  37.84 
 
 
345 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.125913  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2817  iron-sulfur cluster binding protein  35.91 
 
 
385 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309396  normal  0.804371 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1081  4Fe-4S cluster binding  33.65 
 
 
404 aa  178  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2411  iron-sulfur cluster binding protein  35.47 
 
 
383 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400236  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3972  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.58 
 
 
397 aa  177  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  35.35 
 
 
362 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04033  predicted Fe-S electron transport protein  35.67 
 
 
379 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000233876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3827  iron-sulfur cluster binding protein  35.67 
 
 
379 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294328  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4409  iron-sulfur cluster binding protein  35.67 
 
 
379 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.448649999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03995  hypothetical protein  35.67 
 
 
379 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000106432  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4697  iron-sulfur cluster binding protein  35.67 
 
 
379 aa  174  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3847  iron-sulfur cluster binding protein  35.67 
 
 
379 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000133072  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4723  iron-sulfur cluster binding protein  35.67 
 
 
379 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626886  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2541  putative iron-sulfur 4Fe-4S ferredoxin protein  35.51 
 
 
360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  35.03 
 
 
362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  35.44 
 
 
374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3244  putative iron-sulfur cluster binding protein  34.29 
 
 
386 aa  173  3.9999999999999995e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2530  4Fe-4S cluster binding  35.46 
 
 
385 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0529  iron-sulfur cluster binding protein  36.28 
 
 
379 aa  172  6.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.465139  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1379  4Fe-4S cluster binding  35.5 
 
 
355 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5682  iron-sulfur cluster binding protein  35.67 
 
 
379 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000046188  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  35.16 
 
 
354 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3728  iron-sulfur cluster binding protein  35.91 
 
 
379 aa  172  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0217  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.45 
 
 
349 aa  171  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0425  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.03 
 
 
379 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000030316  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0319  iron-sulfur cluster-binding protein  34.14 
 
 
398 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.251377  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  33.87 
 
 
359 aa  170  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4637  iron-sulfur cluster binding protein  35.35 
 
 
379 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000171021  normal  0.0426509 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0279  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.44 
 
 
375 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0629  putative iron-sulfur cluster binding protein  34.52 
 
 
357 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.619472 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3925  iron-sulfur cluster binding protein  35.4 
 
 
379 aa  170  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00310532  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0486  iron-sulfur cluster binding protein  35.03 
 
 
379 aa  170  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4753  putative iron-sulfur cluster binding protein  34.71 
 
 
384 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00412785  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4624  putative iron-sulfur cluster binding protein  34.71 
 
 
384 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000999766  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4634  putative iron-sulfur cluster binding protein  34.71 
 
 
384 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000341327  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1785  iron-sulfur cluster binding protein  35.9 
 
 
366 aa  169  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.280211  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0200  hypothetical protein  33.11 
 
 
383 aa  169  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4717  putative iron-sulfur cluster binding protein  34.71 
 
 
384 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000105537  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4774  putative iron-sulfur cluster binding protein  34.71 
 
 
384 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0366705  normal  0.043554 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  33.12 
 
 
393 aa  168  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0597  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.02 
 
 
364 aa  168  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3280  domain of unknown function DUF1730  35.17 
 
 
404 aa  167  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.387433  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1978  hypothetical protein  34.7 
 
 
397 aa  167  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3176  hypothetical protein  34.08 
 
 
380 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1342  hypothetical protein  35.57 
 
 
353 aa  167  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.185892  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0349  putative iron-sulfur cluster binding protein  33.87 
 
 
379 aa  166  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000159146  unclonable  0.00000283659 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4582  domain of unknown function DUF1730  33.12 
 
 
385 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2753  iron-sulfur cluster-binding protein  35.35 
 
 
369 aa  166  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006724  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4319  domain of unknown function DUF1730  32.69 
 
 
383 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00643  putative 4Fe-4S binding protein  33.44 
 
 
380 aa  166  5e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2673  tRNA pseudouridine synthase B  31.78 
 
 
369 aa  166  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00414  iron-sulfur cluster binding protein, putative  34.1 
 
 
355 aa  166  5e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3210  iron-sulfur cluster binding protein  31.97 
 
 
311 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4033  iron-sulfur cluster binding protein  34.62 
 
 
306 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.941411 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  34.52 
 
 
354 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2229  4Fe-4S cluster binding  33.12 
 
 
324 aa  165  8e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.212465  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0440  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.05 
 
 
388 aa  165  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2758  iron-sulfur cluster binding protein  33.44 
 
 
356 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.620502  normal  0.744246 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0367  iron-sulfur cluster binding protein, putative  33.43 
 
 
409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3051  4Fe-4S cluster binding  36.36 
 
 
354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0909  putative iron-sulfur cluster-binding protein  33.43 
 
 
409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1066  iron-sulfur cluster-binding protein  33.43 
 
 
409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.457692  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0116  putative iron-sulfur cluster binding protein  33.43 
 
 
409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0724  iron-sulfur cluster binding protein, putative  33.43 
 
 
409 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602669  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.56 
 
 
355 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2833  iron-sulfur cluster-binding protein  31.68 
 
 
323 aa  165  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00061  hypothetical protein  31.75 
 
 
312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0891  4Fe-4S cluster binding protein  34.91 
 
 
363 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0619732  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1139  domain of unknown function DUF1730  34.94 
 
 
365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.313018 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2502  putative iron-sulfur cluster binding protein  33.43 
 
 
409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.884061  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0667  putative iron-sulfur cluster binding protein  33.43 
 
 
409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0912  putative iron-sulfur cluster-binding protein  33.43 
 
 
409 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.835017  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1030  iron-sulfur cluster binding protein  36.69 
 
 
373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0665154  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5422  domain of unknown function DUF1730  32.69 
 
 
389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.98716  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1627  hypothetical protein  32.29 
 
 
387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2290  hypothetical protein  34.17 
 
 
347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0440  domain of unknown function DUF1730  34.22 
 
 
353 aa  163  3e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00797528  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>